开通博客赚积分
发布资源赚积分
分类

源码开发语言/平台
当前位置：首页 > 源码/资料 > 数值算法/人工智能 > 生物技术 > 查看源码
viewer_window_base.cpp
资源名称：ncbi_cxx_win--Jul_08_2004.zip　[点击查看]
上传用户：yhdzpy8989
上传日期：2007-06-13
资源大小：13604k
文件大小：19k
源码类别：

生物技术

开发平台：

C/C++

viewer_window_base.cpp：源码内容
  1. /*
  2.  * ===========================================================================
  3.  * PRODUCTION $Log: viewer_window_base.cpp,v $
  4.  * PRODUCTION Revision 1000.3  2004/06/01 18:29:58  gouriano
  5.  * PRODUCTION PRODUCTION: UPGRADED [GCC34_MSVC7] Dev-tree R1.50
  6.  * PRODUCTION
  7.  * ===========================================================================
  8.  */
  10. /*  $Id: viewer_window_base.cpp,v 1000.3 2004/06/01 18:29:58 gouriano Exp $
  11. * ===========================================================================
  12. *
  13. *                            PUBLIC DOMAIN NOTICE
  14. *               National Center for Biotechnology Information
  15. *
  16. *  This software/database is a "United States Government Work" under the
  17. *  terms of the United States Copyright Act.  It was written as part of
  18. *  the author's official duties as a United States Government employee and
  19. *  thus cannot be copyrighted.  This software/database is freely available
  20. *  to the public for use. The National Library of Medicine and the U.S.
  21. *  Government have not placed any restriction on its use or reproduction.
  22. *
  23. *  Although all reasonable efforts have been taken to ensure the accuracy
  24. *  and reliability of the software and data, the NLM and the U.S.
  25. *  Government do not and cannot warrant the performance or results that
  26. *  may be obtained by using this software or data. The NLM and the U.S.
  27. *  Government disclaim all warranties, express or implied, including
  28. *  warranties of performance, merchantability or fitness for any particular
  29. *  purpose.
  30. *
  31. *  Please cite the author in any work or product based on this material.
  32. *
  33. * ===========================================================================
  34. *
  35. * Authors:  Paul Thiessen
  36. *
  37. * File Description:
  38. *      base GUI functionality for viewers
  39. *
  40. * ===========================================================================
  41. */
  43. #ifdef _MSC_VER
  44. #pragma warning(disable:4018)   // disable signed/unsigned mismatch warning in MSVC
  45. #endif
  47. #include <ncbi_pch.hpp>
  48. #include <corelib/ncbistd.hpp>
  50. #include <memory>
  52. #include "viewer_window_base.hpp"
  53. #include "viewer_base.hpp"
  54. #include "sequence_display.hpp"
  55. #include "messenger.hpp"
  56. #include "cn3d_threader.hpp"
  57. #include "alignment_manager.hpp"
  58. #include "cn3d_tools.hpp"
  60. // the application icon (under Windows it is in resources)
  61. #if defined(__WXGTK__) || defined(__WXMAC__)
  62.     #include "cn3d.xpm"
  63. #endif
  65. USING_NCBI_SCOPE;
  68. BEGIN_SCOPE(Cn3D)
  70. ViewerWindowBase::ViewerWindowBase(ViewerBase *parentViewer, const wxPoint& pos, const wxSize& size) :
  71.     wxFrame(GlobalTopWindow(), wxID_HIGHEST + 10, "", pos, size,
  72.         wxDEFAULT_FRAME_STYLE
  73. #if defined(__WXMSW__)
  74.             | wxFRAME_TOOL_WINDOW
  75.             | wxFRAME_NO_TASKBAR
  76.             | wxFRAME_FLOAT_ON_PARENT
  77. #endif
  78.         ),
  79.     viewerWidget(NULL), viewer(parentViewer)
  80. {
