bdb_filedump.cpp
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上传日期:2007-06-13
资源大小:13604k
文件大小:4k
源码类别:

生物技术

开发平台:

C/C++

  1. /*
  2.  * ===========================================================================
  3.  * PRODUCTION $Log: bdb_filedump.cpp,v $
  4.  * PRODUCTION Revision 1000.1  2004/06/01 18:37:27  gouriano
  5.  * PRODUCTION PRODUCTION: UPGRADED [GCC34_MSVC7] Dev-tree R1.3
  6.  * PRODUCTION
  7.  * ===========================================================================
  8.  */
  9. /*  $Id: bdb_filedump.cpp,v 1000.1 2004/06/01 18:37:27 gouriano Exp $
  10.  * ===========================================================================
  11.  *
  12.  *                            PUBLIC DOMAIN NOTICE
  13.  *               National Center for Biotechnology Information
  14.  *
  15.  *  This software/database is a "United States Government Work" under the
  16.  *  terms of the United States Copyright Act.  It was written as part of
  17.  *  the author's official duties as a United States Government employee and
  18.  *  thus cannot be copyrighted.  This software/database is freely available
  19.  *  to the public for use. The National Library of Medicine and the U.S.
  20.  *  Government have not placed any restriction on its use or reproduction.
  21.  *
  22.  *  Although all reasonable efforts have been taken to ensure the accuracy
  23.  *  and reliability of the software and data, the NLM and the U.S.
  24.  *  Government do not and cannot warrant the performance or results that
  25.  *  may be obtained by using this software or data. The NLM and the U.S.
  26.  *  Government disclaim all warranties, express or implied, including
  27.  *  warranties of performance, merchantability or fitness for any particular
  28.  *  purpose.
  29.  *
  30.  *  Please cite the author in any work or product based on this material.
  31.  *
  32.  * ===========================================================================
  33.  *
  34.  * Author: Anatoliy Kuznetsov
  35.  *
  36.  * File Description:  BDB File covertion into text.
  37.  *
  38.  */
  39. #include <ncbi_pch.hpp>
  40. #include <corelib/ncbistre.hpp>
  41. #include <bdb/bdb_file.hpp>
  42. #include <bdb/bdb_cursor.hpp>
  43. #include <bdb/bdb_filedump.hpp>
  44. BEGIN_NCBI_SCOPE
  45. void CBDB_FileDumper::Dump(const string& dump_file_name, CBDB_File& db)
  46. {
  47.     CNcbiOfstream out(dump_file_name.c_str());
  48.     if (!out) {
  49.         string err = "Cannot open text file:";
  50.         err.append(dump_file_name);
  51.         BDB_THROW(eInvalidValue, err);
  52.     }
  53.     Dump(out, db);
  54. }
  55. void CBDB_FileDumper::Dump(CNcbiOstream& out, CBDB_File& db)
  56. {
  57.     const CBDB_BufferManager* key  = db.GetKeyBuffer();
  58.     const CBDB_BufferManager* data = db.GetDataBuffer();
  59.     // Print header
  60.     if (m_PrintNames == ePrintNames) {
  61.         if (key) {
  62.             for (unsigned i = 0; i < key->FieldCount(); ++i) {
  63.                 const CBDB_Field& fld = key->GetField(i);
  64.                 if (i != 0)
  65.                     out << m_ColumnSeparator;
  66.                 out << fld.GetName();
  67.             }
  68.         }
  69.         if (data) {
  70.             for (unsigned i = 0; i < data->FieldCount(); ++i) {
  71.                 const CBDB_Field& fld = data->GetField(i);
  72.                 out << m_ColumnSeparator << fld.GetName();
  73.             }
  74.         }
  75.         out << endl;
  76.     }
  77.     // Print values
  78.     CBDB_FileCursor cur(db);
  79.     cur.SetCondition(CBDB_FileCursor::eFirst);
  80.     while (cur.Fetch() == eBDB_Ok) {
  81.         if (key) {
  82.             for (unsigned i = 0; i < key->FieldCount(); ++i) {
  83.                 const CBDB_Field& fld = key->GetField(i);
  84.                 if (i != 0)
  85.                     out << m_ColumnSeparator;
  86.                 out << fld.GetString();
  87.             }
  88.         }
  89.         if (data) {
  90.             for (unsigned i = 0; i < data->FieldCount(); ++i) {
  91.                 const CBDB_Field& fld = data->GetField(i);
  92.                 out << m_ColumnSeparator << fld.GetString();
  93.             }
  94.         }
  95.         out << endl;
  96.     }
  97. }
  98. END_NCBI_SCOPE
  99. /*
  100.  * ===========================================================================
  101.  * $Log: bdb_filedump.cpp,v $
  102.  * Revision 1000.1  2004/06/01 18:37:27  gouriano
  103.  * PRODUCTION: UPGRADED [GCC34_MSVC7] Dev-tree R1.3
  104.  *
  105.  * Revision 1.3  2004/05/17 20:55:11  gorelenk
  106.  * Added include of PCH ncbi_pch.hpp
  107.  *
  108.  * Revision 1.2  2003/10/28 14:57:13  kuznets
  109.  * Implemeneted field names printing
  110.  *
  111.  * Revision 1.1  2003/10/27 14:18:22  kuznets
  112.  * Initial revision
  113.  *
  114.  *
  115.  * ===========================================================================
  116.  */