生物技术

开发平台：
C/C++

queue_poll.hpp：源码内容
							/*
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 * PRODUCTION $Log: queue_poll.hpp,v $
 * PRODUCTION Revision 1000.0  2003/10/29 18:24:45  gouriano
 * PRODUCTION PRODUCTION: IMPORTED [ORIGINAL] Dev-tree R1.1
 * PRODUCTION
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 */
#ifndef APP_BLAST_CLIENT___QUEUE_POLL__HPP
#define APP_BLAST_CLIENT___QUEUE_POLL__HPP
/*  $Id: queue_poll.hpp,v 1000.0 2003/10/29 18:24:45 gouriano Exp $
 * ===========================================================================
 *
 *                            PUBLIC DOMAIN NOTICE
 *               National Center for Biotechnology Information
 *
 *  This software/database is a "United States Government Work" under the
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 *
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 *
 *  Please cite the author in any work or product based on this material.
 *
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 *
 * Author:  Kevin Bealer
 */
/// @file queue_poll.hpp
/// Queueing and Polling code for blast_client.
///
/// This contains the interface of queueing and polling code for blast_client.
/// There is only one function interface.  The goal of this interface is to
/// seperate the computational / network code from the UI (CNcbiApplication).
#include "search_opts.hpp"
#include "align_parms.hpp"
using namespace ncbi;
/// Queue the request with the given parameters; poll and display the results.
///
/// This function does the bulk of the work for the blast_client program.  It
/// queues the search, waits for processing, retrieves the results, and
/// displays the output.
/// @param program       Program to run (e.g. blastp, blastn...).
/// @param service       Service to run (e.g. plain, rpsblast, megablast...).
/// @param database      Database to search (nr, nt, pdb, etc).
/// @param opts          Optional netblast parameters.
/// @param verbose       Debugging output - displays netblast socket traffic.
/// @param trust_defline Assume sequence and defline are consistent with db.
/// @param raw_asn       Display text ASN.1, not formatted output.
/// @param alparms       Parameters to control output formatting.
Int4 QueueAndPoll(string                program,
                  string                service,
                  string                database,
                  CNetblastSearchOpts & opts,
                  CNcbiIstream        & query_in,
                  bool                  verbose,
                  bool                  trust_defline,
                  bool                  raw_asn,
                  CAlignParms         & alparms);
/*
 * ===========================================================================
 *
 * $Log: queue_poll.hpp,v $
 * Revision 1000.0  2003/10/29 18:24:45  gouriano
 * PRODUCTION: IMPORTED [ORIGINAL] Dev-tree R1.1
 *
 * Revision 1.1  2003/09/26 16:53:49  bealer
 * - Add blast_client project for netblast protocol, initial code commit.
 *
 * ===========================================================================
 */
#endif // APP_BLAST_CLIENT___QUEUE_POLL__HPP

						