  81.     if (!parentViewer) ERRORMSG("ViewerWindowBase::ViewerWindowBase() - got NULL pointer");
  83.     SetSizeHints(200, 150);
  84.     SetIcon(wxICON(cn3d));
  86.     // status bar with two fields - first is for id/loc, second is for general status line
  87.     CreateStatusBar(2);
  88.     int widths[2] = { 175, -1 };
  89.     SetStatusWidths(2, widths);
  91.     viewerWidget = new SequenceViewerWidget(this);
  92.     SetupFontFromRegistry();
  94.     menuBar = new wxMenuBar;
  95.     viewMenu = new wxMenu;
  96.     viewMenu->Append(MID_SHOW_TITLES, "Show &Titles");
  97.     //menu->Append(MID_HIDE_TITLES, "&Hide Titles");
  98.     viewMenu->Append(MID_SHOW_GEOM_VLTNS, "Show &Geometry Violations", "", true);
  99.     viewMenu->Append(MID_FIND_PATTERN, "Find &Pattern");
  100.     menuBar->Append(viewMenu, "&View");
  102.     editMenu = new wxMenu;
  103.     editMenu->Append(MID_ENABLE_EDIT, "&Enable Editor", "", true);
  104.     editMenu->Append(MID_UNDO, "UndotCtrl-Z");
  105. #ifndef __WXMAC__
  106.     editMenu->Append(MID_REDO, "RedotShift-Ctrl-Z");
  107. #else
  108.     // mac commands apparently don't recognize shift?
  109.     editMenu->Append(MID_REDO, "Redo");
  110. #endif
  111.     editMenu->AppendSeparator();
  112.     editMenu->Append(MID_SPLIT_BLOCK, "&Split Block", "", true);
  113.     editMenu->Append(MID_MERGE_BLOCKS, "&Merge Blocks", "", true);
  114.     editMenu->Append(MID_CREATE_BLOCK, "&Create Block", "", true);
  115.     editMenu->Append(MID_DELETE_BLOCK, "&Delete Block", "", true);
  116.     editMenu->AppendSeparator();
  117.     editMenu->Append(MID_SYNC_STRUCS, "Sy&nc Structure Colors");
  118.     editMenu->Append(MID_SYNC_STRUCS_ON, "&Always Sync Structure Colors", "", true);
  119.     menuBar->Append(editMenu, "&Edit");
  121.     mouseModeMenu = new wxMenu;
  122.     mouseModeMenu->Append(MID_SELECT_RECT, "&Select Rectangle", "", true);
  123.     mouseModeMenu->Append(MID_SELECT_COLS, "Select &Columns", "", true);
  124.     mouseModeMenu->Append(MID_SELECT_ROWS, "Select &Rows", "", true);
  125.     mouseModeMenu->Append(MID_DRAG_HORIZ, "&Horizontal Drag", "", true);
  126.     menuBar->Append(mouseModeMenu, "&Mouse Mode");
  128.     // accelerators for special mouse mode keys
  129.     wxAcceleratorEntry entries[4];
  130.     entries[0].Set(wxACCEL_NORMAL, 's', MID_SELECT_RECT);
  131.     entries[1].Set(wxACCEL_NORMAL, 'c', MID_SELECT_COLS);
  132.     entries[2].Set(wxACCEL_NORMAL, 'r', MID_SELECT_ROWS);
  133.     entries[3].Set(wxACCEL_NORMAL, 'h', MID_DRAG_HORIZ);
  134.     wxAcceleratorTable accel(4, entries);
  135.     SetAcceleratorTable(accel);
  137.     justificationMenu = new wxMenu;
  138.     justificationMenu->Append(MID_LEFT, "&Left", "", true);
  139.     justificationMenu->Append(MID_RIGHT, "&Right", "", true);
  140.     justificationMenu->Append(MID_CENTER, "&Center", "", true);
  141.     justificationMenu->Append(MID_SPLIT, "&Split", "", true);
  142.     menuBar->Append(justificationMenu, "Unaligned &Justification");
  144.     // set default initial modes
  145.     viewerWidget->SetMouseMode(SequenceViewerWidget::eSelectRectangle);
  146.     menuBar->Check(MID_SELECT_RECT, true);
  147.     menuBar->Check(MID_SPLIT, true);
  148.     currentJustification = BlockMultipleAlignment::eSplit;
  149.     viewerWidget->TitleAreaOn();
  150.     menuBar->Check(MID_SYNC_STRUCS_ON, true);
