kd_search.cpp
上传用户:chinafayin
上传日期:2022-04-05
资源大小:153k
文件大小:9k
源码类别:

并行计算

开发平台:

Visual C++

  1. //---------------------------------------------------------------------- // File: kd_search.cpp // Programmer: Sunil Arya and David Mount // Description: Standard kd-tree search // Last modified: 01/04/05 (Version 1.0) //---------------------------------------------------------------------- // Copyright (c) 1997-2005 University of Maryland and Sunil Arya and // David Mount.  All Rights Reserved. //  // This software and related documentation is part of the Approximate // Nearest Neighbor Library (ANN).  This software is provided under // the provisions of the Lesser GNU Public License (LGPL).  See the // file ../ReadMe.txt for further information. //  // The University of Maryland (U.M.) and the authors make no // representations about the suitability or fitness of this software for // any purpose.  It is provided "as is" without express or implied // warranty. //---------------------------------------------------------------------- // History: // Revision 0.1  03/04/98 // Initial release // Revision 1.0  04/01/05 // Changed names LO, HI to ANN_LO, ANN_HI //---------------------------------------------------------------------- #if defined(_MSC_VER)     #pragma warning (disable: 4127) #endif #include "kd_search.h" // kd-search declarations //---------------------------------------------------------------------- // Approximate nearest neighbor searching by kd-tree search // The kd-tree is searched for an approximate nearest neighbor. // The point is returned through one of the arguments, and the // distance returned is the squared distance to this point. // // The method used for searching the kd-tree is an approximate // adaptation of the search algorithm described by Friedman, // Bentley, and Finkel, ``An algorithm for finding best matches // in logarithmic expected time,'' ACM Transactions on Mathematical // Software, 3(3):209-226, 1977). // // The algorithm operates recursively.  When first encountering a // node of the kd-tree we first visit the child which is closest to // the query point.  On return, we decide whether we want to visit // the other child.  If the box containing the other child exceeds // 1/(1+eps) times the current best distance, then we skip it (since // any point found in this child cannot be closer to the query point // by more than this factor.)  Otherwise, we visit it recursively. // The distance between a box and the query point is computed exactly // (not approximated as is often done in kd-tree), using incremental // distance updates, as described by Arya and Mount in ``Algorithms // for fast vector quantization,'' Proc.  of DCC '93: Data Compression // Conference, eds. J. A. Storer and M. Cohn, IEEE Press, 1993, // 381-390. // // The main entry points is annkSearch() which sets things up and // then call the recursive routine ann_search().  This is a recursive // routine which performs the processing for one node in the kd-tree. // There are two versions of this virtual procedure, one for splitting // nodes and one for leaves.  When a splitting node is visited, we // determine which child to visit first (the closer one), and visit // the other child on return.  When a leaf is visited, we compute // the distances to the points in the buckets, and update information // on the closest points. // // Some trickery is used to incrementally update the distance from // a kd-tree rectangle to the query point.  This comes about from // the fact that which each successive split, only one component // (along the dimension that is split) of the squared distance to // the child rectangle is different from the squared distance to // the parent rectangle. //---------------------------------------------------------------------- //---------------------------------------------------------------------- // To keep argument lists short, a number of global variables // are maintained which are common to all the recursive calls. // These are given below. //---------------------------------------------------------------------- ANN_THREAD_LOCAL    int ANNkdDim; // dimension of space ANN_THREAD_LOCAL    ANNpoint ANNkdQ; // query point ANN_THREAD_LOCAL    double ANNkdMaxErr; // max tolerable squared error ANN_THREAD_LOCAL    ANNpointArray