object_3d.hpp
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上传日期:2007-06-13
资源大小:13604k
文件大小:4k
源码类别:

生物技术

开发平台:

C/C++

  1. /*
  2.  * ===========================================================================
  3.  * PRODUCTION $Log: object_3d.hpp,v $
  4.  * PRODUCTION Revision 1000.1  2004/04/12 17:32:50  gouriano
  5.  * PRODUCTION PRODUCTION: UPGRADED [CATCHUP_003] Dev-tree R1.6
  6.  * PRODUCTION
  7.  * ===========================================================================
  8.  */
  9. /*  $Id: object_3d.hpp,v 1000.1 2004/04/12 17:32:50 gouriano Exp $
  10. * ===========================================================================
  11. *
  12. *                            PUBLIC DOMAIN NOTICE
  13. *               National Center for Biotechnology Information
  14. *
  15. *  This software/database is a "United States Government Work" under the
  16. *  terms of the United States Copyright Act.  It was written as part of
  17. *  the author's official duties as a United States Government employee and
  18. *  thus cannot be copyrighted.  This software/database is freely available
  19. *  to the public for use. The National Library of Medicine and the U.S.
  20. *  Government have not placed any restriction on its use or reproduction.
  21. *
  22. *  Although all reasonable efforts have been taken to ensure the accuracy
  23. *  and reliability of the software and data, the NLM and the U.S.
  24. *  Government do not and cannot warrant the performance or results that
  25. *  may be obtained by using this software or data. The NLM and the U.S.
  26. *  Government disclaim all warranties, express or implied, including
  27. *  warranties of performance, merchantability or fitness for any particular
  28. *  purpose.
  29. *
  30. *  Please cite the author in any work or product based on this material.
  31. *
  32. * ===========================================================================
  33. *
  34. * Authors:  Paul Thiessen
  35. *
  36. * File Description:
  37. *      holds 3d-objects - helix cylinders and strand bricks
  38. *
  39. * ===========================================================================
  40. */
  41. #ifndef CN3D_OBJECT_3D__HPP
  42. #define CN3D_OBJECT_3D__HPP
  43. #include <objects/mmdb3/Residue_pntrs.hpp>
  44. #include <objects/mmdb3/Cylinder.hpp>
  45. #include <objects/mmdb3/Brick.hpp>
  46. #include "structure_base.hpp"
  47. #include "vector_math.hpp"
  48. BEGIN_SCOPE(Cn3D)
  49. class Object3D : public StructureBase
  50. {
  51. public:
  52.     static const int VALUE_NOT_SET;
  53.     int moleculeID, fromResidueID, toResidueID;
  54. protected:
  55.     Object3D(StructureBase *parent,
  56.         const ncbi::objects::CResidue_pntrs& residues);
  57. };
  58. class Helix3D : public Object3D
  59. {
  60. public:
  61.     Helix3D(StructureBase *parent,
  62.         const ncbi::objects::CCylinder& cylinder, const ncbi::objects::CResidue_pntrs& residues);
  63.     Vector Nterm, Cterm;
  64.     bool Draw(const AtomSet *data) const;
  65. };
  66. class Strand3D : public Object3D
  67. {
  68. public:
  69.     Strand3D(StructureBase *parent,
  70.         const ncbi::objects::CBrick& brick, const ncbi::objects::CResidue_pntrs& residues);
  71.     Vector Nterm, Cterm, unitNormal;
  72.     bool Draw(const AtomSet *data) const;
  73. };
  74. END_SCOPE(Cn3D)
  75. #endif // CN3D_OBJECT_3D__HPP
  76. /*
  77. * ---------------------------------------------------------------------------
  78. * $Log: object_3d.hpp,v $
  79. * Revision 1000.1  2004/04/12 17:32:50  gouriano
  80. * PRODUCTION: UPGRADED [CATCHUP_003] Dev-tree R1.6
  81. *
  82. * Revision 1.6  2004/02/19 17:05:00  thiessen
  83. * remove cn3d/ from include paths; add pragma to disable annoying msvc warning
  84. *
  85. * Revision 1.5  2003/02/03 19:20:04  thiessen
  86. * format changes: move CVS Log to bottom of file, remove std:: from .cpp files, and use new diagnostic macros
  87. *
  88. * Revision 1.4  2001/02/08 23:01:14  thiessen
  89. * hook up C-toolkit stuff for threading; working PSSM calculation
  90. *
  91. * Revision 1.3  2000/08/16 14:18:20  thiessen
  92. * map 3-d objects to molecules
  93. *
  94. * Revision 1.2  2000/08/13 02:42:13  thiessen
  95. * added helix and strand objects
  96. *
  97. * Revision 1.1  2000/08/11 18:24:41  thiessen
  98. * add 3-d objects code
  99. *
  100. */