  151.     EnableBaseEditorMenuItems(false);
  152.     menuBar->Check(MID_SHOW_GEOM_VLTNS, false);   // start with gv's off
  153. }
  155. ViewerWindowBase::~ViewerWindowBase(void)
  156. {
  157.     if (viewer) viewer->GUIDestroyed();
  158. }
  160. void ViewerWindowBase::SetupFontFromRegistry(void)
  161. {
  162.     // get font info from registry, and create wxFont
  163.     string nativeFont;
  164.     RegistryGetString(REG_SEQUENCE_FONT_SECTION, REG_FONT_NATIVE_FONT_INFO, &nativeFont);
  165.     auto_ptr<wxFont> font(wxFont::New(wxString(nativeFont.c_str())));
  166.     if (!font.get() || !font->Ok())
  167.     {
  168.         ERRORMSG("ViewerWindowBase::SetupFontFromRegistry() - error setting up font");
  169.         return;
  170.     }
  171.     viewerWidget->SetCharacterFont(font.release());
  172. }
  174. void ViewerWindowBase::EnableBaseEditorMenuItems(bool enabled)
  175. {
  176.     int i;
  177.     for (i=MID_SPLIT_BLOCK; i<=MID_SYNC_STRUCS_ON; ++i)
  178.         menuBar->Enable(i, enabled);
  179.     menuBar->Enable(MID_DRAG_HORIZ, enabled);
  180.     if (!enabled) CancelBaseSpecialModesExcept(-1);
  181.     menuBar->Enable(MID_UNDO, false);
  182.     menuBar->Enable(MID_REDO, false);
  183.     menuBar->Enable(MID_SHOW_GEOM_VLTNS,
  184.         viewer->GetCurrentDisplay() && viewer->GetCurrentDisplay()->IsEditable());
  185.     EnableDerivedEditorMenuItems(enabled);
  186. }
  188. void ViewerWindowBase::NewDisplay(SequenceDisplay *display, bool enableSelectByColumn)
  189. {
  190.     viewerWidget->AttachAlignment(display);
  191.     menuBar->EnableTop(menuBar->FindMenu("Edit"), display->IsEditable());
  192.     menuBar->EnableTop(menuBar->FindMenu("Unaligned Justification"), display->IsEditable());
  193.     menuBar->Enable(MID_SELECT_COLS, enableSelectByColumn);
  194.     viewer->SetUndoRedoMenuStates();
  195. }
  197. void ViewerWindowBase::UpdateDisplay(SequenceDisplay *display)
  198. {
  199.     int vsX, vsY;   // to preserve scroll position
  200.     viewerWidget->GetScroll(&vsX, &vsY);
  201.     viewerWidget->AttachAlignment(display, vsX, vsY);
  202.     menuBar->EnableTop(menuBar->FindMenu("Edit"), display->IsEditable());
  203.     menuBar->EnableTop(menuBar->FindMenu("Unaligned Justification"), display->IsEditable());
  204.     GlobalMessenger()->PostRedrawAllSequenceViewers();
  205.     viewer->SetUndoRedoMenuStates();
  206. }
  208. void ViewerWindowBase::OnTitleView(wxCommandEvent& event)
  209. {
  210.     TRACEMSG("in OnTitleView()");
  211.     switch (event.GetId()) {
  212.         case MID_SHOW_TITLES:
  213.             viewerWidget->TitleAreaOn(); break;
  214.         case MID_HIDE_TITLES:
  215.             viewerWidget->TitleAreaOff(); break;
  216.     }
  217. }
  219. void ViewerWindowBase::OnEditMenu(wxCommandEvent& event)
  220. {
  221.     bool turnEditorOn = menuBar->IsChecked(MID_ENABLE_EDIT);
  223.     switch (event.GetId()) {
  225.         case MID_ENABLE_EDIT:
  226.             if (turnEditorOn) {
  227.                 TRACEMSG("turning on editor");
  228.                 if (!RequestEditorEnable(true)) {
  229.                     menuBar->Check(MID_ENABLE_EDIT, false);
  230.                     break;
  231.                 }
  232.                 EnableBaseEditorMenuItems(true);
  233.                 viewer->GetCurrentDisplay()->AddBlockBoundaryRows();    // add before push!
