生物技术

开发平台：
C/C++

bdb_util.cpp：源码内容
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 * PRODUCTION $Log: bdb_util.cpp,v $
 * PRODUCTION Revision 1000.1  2004/06/01 18:37:39  gouriano
 * PRODUCTION PRODUCTION: UPGRADED [GCC34_MSVC7] Dev-tree R1.4
 * PRODUCTION
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 */
/*  $Id: bdb_util.cpp,v 1000.1 2004/06/01 18:37:39 gouriano Exp $
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 *
 *                            PUBLIC DOMAIN NOTICE
 *               National Center for Biotechnology Information
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 *
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 *
 * Author: Anatoliy Kuznetsov
 *
 * File Description: BDB library utilities. 
 *
 */
#include <ncbi_pch.hpp>
#include <bdb/bdb_util.hpp>
#include <util/strsearch.hpp>
BEGIN_NCBI_SCOPE
/// Check if field is a variant of string, returns pointer on the
/// internal buffer (or NULL).
///
/// @internal
static
const char* BDB_GetStringFieldBuf(const CBDB_Field& fld)
{
    const CBDB_FieldString* str_fld = 
          dynamic_cast<const CBDB_FieldString*>(&fld);
    if (str_fld) {
        return (const char*)fld.GetBuffer();
    } else {
        const CBDB_FieldLString* lstr_fld = 
              dynamic_cast<const CBDB_FieldLString*>(&fld);
        if (lstr_fld) {
            return (const char*)fld.GetBuffer();
        }
    }
    return 0;
}
/// Search for value in the field buffer
///
/// @return -1 if not found, otherwise field number
///
/// @internal
static
int BDB_find_field(const CBDB_BufferManager& buffer_man,
                   const CBoyerMooreMatcher& matcher)
{
    int fidx = -1;
    unsigned int fcount = buffer_man.FieldCount();
    for (unsigned i = 0; i < fcount; ++i) {
        const CBDB_Field& fld = buffer_man.GetField(i);
        if (fld.IsNull()) {
            continue;
        }
        unsigned str_buf_len;
        const char* str_buf = BDB_GetStringFieldBuf(fld);
        if (str_buf && (str_buf_len = fld.GetDataLength(str_buf))) {
            int pos = matcher.Search(str_buf, 0, str_buf_len);
            if (pos >= 0) {
                fidx = i;
                break;
            }
        }
    } // for i
    return fidx;
}
CBDB_File::TUnifiedFieldIndex BDB_find_field(const CBDB_File& dbf, 
                                             const CBoyerMooreMatcher& matcher)
{
    CBDB_File::TUnifiedFieldIndex fidx = 0;
    const CBDB_BufferManager* buffer_man;
    buffer_man =  dbf.GetKeyBuffer();
    if (buffer_man) {
        fidx = BDB_find_field(*buffer_man, matcher);
        if (fidx >= 0) {
            fidx = BDB_GetUFieldIdx(fidx, true /* key */);
            return fidx;
        } else {
            fidx = 0;
        }
    }
    buffer_man =  dbf.GetDataBuffer();
    if (buffer_man) {
        fidx = BDB_find_field(*buffer_man, matcher);
        if (fidx >= 0) {
            fidx = BDB_GetUFieldIdx(fidx, false /* key */);
            return fidx;        
        } else {
            fidx = 0;
        }
    }
    return fidx;
}
int BDB_get_rowid(const CBDB_File& dbf)
{
    const CBDB_BufferManager* buffer_man;
    buffer_man =  dbf.GetKeyBuffer();
    if (!buffer_man) {
        return 0;
    }
    const CBDB_Field& fld = buffer_man->GetField(0);
    {{
    const CBDB_FieldInt2* fi = dynamic_cast<const CBDB_FieldInt2*>(&fld);
    if (fi)
        return fi->Get();
    }}
    {{
    const CBDB_FieldInt4* fi = dynamic_cast<const CBDB_FieldInt4*>(&fld);
    if (fi)
        return fi->Get();
    }}
    {{
    const CBDB_FieldUint4* fi = dynamic_cast<const CBDB_FieldUint4*>(&fld);
    if (fi)
        return fi->Get();
    }}
    return 0;
}
END_NCBI_SCOPE
/*
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 * $Log: bdb_util.cpp,v $
 * Revision 1000.1  2004/06/01 18:37:39  gouriano
 * PRODUCTION: UPGRADED [GCC34_MSVC7] Dev-tree R1.4
 *
 * Revision 1.4  2004/05/17 20:55:12  gorelenk
 * Added include of PCH ncbi_pch.hpp
 *
 * Revision 1.3  2004/03/11 13:15:40  kuznets
 * Minor bugfix
 *
 * Revision 1.2  2004/03/10 14:03:11  kuznets
 * + BDB_get_rowid
 *
 * Revision 1.1  2004/03/08 13:34:06  kuznets
 * Initial revision
 *
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