pairwiseAlign.h
上传用户:szpanda
上传日期:2016-03-09
资源大小:9k
文件大小:1k
源码类别:

DNA

开发平台:

C/C++

  1. /* File: pairwiseAlign.h                   */ 
  2. /* Author:Qichan Ma, Student No.:250494898 */
  3. #ifndef PAIRWISEALIGN_H
  4. #define PAIRWISEALIGN_H
  5. /* get the maximal number from 2 numbers */
  6. int max(int x1, int x2);
  7. /* get the maximal number from 3 numbers */
  8. int max1(int x1, int x2, int x3);
  9. /* compute the optimal pairwise alignment score of two sequences */
  10. int pairwiseScore(char *x, char *y);
  11. /* compute the optimal pairwise alignment score of two sequences and do traceback to get the alignment */    
  12. int pairwiseAlign(char *x, char *y); 
  13. #endif