  234.                 viewer->EnableStacks();     // start up undo/redo stack system
  235.                 Command(MID_DRAG_HORIZ);    // switch to drag mode
  236.             } else {
  237.                 TRACEMSG("turning off editor");
  238.                 if (!RequestEditorEnable(false)) {   // cancelled
  239.                     menuBar->Check(MID_ENABLE_EDIT, true);
  240.                     break;
  241.                 }
  242.                 EnableBaseEditorMenuItems(false);
  243.                 viewer->GetCurrentDisplay()->RemoveBlockBoundaryRows();
  244.                 if (!menuBar->IsChecked(MID_SELECT_COLS) || !menuBar->IsChecked(MID_SELECT_ROWS))
  245.                     Command(MID_SELECT_RECT);
  246.             }
  247.             break;
  249.         case MID_UNDO:
  250.             TRACEMSG("undoing...");
  251.             viewer->Undo();
  252.             UpdateDisplay(viewer->GetCurrentDisplay());
  253.             if (AlwaysSyncStructures()) SyncStructures();
  254.             break;
  256.         case MID_REDO:
  257.             TRACEMSG("redoing...");
  258.             viewer->Redo();
  259.             UpdateDisplay(viewer->GetCurrentDisplay());
  260.             if (AlwaysSyncStructures()) SyncStructures();
  261.             break;
  263.         case MID_SPLIT_BLOCK:
  264.             CancelAllSpecialModesExcept(MID_SPLIT_BLOCK);
  265.             if (DoSplitBlock())
  266.                 SetCursor(*wxCROSS_CURSOR);
  267.             else
  268.                 SplitBlockOff();
  269.             break;
  271.         case MID_MERGE_BLOCKS:
  272.             CancelAllSpecialModesExcept(MID_MERGE_BLOCKS);
  273.             if (DoMergeBlocks()) {
  274.                 SetCursor(*wxCROSS_CURSOR);
  275.                 prevMouseMode = viewerWidget->GetMouseMode();
  276.                 viewerWidget->SetMouseMode(GetMouseModeForCreateAndMerge());
  277.             } else
  278.                 MergeBlocksOff();
  279.             break;
  281.         case MID_CREATE_BLOCK:
  282.             CancelAllSpecialModesExcept(MID_CREATE_BLOCK);
  283.             if (DoCreateBlock()) {
  284.                 SetCursor(*wxCROSS_CURSOR);
  285.                 prevMouseMode = viewerWidget->GetMouseMode();
  286.                 viewerWidget->SetMouseMode(GetMouseModeForCreateAndMerge());
  287.             } else
  288.                 CreateBlockOff();
  289.             break;
  291.         case MID_DELETE_BLOCK:
  292.             CancelAllSpecialModesExcept(MID_DELETE_BLOCK);
  293.             if (DoDeleteBlock())
  294.                 SetCursor(*wxCROSS_CURSOR);
  295.             else
  296.                 DeleteBlockOff();
  297.             break;
  299.         case MID_SYNC_STRUCS:
  300.             viewer->GetCurrentDisplay()->RedrawAlignedMolecules();
  301.             break;
  302.     }
  303. }
  305. void ViewerWindowBase::OnMouseMode(wxCommandEvent& event)
  306. {
  307.     const wxMenuItemList& items = mouseModeMenu->GetMenuItems();
  308.     for (int i=0; i<items.GetCount(); ++i)
  309.         items.Item(i)->GetData()->Check(
  310.             (items.Item(i)->GetData()->GetId() == event.GetId()) ? true : false);
  312.     switch (event.GetId()) {
