asnio.cpp
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上传日期:2007-06-13
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文件大小:6k
源码类别:

生物技术

开发平台:

C/C++

  1. /*
  2.  * ===========================================================================
  3.  * PRODUCTION $Log: asnio.cpp,v $
  4.  * PRODUCTION Revision 1000.1  2004/06/01 19:14:39  gouriano
  5.  * PRODUCTION PRODUCTION: UPGRADED [GCC34_MSVC7] Dev-tree R1.12
  6.  * PRODUCTION
  7.  * ===========================================================================
  8.  */
  9. /*  $Id: asnio.cpp,v 1000.1 2004/06/01 19:14:39 gouriano Exp $
  10. * ===========================================================================
  11. *
  12. *                            PUBLIC DOMAIN NOTICE
  13. *               National Center for Biotechnology Information
  14. *
  15. *  This software/database is a "United States Government Work" under the
  16. *  terms of the United States Copyright Act.  It was written as part of
  17. *  the author's official duties as a United States Government employee and
  18. *  thus cannot be copyrighted.  This software/database is freely available
  19. *  to the public for use. The National Library of Medicine and the U.S.
  20. *  Government have not placed any restriction on its use or reproduction.
  21. *
  22. *  Although all reasonable efforts have been taken to ensure the accuracy
  23. *  and reliability of the software and data, the NLM and the U.S.
  24. *  Government do not and cannot warrant the performance or results that
  25. *  may be obtained by using this software or data. The NLM and the U.S.
  26. *  Government disclaim all warranties, express or implied, including
  27. *  warranties of performance, merchantability or fitness for any particular
  28. *  purpose.
  29. *
  30. *  Please cite the author in any work or product based on this material.
  31. *
  32. * ===========================================================================
  33. *
  34. * Author: Eugene Vasilchenko
  35. *
  36. * File Description:
  37. *   !!! PUT YOUR DESCRIPTION HERE !!!
  38. *
  39. * ---------------------------------------------------------------------------
  40. * $Log: asnio.cpp,v $
  41. * Revision 1000.1  2004/06/01 19:14:39  gouriano
  42. * PRODUCTION: UPGRADED [GCC34_MSVC7] Dev-tree R1.12
  43. *
  44. * Revision 1.12  2004/05/17 20:59:07  gorelenk
  45. * Added include of PCH ncbi_pch.hpp
  46. *
  47. * Revision 1.11  2001/02/13 20:44:23  vakatov
  48. * Use `reinterpret_cast<IoFuncType>(WriteAsn)' instead of a more safe
  49. * (but not-compilable by MIPSpro7.3 compiler on IRIX) `extern "C"'
  50. * pre-declaration.
  51. *
  52. * Revision 1.10  2001/02/10 05:00:17  lavr
  53. * ctools added in #includes
  54. *
  55. * Revision 1.9  2000/11/29 17:25:16  vasilche
  56. * Added possibility to change ASNIO mode (mainly for XML output).
  57. * Fixed warnings on 64 bit compilers.
  58. *
  59. * Revision 1.8  1999/10/21 16:57:11  golikov
  60. * AsnMemoryWrite mode param added
  61. *
  62. * Revision 1.7  1999/10/21 16:20:44  golikov
  63. * Mode param added
  64. *
  65. * Revision 1.6  1999/05/15 23:00:59  vakatov
  66. * Moved "asnio" and "asnwrite" modules to the (new) library
  67. * "xasn"(project "asn")
  68. *
  69. * Revision 1.5  1999/04/16 17:45:33  vakatov
  70. * [MSVC++] Replace the <windef.h>'s min/max macros by the hand-made templates.
  71. *
