periodic_table.hpp
上传用户:yhdzpy8989
上传日期:2007-06-13
资源大小:13604k
文件大小:4k
源码类别:

生物技术

开发平台:

C/C++

  1. /*
  2.  * ===========================================================================
  3.  * PRODUCTION $Log: periodic_table.hpp,v $
  4.  * PRODUCTION Revision 1000.1  2004/04/12 17:33:02  gouriano
  5.  * PRODUCTION PRODUCTION: UPGRADED [CATCHUP_003] Dev-tree R1.6
  6.  * PRODUCTION
  7.  * ===========================================================================
  8.  */
  9. /*  $Id: periodic_table.hpp,v 1000.1 2004/04/12 17:33:02 gouriano Exp $
  10. * ===========================================================================
  11. *
  12. *                            PUBLIC DOMAIN NOTICE
  13. *               National Center for Biotechnology Information
  14. *
  15. *  This software/database is a "United States Government Work" under the
  16. *  terms of the United States Copyright Act.  It was written as part of
  17. *  the author's official duties as a United States Government employee and
  18. *  thus cannot be copyrighted.  This software/database is freely available
  19. *  to the public for use. The National Library of Medicine and the U.S.
  20. *  Government have not placed any restriction on its use or reproduction.
  21. *
  22. *  Although all reasonable efforts have been taken to ensure the accuracy
  23. *  and reliability of the software and data, the NLM and the U.S.
  24. *  Government do not and cannot warrant the performance or results that
  25. *  may be obtained by using this software or data. The NLM and the U.S.
  26. *  Government disclaim all warranties, express or implied, including
  27. *  warranties of performance, merchantability or fitness for any particular
  28. *  purpose.
  29. *
  30. *  Please cite the author in any work or product based on this material.
  31. *
  32. * ===========================================================================
  33. *
  34. * Authors:  Paul Thiessen
  35. *
  36. * File Description:
  37. *      Classes to information about atomic elements
  38. *
  39. * ===========================================================================
  40. */
  41. #ifndef CN3D_PERIODICTABLE__HPP
  42. #define CN3D_PERIODICTABLE__HPP
  43. #include <corelib/ncbistl.hpp>
  44. #include <map>
  45. #include "vector_math.hpp"
  46. BEGIN_SCOPE(Cn3D)
  47. class Element
  48. {
  49. public:
  50.   const char *name, *symbol;
  51.   double vdWRadius;
  52.   Vector color;
  53.   Element(const char *n, const char *s,
  54.           double r, double g, double b, double v) :
  55.     name(n), symbol(s), color(r,g,b), vdWRadius(v) { }
  56. };
  57. class PeriodicTableClass
  58. {
  59. private:
  60.   typedef std::map < int, const Element * > ZMapType;
  61.   ZMapType ZMap;
  62. public:
  63.   PeriodicTableClass(void);
  64.   ~PeriodicTableClass(void);
  65.   const Element * GetElement(int) const;
  66.   void AddElement(int Z, const char * name,
  67.                   const char * symbol,
  68.                   double r, double g, double b,
  69.                   double vdW);
  70. };
  71. extern PeriodicTableClass PeriodicTable; // one global copy for now
  72. // general utility functions
  73. inline bool IsMetal(int atomicNumber)
  74. {
  75.     if ((atomicNumber >= 3 && atomicNumber <= 4) ||      // Li..Be
  76.         (atomicNumber >= 11 && atomicNumber <= 13) ||    // Na..Al
  77.         (atomicNumber >= 19 && atomicNumber <= 32) ||    // K..Ge
  78.         (atomicNumber >= 37 && atomicNumber <= 51) ||    // Rb..Sb
  79.         (atomicNumber >= 55 && atomicNumber <= 84) ||    // Cs..Po
  80.         (atomicNumber >= 87 && atomicNumber <= 109))     // Fr..Mt
  81.         return true;
  82.     return false;
  83. }
  84. END_SCOPE(Cn3D)
  85. #endif // CN3D_PERIODICTABLE__HPP
  86. /*
  87. * ---------------------------------------------------------------------------
  88. * $Log: periodic_table.hpp,v $
  89. * Revision 1000.1  2004/04/12 17:33:02  gouriano
  90. * PRODUCTION: UPGRADED [CATCHUP_003] Dev-tree R1.6
  91. *
  92. * Revision 1.6  2004/02/19 17:05:02  thiessen
  93. * remove cn3d/ from include paths; add pragma to disable annoying msvc warning
  94. *
  95. * Revision 1.5  2003/02/03 19:20:04  thiessen
  96. * format changes: move CVS Log to bottom of file, remove std:: from .cpp files, and use new diagnostic macros
  97. *
  98. * Revision 1.4  2000/10/04 17:40:46  thiessen
  99. * rearrange STL #includes
  100. *
  101. * Revision 1.3  2000/08/24 18:43:15  thiessen
  102. * tweaks for transparent sphere display
  103. *
  104. * Revision 1.2  2000/07/27 13:30:10  thiessen
  105. * remove 'using namespace ...' from all headers
  106. *
  107. * Revision 1.1  2000/07/12 23:30:47  thiessen
  108. * now draws basic CPK model
  109. *
  110. */