  313.         case MID_SELECT_RECT:
  314.             viewerWidget->SetMouseMode(SequenceViewerWidget::eSelectRectangle); break;
  315.         case MID_SELECT_COLS:
  316.             viewerWidget->SetMouseMode(SequenceViewerWidget::eSelectColumns); break;
  317.         case MID_SELECT_ROWS:
  318.             viewerWidget->SetMouseMode(SequenceViewerWidget::eSelectRows); break;
  319.         case MID_DRAG_HORIZ:
  320.             viewerWidget->SetMouseMode(SequenceViewerWidget::eDragHorizontal); break;
  321.     }
  322. }
  324. void ViewerWindowBase::OnJustification(wxCommandEvent& event)
  325. {
  326.     for (int i=MID_LEFT; i<=MID_SPLIT; ++i)
  327.         menuBar->Check(i, (i == event.GetId()) ? true : false);
  329.     switch (event.GetId()) {
  330.         case MID_LEFT:
  331.             currentJustification = BlockMultipleAlignment::eLeft; break;
  332.         case MID_RIGHT:
  333.             currentJustification = BlockMultipleAlignment::eRight; break;
  334.         case MID_CENTER:
  335.             currentJustification = BlockMultipleAlignment::eCenter; break;
  336.         case MID_SPLIT:
  337.             currentJustification = BlockMultipleAlignment::eSplit; break;
  338.     }
  339.     GlobalMessenger()->PostRedrawSequenceViewer(viewer);
  340. }
  342. void ViewerWindowBase::OnShowGeomVltns(wxCommandEvent& event)
  343. {
  344.     const ViewerBase::AlignmentList& alignments = viewer->GetCurrentAlignments();
  345.     bool showGeometryViolations = menuBar->IsChecked(MID_SHOW_GEOM_VLTNS);
  347.     ViewerBase::AlignmentList::const_iterator a, ae = alignments.end();
  348.     int nViolations = 0;
  349.     for (a=alignments.begin(); a!=ae; ++a)
  350.         nViolations += (*a)->ShowGeometryViolations(showGeometryViolations);
  351.     if (showGeometryViolations)
  352.         INFOMSG("Found " << nViolations << " geometry violation"
  353.             << ((nViolations == 1) ? "" : "s") << " in this window");
  354.     GlobalMessenger()->PostRedrawSequenceViewer(viewer);
  355. }
  357. void ViewerWindowBase::OnFindPattern(wxCommandEvent& event)
  358. {
  359.     // remember previous pattern
  360.     static wxString previousPattern;
  362.     // get pattern from user
  363.     wxString pattern = wxGetTextFromUser("Enter a pattern using ProSite syntax:",
  364.         "Input pattern", previousPattern, this);
  365.     if (pattern.size() == 0) return;
  366.     // add trailing period if not present (convenience for the user)
  367.     if (pattern[pattern.size() - 1] != '.') pattern += '.';
  368.     previousPattern = pattern;
  370.     GlobalMessenger()->RemoveAllHighlights(true);
  372.     // highlight pattern from each (unique) sequence in the display
  373.     map < const Sequence * , bool > usedSequences;
  374.     const SequenceDisplay *display = viewer->GetCurrentDisplay();
  376.     for (int i=0; i<display->NRows(); ++i) {
  378.         const Sequence *sequence = display->GetSequenceForRow(i);
  379.         if (!sequence || usedSequences.find(sequence) != usedSequences.end()) continue;
  380.         usedSequences[sequence] = true;
  382.         if (!sequence->HighlightPattern(pattern.c_str())) break;
  383.     }
  384. }
