cn3d_colors.hpp
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上传日期:2007-06-13
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文件大小:5k
源码类别:

生物技术

开发平台:

C/C++

  1. /*
  2.  * ===========================================================================
  3.  * PRODUCTION $Log: cn3d_colors.hpp,v $
  4.  * PRODUCTION Revision 1000.1  2004/04/12 17:31:39  gouriano
  5.  * PRODUCTION PRODUCTION: UPGRADED [CATCHUP_003] Dev-tree R1.14
  6.  * PRODUCTION
  7.  * ===========================================================================
  8.  */
  9. /*  $Id: cn3d_colors.hpp,v 1000.1 2004/04/12 17:31:39 gouriano Exp $
  10. * ===========================================================================
  11. *
  12. *                            PUBLIC DOMAIN NOTICE
  13. *               National Center for Biotechnology Information
  14. *
  15. *  This software/database is a "United States Government Work" under the
  16. *  terms of the United States Copyright Act.  It was written as part of
  17. *  the author's official duties as a United States Government employee and
  18. *  thus cannot be copyrighted.  This software/database is freely available
  19. *  to the public for use. The National Library of Medicine and the U.S.
  20. *  Government have not placed any restriction on its use or reproduction.
  21. *
  22. *  Although all reasonable efforts have been taken to ensure the accuracy
  23. *  and reliability of the software and data, the NLM and the U.S.
  24. *  Government do not and cannot warrant the performance or results that
  25. *  may be obtained by using this software or data. The NLM and the U.S.
  26. *  Government disclaim all warranties, express or implied, including
  27. *  warranties of performance, merchantability or fitness for any particular
  28. *  purpose.
  29. *
  30. *  Please cite the author in any work or product based on this material.
  31. *
  32. * ===========================================================================
  33. *
  34. * Authors:  Paul Thiessen
  35. *
  36. * File Description:
  37. *      Holds various color values and cycles
  38. *
  39. * ===========================================================================
  40. */
  41. #ifndef CN3D_COLORS__HPP
  42. #define CN3D_COLORS__HPP
  43. #include <corelib/ncbistl.hpp>
  44. #include <vector>
  45. #include "vector_math.hpp"
  46. BEGIN_SCOPE(Cn3D)
  47. // for now, there is only a single global Colors object, which for convenience
  48. // can be accessed anywhere via this function
  49. class Colors;
  50. const Colors * GlobalColors(void);
  51. class Colors
  52. {
  53. public:
  54.     Colors(void);
  55.     // individual colors
  56.     enum eColor {
  57.         // sequence viewer colors
  58.         eHighlight = 0,
  59.         eMergeFail,
  60.         eGeometryViolation,
  61.         eMarkBlock,
  62.         // secondary structures
  63.         eHelix,
  64.         eStrand,
  65.         eCoil,
  66.         // charge
  67.         ePositive,
  68.         eNegative,
  69.         eNeutral,
  70.         // misc other colors
  71.         eNoDomain,
  72.         eNoTemperature,
  73.         eNoHydrophobicity,
  74.         eUnaligned,
  75.         eNoCoordinates,
  76.         eNumColors
  77.     };
  78.     const Vector& Get(eColor which) const;
  79.     // color cycles
  80.     enum eColorCycle {
  81.         eCycle1 = 0,    // for molecule, domain, object coloring
  82.         eNumColorCycles
  83.     };
  84.     static const int nCycle1;
  85.     const Vector& Get(eColorCycle which, int n) const;
  86.     // color maps
  87.     enum eColorMap {
  88.         eTemperatureMap = 0,
  89.         eHydrophobicityMap,
  90.         eConservationMap,
  91.         eRainbowMap,
  92.         eNumColorMaps
  93.     };
  94.     static const int nTemperatureMap, nHydrophobicityMap, nConservationMap, nRainbowMap;
  95.     Vector Get(eColorMap which, double f) const;
  96.     const Vector* Get(eColorMap which, int index) const;
  97.     // light or dark color?
  98.     static bool IsLightColor(const Vector& color)
  99.     {
  100.         return ((color[0] + color[1] + color[2]) > 1.5);
  101.     }
  102. private:
  103.     // storage for individual colors
  104.     Vector colors[eNumColors];
  105.     // storage for color cycles
  106.     std::vector < std::vector < Vector > > cycleColors;
  107.     // storage for color maps
  108.     std::vector < std::vector < Vector > > mapColors;
  109. };
  110. END_SCOPE(Cn3D)
  111. #endif // CN3D_COLORS__HPP
  112. /*
  113. * ---------------------------------------------------------------------------
  114. * $Log: cn3d_colors.hpp,v $
  115. * Revision 1000.1  2004/04/12 17:31:39  gouriano
  116. * PRODUCTION: UPGRADED [CATCHUP_003] Dev-tree R1.14
  117. *
  118. * Revision 1.14  2004/02/19 17:04:50  thiessen
  119. * remove cn3d/ from include paths; add pragma to disable annoying msvc warning
  120. *
  121. * Revision 1.13  2003/02/03 19:20:02  thiessen
  122. * format changes: move CVS Log to bottom of file, remove std:: from .cpp files, and use new diagnostic macros
  123. *
  124. * Revision 1.12  2002/11/18 20:49:11  thiessen
  125. * move unaligned/no-coord colors into Colors class
  126. *
  127. * Revision 1.11  2001/09/04 14:40:26  thiessen
  128. * add rainbow and charge coloring
  129. *
  130. * Revision 1.10  2001/08/24 00:40:57  thiessen
  131. * tweak conservation colors and opengl font handling
  132. *
  133. * Revision 1.9  2001/08/21 01:10:13  thiessen
  134. * add labeling
  135. *
  136. * Revision 1.8  2001/08/09 19:07:19  thiessen
  137. * add temperature and hydrophobicity coloring
  138. *
  139. * Revision 1.7  2001/07/12 17:34:22  thiessen
  140. * change domain mapping ; add preliminary cdd annotation GUI
  141. *
  142. * Revision 1.6  2001/05/11 02:10:04  thiessen
  143. * add better merge fail indicators; tweaks to windowing/taskbar
  144. *
  145. * Revision 1.5  2001/05/09 17:14:52  thiessen
  146. * add automatic block removal upon demotion
  147. *
  148. * Revision 1.4  2001/04/05 22:54:50  thiessen
  149. * change bg color handling ; show geometry violations
  150. *
  151. * Revision 1.3  2001/03/22 00:32:35  thiessen
  152. * initial threading working (PSSM only); free color storage in undo stack
  153. *
  154. * Revision 1.2  2000/12/01 19:34:43  thiessen
  155. * better domain assignment
  156. *
  157. * Revision 1.1  2000/11/30 15:49:07  thiessen
  158. * add show/hide rows; unpack sec. struc. and domain features
  159. *
  160. */