search_opts.cpp
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上传日期:2007-06-13
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文件大小:7k
源码类别:

生物技术

开发平台:

C/C++

  1. /*
  2.  * ===========================================================================
  3.  * PRODUCTION $Log: search_opts.cpp,v $
  4.  * PRODUCTION Revision 1000.2  2004/06/01 18:27:28  gouriano
  5.  * PRODUCTION PRODUCTION: UPGRADED [GCC34_MSVC7] Dev-tree R1.4
  6.  * PRODUCTION
  7.  * ===========================================================================
  8.  */
  9. /*  $Id: search_opts.cpp,v 1000.2 2004/06/01 18:27:28 gouriano Exp $
  10.  * ===========================================================================
  11.  *
  12.  *                            PUBLIC DOMAIN NOTICE
  13.  *               National Center for Biotechnology Information
  14.  *
  15.  *  This software/database is a "United States Government Work" under the
  16.  *  terms of the United States Copyright Act.  It was written as part of
  17.  *  the author's official duties as a United States Government employee and
  18.  *  thus cannot be copyrighted.  This software/database is freely available
  19.  *  to the public for use. The National Library of Medicine and the U.S.
  20.  *  Government have not placed any restriction on its use or reproduction.
  21.  *
  22.  *  Although all reasonable efforts have been taken to ensure the accuracy
  23.  *  and reliability of the software and data, the NLM and the U.S.
  24.  *  Government do not and cannot warrant the performance or results that
  25.  *  may be obtained by using this software or data. The NLM and the U.S.
  26.  *  Government disclaim all warranties, express or implied, including
  27.  *  warranties of performance, merchantability or fitness for any particular
  28.  *  purpose.
  29.  *
  30.  *  Please cite the author in any work or product based on this material.
  31.  *
  32.  * ===========================================================================
  33.  *
  34.  * Author:  Kevin Bealer
  35.  *
  36.  * File Description:
  37.  *   Search-related options for blast_client.
  38.  *
  39.  */
  40. #include <ncbi_pch.hpp>
  41. #include "search_opts.hpp"
  42. USING_NCBI_SCOPE;
  43. USING_SCOPE(objects);
  44. /////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
  45. //
  46. //  Structures and Prototypes
  47. //
  48. // Functor for option reading
  49. class COptionReader : public COptionWalker
  50. {
  51. public:
  52.     COptionReader(const CArgs & args)
  53.         : m_args(args)
  54.     {}
  55.     
  56.     template <class T>
  57.     void Same(T        & valobj,
  58.               CUserOpt   user_opt,
  59.               CNetName,
  60.               CArgKey,
  61.               COptDesc,
  62.               EListPick)
  63.     {
  64.         ReadOpt(m_args, valobj, user_opt);
  65.     }
  66.     
  67.     template <class T>
  68.     void Local(T          & valobj,
  69.                CUserOpt   user_opt,
  70.                CArgKey,
  71.                COptDesc)
  72.     {
  73.         ReadOpt(m_args, valobj, user_opt);
  74.     }
  75.     
  76.     template <class T> void Remote(T &, CNetName, EListPick)
  77.     {
  78.     }
  79.     
  80.     bool NeedRemote(void) { return false; }
  81.     
  82. private:
  83.     const CArgs & m_args;
  84. };
  85. CNetblastSearchOpts::CNetblastSearchOpts(const ncbi::CArgs & a)
  86. {
  87.     COptionReader optrd(a);
  88.     Apply(optrd);
  89. }
  90. class CInterfaceBuilder : public COptionWalker
  91. {
  92. public:
  93.     CInterfaceBuilder(CArgDescriptions & ui)
  94.         : m_ui(ui)
  95.     {}
  96.     
  97.     template <class T>
  98.     void Same(T        & valobj,
  99.               CUserOpt   user_opt,
  100.               CNetName,
  101.               CArgKey    arg_key,
  102.               COptDesc   descr,
  103.               EListPick)
  104.     {
  105.         AddOpt(m_ui, valobj, user_opt, arg_key, descr);
  106.     }
  107.     
  108.     template <class T> void
  109.     Local(T        & valobj,
  110.           CUserOpt   user_opt,
  111.           CArgKey    arg_key,