  386. void ViewerWindowBase::MakeSequenceVisible(const MoleculeIdentifier *identifier)
  387. {
  388.     const SequenceDisplay *display = viewer->GetCurrentDisplay();
  389.     for (int i=0; i<display->NRows(); ++i) {
  390.         const Sequence *sequence = display->GetSequenceForRow(i);
  391.         if (sequence && sequence->identifier == identifier) {
  392.             viewerWidget->MakeCharacterVisible(-1, i);
  393.             break;
  394.         }
  395.     }
  396. }
  398. END_SCOPE(Cn3D)
  401. /*
  402. * ---------------------------------------------------------------------------
  403. * $Log: viewer_window_base.cpp,v $
  404. * Revision 1000.3  2004/06/01 18:29:58  gouriano
  405. * PRODUCTION: UPGRADED [GCC34_MSVC7] Dev-tree R1.50
  406. *
  407. * Revision 1.50  2004/05/21 21:41:40  gorelenk
  408. * Added PCH ncbi_pch.hpp
  409. *
  410. * Revision 1.49  2004/03/15 18:38:52  thiessen
  411. * prefer prefix vs. postfix ++/-- operators
  412. *
  413. * Revision 1.48  2004/02/19 17:05:22  thiessen
  414. * remove cn3d/ from include paths; add pragma to disable annoying msvc warning
  415. *
  416. * Revision 1.47  2003/11/06 18:52:32  thiessen
  417. * make geometry violations shown on/off; allow multiple pmid entry in ref dialog
  418. *
  419. * Revision 1.46  2003/07/17 16:52:34  thiessen
  420. * add FileSaved message with edit typing
  421. *
  422. * Revision 1.45  2003/02/03 19:20:09  thiessen
  423. * format changes: move CVS Log to bottom of file, remove std:: from .cpp files, and use new diagnostic macros
  424. *
  425. * Revision 1.44  2003/01/31 17:18:59  thiessen
  426. * many small additions and changes...
  427. *
  428. * Revision 1.43  2003/01/23 20:03:05  thiessen
  429. * add BLAST Neighbor algorithm
  430. *
  431. * Revision 1.42  2002/12/19 14:15:37  thiessen
  432. * mac fixes to menus, add icon
  433. *
  434. * Revision 1.41  2002/11/22 19:54:29  thiessen
  435. * fixes for wxMac/OSX
  436. *
  437. * Revision 1.40  2002/10/18 17:31:10  thiessen
  438. * fix for gcc
  439. *
  440. * Revision 1.39  2002/10/18 17:15:33  thiessen
  441. * use wxNativeEncodingInfo to store fonts in registry
  442. *
  443. * Revision 1.38  2002/10/15 22:04:09  thiessen
  444. * fix geom vltns bug
  445. *
  446. * Revision 1.37  2002/10/13 22:58:08  thiessen
  447. * add redo ability to editor
  448. *
  449. * Revision 1.36  2002/10/07 13:29:32  thiessen
  450. * add double-click -> show row to taxonomy tree
  451. *
  452. * Revision 1.35  2002/09/06 13:06:31  thiessen
  453. * fix menu accelerator conflicts
  454. *
  455. * Revision 1.34  2002/08/15 22:13:18  thiessen
  456. * update for wx2.3.2+ only; add structure pick dialog; fix MultitextDialog bug
  457. *
  458. * Revision 1.33  2002/06/13 14:54:07  thiessen
  459. * add sort by self-hit
  460. *
  461. * Revision 1.32  2002/06/05 14:28:42  thiessen
  462. * reorganize handling of window titles
  463. *
  464. * Revision 1.31  2002/05/26 21:59:16  thiessen
  465. * tweaks for new window styles
  466. *
  467. * Revision 1.30  2002/05/17 19:10:27  thiessen
  468. * preliminary range restriction for BLAST/PSSM
  469. *
  470. * Revision 1.29  2002/03/01 19:21:00  thiessen
  471. * add icon to all frames
  472. *
  473. * Revision 1.28  2002/03/01 15:47:46  thiessen