  72. * Revision 1.4  1999/04/15 21:58:24  vakatov
  73. * Use NcbiMin instead of MIN
  74. *
  75. * Revision 1.3  1999/04/14 19:11:51  vakatov
  76. * Added "LIBCALLBACK" to AsnRead/Write proto (MSVC++ feature)
  77. *
  78. * Revision 1.2  1999/04/14 17:25:41  vasilche
  79. * Fixed warning about mixing pointers to "C" and "C++" functions.
  80. *
  81. * Revision 1.1  1999/02/17 22:03:12  vasilche
  82. * Assed AsnMemoryRead & AsnMemoryWrite.
  83. * Pager now may return NULL for some components if it contains only one
  84. * page.
  85. * ===========================================================================
  86. */
  87. #include <ncbi_pch.hpp>
  88. #include <corelib/ncbistd.hpp>
  89. #include <ctools/asn/asnio.hpp>
  90. #include <algorithm>
  91. BEGIN_NCBI_SCOPE
  92. /////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
  93. //  AsnMemoryRead::
  94. //
  95. AsnMemoryRead::AsnMemoryRead(Uint2 mode, const string& str)
  96.     : m_Source(str), m_Data(str.c_str()), m_Size(str.size()), m_mode(mode)
  97. {
  98.     Init();
  99. }
  100. AsnMemoryRead::AsnMemoryRead(Uint2 mode, const char* data, size_t size)
  101.     : m_Data(data), m_Size(size), m_mode(mode)
  102. {
  103.     Init();
  104. }
  105. AsnMemoryRead::~AsnMemoryRead(void)
  106. {
  107.     AsnIoClose(m_In);
  108. }
  109. size_t AsnMemoryRead::Read(char* buffer, size_t size)
  110. {
  111.     size_t count = min(size, m_Size - m_Ptr);
  112.     memcpy(buffer, m_Data + m_Ptr, count);
  113.     m_Ptr += count;
  114.     return count;
  115. }
  116. static Int2 LIBCALLBACK ReadAsn(Pointer data, CharPtr buffer, Uint2 size)
  117. {
  118.     if ( !data || !buffer )
  119.         return -1;
  120.     return Int2(static_cast<AsnMemoryRead*>(data)->Read(buffer, size));
  121. }
  122. void AsnMemoryRead::Init(void)
  123. {
  124.     m_Ptr = 0;
  125.     m_In = AsnIoNew(m_mode | ASNIO_IN, 0, this,
  126.     reinterpret_cast<IoFuncType>(ReadAsn), 0);
  127. }
  128. /////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
  129. //  AsnMemoryWrite::
  130. //
  131. static Int2 LIBCALLBACK WriteAsn(Pointer data, CharPtr buffer, Uint2 size)
  132. {
  133.     if ( !data || !buffer )
  134.         return -1;
  135.     return Int2(static_cast<AsnMemoryWrite*>(data)->Write(buffer, size));
  136. }
  137. AsnMemoryWrite::AsnMemoryWrite(Uint2 mode)
  138.     : m_Data(new char[512]), m_Size(512), m_Ptr(0)
  139. {
  140.     m_Out = AsnIoNew(mode | ASNIO_OUT, 0, this,
  141.      0, reinterpret_cast<IoFuncType>(WriteAsn));
  142. }
  143. AsnMemoryWrite::~AsnMemoryWrite(void)
  144. {
  145.     AsnIoClose(m_Out);
  146.     delete[] m_Data;
  147. }
  148. size_t AsnMemoryWrite::Write(const char* buffer, size_t size)
  149. {
  150.     if ( m_Size - m_Ptr < size ) { // not enough space
  151.         // new buffer
  152.         char* data = new char[m_Size *= 2];
  153.         if ( m_Ptr ) // copy old data
  154.             memcpy(data, m_Data, m_Ptr);
  155.         // delete old buffer
  156.         delete[] m_Data;
  157.         // set new buffer
  158.         m_Data = data;
  159.     }
  160.     // append data
  161.     memcpy(m_Data + m_Ptr, buffer, size);
  162.     // increase size
  163.     m_Ptr += size;
  164.     return size;
  165. }
  166. void AsnMemoryWrite::flush(void) const
  167. {
  168.     AsnIoFlush(m_Out);
  169. }
  170. END_NCBI_SCOPE