  112.           COptDesc   descr)
  113.     {
  114.         AddOpt(m_ui, valobj, user_opt, arg_key, descr);
  115.     }
  116.     
  117.     template <class T>
  118.     void Remote(T &, CNetName, EListPick)
  119.     {
  120.     }
  121.     
  122.     bool NeedRemote(void) { return false; }
  123.     
  124. private:
  125.     CArgDescriptions & m_ui;
  126. };
  127. void CNetblastSearchOpts::x_CreateInterface2(CArgDescriptions & ui)
  128. {
  129.     CInterfaceBuilder make_ui(ui);
  130.     Apply(make_ui);
  131. }
  132. /////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
  133. //
  134. // Helper functions
  135. //
  136. void CNetblastSearchOpts::CreateInterface(CArgDescriptions & ui)
  137. {
  138.     CNetblastSearchOpts dummy;
  139.     dummy.x_CreateInterface2(ui);
  140. }
  141. // AddOpt
  142. void COptionWalker::AddOpt(CArgDescriptions & ui,
  143.                            TOptBool         &,
  144.                            const char       * name,
  145.                            const char       * synop,
  146.                            const char       * comment)
  147. {
  148.     ui.AddOptionalKey(name, synop, comment, CArgDescriptions::eBoolean);
  149. }
  150. void COptionWalker::AddOpt(CArgDescriptions & ui,
  151.                            TOptDouble       &,
  152.                            const char       * name,
  153.                            const char       * synop,
  154.                            const char       * comment)
  155. {
  156.     ui.AddOptionalKey(name, synop, comment, CArgDescriptions::eDouble);
  157. }
  158. void COptionWalker::AddOpt(CArgDescriptions & ui,
  159.                            TOptInteger      &,
  160.                            const char       * name,
  161.                            const char       * synop,
  162.                            const char       * comment)
  163. {
  164.     ui.AddOptionalKey(name, synop, comment, CArgDescriptions::eInteger);
  165. }
  166. void COptionWalker::AddOpt(CArgDescriptions & ui,
  167.                            TOptString       &,
  168.                            const char       * name,
  169.                            const char       * synop,
  170.                            const char       * comment)
  171. {
  172.     ui.AddOptionalKey(name, synop, comment, CArgDescriptions::eString);
  173. }
  174. // ReadOpt
  175. void COptionWalker::ReadOpt(const ncbi::CArgs & args,
  176.                             TOptDouble        & field,
  177.                             const char        * key)
  178. {
  179.     field = CheckArgsDouble(args[key]);
  180. }
  181. void COptionWalker::ReadOpt(const ncbi::CArgs & args,
  182.                             TOptBool          & field,
  183.                             const char        * key)
  184. {
  185.     field = CheckArgsBool(args[key]);
  186. }
  187. void COptionWalker::ReadOpt(const ncbi::CArgs & args,
  188.                             TOptInteger       & field,
  189.                             const char        * key)
  190. {
  191.     field = CheckArgsInteger(args[key]);
  192. }
  193. void COptionWalker::ReadOpt(const ncbi::CArgs & args,
  194.                             TOptString        & field,
  195.                             const char        * key)
  196. {
  197.     field = CheckArgsString(args[key]);
  198. }
  199. /*
  200.  * ===========================================================================
  201.  *
  202.  * $Log: search_opts.cpp,v $
  203.  * Revision 1000.2  2004/06/01 18:27:28  gouriano
  204.  * PRODUCTION: UPGRADED [GCC34_MSVC7] Dev-tree R1.4
  205.  *
  206.  * Revision 1.4  2004/05/21 21:41:38  gorelenk
  207.  * Added PCH ncbi_pch.hpp
  208.  *
  209.  * Revision 1.3  2003/12/29 19:48:30  bealer
  210.  * - Change code to accomodate first half of new ASN changes.
  211.  *
  212.  * Revision 1.2  2003/09/26 20:00:48  bealer
  213.  * - Fix compile warning.
  214.  *
  215.  * Revision 1.1  2003/09/26 16:53:49  bealer
  216.  * - Add blast_client project for netblast protocol, initial code commit.
  217.  *
  218.  * ===========================================================================
  219.  */