  474. * try tool window style for sequence/log viewers
  475. *
  476. * Revision 1.27  2002/02/21 12:26:30  thiessen
  477. * fix row delete bug ; remember threader options
  478. *
  479. * Revision 1.26  2001/12/06 23:13:47  thiessen
  480. * finish import/align new sequences into single-structure data; many small tweaks
  481. *
  482. * Revision 1.25  2001/11/27 16:26:10  thiessen
  483. * major update to data management system
  484. *
  485. * Revision 1.24  2001/10/16 21:49:07  thiessen
  486. * restructure MultiTextDialog; allow virtual bonds for alpha-only PDB's
  487. *
  488. * Revision 1.23  2001/08/16 19:21:02  thiessen
  489. * add face name info to fonts
  490. *
  491. * Revision 1.22  2001/08/14 17:18:22  thiessen
  492. * add user font selection, store in registry
  493. *
  494. * Revision 1.21  2001/07/27 13:52:47  thiessen
  495. * make sure domains are assigned in order of molecule id; tweak pattern dialog
  496. *
  497. * Revision 1.20  2001/07/26 13:41:53  thiessen
  498. * add pattern memory, make period optional
  499. *
  500. * Revision 1.19  2001/07/24 15:02:59  thiessen
  501. * use ProSite syntax for pattern searches
  502. *
  503. * Revision 1.18  2001/07/23 20:24:23  thiessen
  504. * need redraw if no matches found
  505. *
  506. * Revision 1.17  2001/07/23 20:09:23  thiessen
  507. * add regex pattern search
  508. *
  509. * Revision 1.16  2001/05/31 14:32:33  thiessen
  510. * tweak font handling
  511. *
  512. * Revision 1.15  2001/05/23 17:45:41  thiessen
  513. * change dialog implementation to wxDesigner; interface changes
  514. *
  515. * Revision 1.14  2001/05/15 14:57:56  thiessen
  516. * add cn3d_tools; bring up log window when threading starts
  517. *
  518. * Revision 1.13  2001/05/11 13:45:06  thiessen
  519. * set up data directory
  520. *
  521. * Revision 1.12  2001/05/11 02:10:42  thiessen
  522. * add better merge fail indicators; tweaks to windowing/taskbar
  523. *
  524. * Revision 1.11  2001/04/18 15:46:54  thiessen
  525. * show description, length, and PDB numbering in status line
  526. *
  527. * Revision 1.10  2001/04/05 22:55:37  thiessen
  528. * change bg color handling ; show geometry violations
  529. *
  530. * Revision 1.9  2001/03/30 14:43:41  thiessen
  531. * show threader scores in status line; misc UI tweaks
  532. *
  533. * Revision 1.8  2001/03/30 03:07:35  thiessen
  534. * add threader score calculation & sorting
  535. *
  536. * Revision 1.7  2001/03/19 15:50:40  thiessen
  537. * add sort rows by identifier
  538. *
  539. * Revision 1.6  2001/03/13 01:25:07  thiessen
  540. * working undo system for >1 alignment (e.g., update window)
  541. *
  542. * Revision 1.5  2001/03/09 15:49:06  thiessen
  543. * major changes to add initial update viewer
  544. *
  545. * Revision 1.4  2001/03/07 13:39:12  thiessen
  546. * damn string namespace weirdness again
  547. *
  548. * Revision 1.3  2001/03/06 20:20:51  thiessen
  549. * progress towards >1 alignment in a SequenceDisplay ; misc minor fixes
  550. *
  551. * Revision 1.2  2001/03/02 03:26:59  thiessen
  552. * fix dangling pointer upon app close
  553. *
  554. * Revision 1.1  2001/03/01 20:15:51  thiessen
  555. * major rearrangement of sequence viewer code into base and derived classes
  556. *
  557. */