ANNkdPts; // the points ANN_THREAD_LOCAL    ANNmin_k *ANNkdPointMK; // set of k closest points //---------------------------------------------------------------------- // annkSearch - search for the k nearest neighbors //---------------------------------------------------------------------- void ANNkd_tree::annkSearch( ANNpoint q, // the query point int k, // number of near neighbors to return ANNidxArray nn_idx, // nearest neighbor indices (returned) ANNdistArray dd, // the approximate nearest neighbor double eps) // the error bound { ANNkdDim = dim; // copy arguments to static equivs ANNkdQ = q; ANNkdPts = pts; ANNptsVisited = 0; // initialize count of points visited if (k > n_pts) { // too many near neighbors? annError("Requesting more near neighbors than data points", ANNabort); } ANNkdMaxErr = ANN_POW(1.0 + eps); ANN_FLOP(2) // increment floating op count ANNkdPointMK = new ANNmin_k(k); // create set for closest k points // search starting at the root root->ann_search(annBoxDistance(q, bnd_box_lo, bnd_box_hi, dim)); for (int i = 0; i < k; i++) { // extract the k-th closest points dd[i] = ANNkdPointMK->ith_smallest_key(i); nn_idx[i] = ANNkdPointMK->ith_smallest_info(i); } delete ANNkdPointMK; // deallocate closest point set } //---------------------------------------------------------------------- // kd_split::ann_search - search a splitting node //---------------------------------------------------------------------- void ANNkd_split::ann_search(ANNdist box_dist) { // check dist calc term condition
  2. if (ANNmaxPtsVisited != 0 && ANNptsVisited > ANNmaxPtsVisited) return;
  3. // distance to cutting plane
  4. ANNcoord cut_diff = ANNkdQ[cut_dim] - cut_val;
  5. if (cut_diff < 0) { // left of cutting plane
  6. child[ANN_LO]->ann_search(box_dist);// visit closer child first
  7. ANNcoord box_diff = cd_bnds[ANN_LO] - ANNkdQ[cut_dim];
  8. if (box_diff < 0) // within bounds - ignore
  9. box_diff = 0;
  10. // distance to further box
  11. box_dist = (ANNdist) ANN_SUM(box_dist,
  12. ANN_DIFF(ANN_POW(box_diff), ANN_POW(cut_diff)));
  13. // visit further child if close enough
  14. if (box_dist * ANNkdMaxErr < ANNkdPointMK->max_key())
  15. child[ANN_HI]->ann_search(box_dist);
  16. }
  17. else { // right of cutting plane
  18. child[ANN_HI]->ann_search(box_dist);// visit closer child first
  19. ANNcoord box_diff = ANNkdQ[cut_dim] - cd_bnds[ANN_HI];
  20. if (box_diff < 0) // within bounds - ignore
  21. box_diff = 0;
  22. // distance to further box
  23. box_dist = (ANNdist) ANN_SUM(box_dist,
  24. ANN_DIFF(ANN_POW(box_diff), ANN_POW(cut_diff)));
  25. // visit further child if close enough
  26. if (box_dist * ANNkdMaxErr < ANNkdPointMK->max_key())
  27. child[ANN_LO]->ann_search(box_dist);
  28. }
  29. ANN_FLOP(10) // increment floating ops
  30. ANN_SPL(1) // one more splitting node visited
  31. } //---------------------------------------------------------------------- // kd_leaf::ann_search - search points in a leaf node // Note: The unreadability of this code is the result of // some fine tuning to replace indexing by pointer operations. //---------------------------------------------------------------------- void ANNkd_leaf::ann_search(ANNdist) { register ANNdist dist; // distance to data point register ANNcoord* pp; // data coordinate pointer register ANNcoord* qq; // query coordinate pointer register ANNdist min_dist; // distance to k-th closest point register ANNcoord t; register int d; min_dist = ANNkdPointMK->max_key(); // k-th smallest distance so far for (int i = 0; i < n_pts; i++) { // check points in bucket pp = ANNkdPts[bkt[i]]; // first coord of next data point qq = ANNkdQ; // first coord of query point dist = 0; for(d = 0; d < ANNkdDim; d++) { ANN_COORD(1) // one more coordinate hit ANN_FLOP(4) // increment floating ops t = *(qq++) - *(pp++); // compute length and adv coordinate // exceeds dist to k-th smallest? if( (dist = ANN_SUM(dist, ANN_POW(t))) > min_dist) { break; } } if (d >= ANNkdDim && // among the k best?    (ANN_ALLOW_SELF_MATCH || dist!=0)) { // and no self-match problem // add it to the list ANNkdPointMK->insert(dist, bkt[i]); min_dist = ANNkdPointMK->max_key(); } } ANN_LEAF(1) // one more leaf node visited ANN_PTS(n_pts) // increment points visited ANNptsVisited += n_pts; // increment number of points visited }