生物技术

开发平台：
C/C++

checksum.cpp：源码内容
							/*
 * ===========================================================================
 * PRODUCTION $Log: checksum.cpp,v $
 * PRODUCTION Revision 1000.1  2004/06/01 19:39:56  gouriano
 * PRODUCTION PRODUCTION: UPGRADED [GCC34_MSVC7] Dev-tree R1.11
 * PRODUCTION
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 */
/*  $Id: checksum.cpp,v 1000.1 2004/06/01 19:39:56 gouriano Exp $
 * ===========================================================================
 *
 *                            PUBLIC DOMAIN NOTICE
 *               National Center for Biotechnology Information
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 *
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 *
 * ===========================================================================
 *
 * Author: Eugene Vasilchenko
 *
 * File Description:  Checksum (CRC32 or MD5) calculation class
 *
 */
#include <ncbi_pch.hpp>
#include <corelib/ncbistd.hpp>
#include <util/checksum.hpp>
BEGIN_NCBI_SCOPE
// sx_Start must begin with "/* O" (see ValidChecksumLine() in checksum.inl)
static const char sx_Start[]     = "/* Original file checksum: ";
static const char sx_End[]       = " */";
static const char sx_LineCount[] = "lines: ";
static const char sx_CharCount[] = "chars: ";
CChecksum::CChecksum(EMethod method)
    : m_LineCount(0), m_CharCount(0), m_Method(method)
{
    switch ( GetMethod() ) {
    case eCRC32:
        InitTables();
        m_Checksum.m_CRC32 = 0;
        break;
    case eMD5:
        m_Checksum.m_MD5 = new CMD5;
        break;
    default:
        break;
    }
}
CChecksum::CChecksum(const CChecksum& cks)
    : m_LineCount(cks.m_LineCount), m_CharCount(cks.m_CharCount),
      m_Method(cks.m_Method)
{
    switch ( GetMethod() ) {
    case eCRC32:
        m_Checksum.m_CRC32 = cks.m_Checksum.m_CRC32;
        break;
    case eMD5:
        m_Checksum.m_MD5 = new CMD5(*cks.m_Checksum.m_MD5);
        break;
    default:
        break;
    }
}
CChecksum::~CChecksum()
{
    x_Free();
}
void CChecksum::x_Free()
{
    switch ( GetMethod() ) {
    case eMD5:
        delete m_Checksum.m_MD5;
        m_Checksum.m_MD5 = 0;
        break;
    default:
        break;
    }
}
CChecksum& CChecksum::operator= (const CChecksum& cks)
{
    x_Free();
    m_LineCount = cks.m_LineCount;
    m_CharCount = cks.m_CharCount;
    m_Method    = cks.m_Method;
    switch ( GetMethod() ) {
    case eCRC32:
        m_Checksum.m_CRC32 = cks.m_Checksum.m_CRC32;
        break;
    case eMD5:        
        m_Checksum.m_MD5 = new CMD5(*cks.m_Checksum.m_MD5);
        break;
    default:
        break;
    }
    return *this;
}
void CChecksum::Reset()
{
    m_LineCount = 0;
    m_CharCount = 0;
    switch ( GetMethod() ) {
    case eCRC32:
        m_Checksum.m_CRC32 = 0;
        break;
    case eMD5:
        delete m_Checksum.m_MD5;
        m_Checksum.m_MD5 = new CMD5();
        break;
    default:
        break;
    }
}
CNcbiOstream& CChecksum::WriteChecksum(CNcbiOstream& out) const
{
    if ( !Valid() ) {
        return out;
    }
    out << sx_Start <<
        sx_LineCount << m_LineCount << ", " <<
        sx_CharCount << m_CharCount << ", ";
    WriteChecksumData(out);
    return out << sx_End << 'n';
}
bool CChecksum::ValidChecksumLineLong(const char* line, size_t length) const
{
    if ( !Valid() ) {
        return false;
    }
    CNcbiOstrstream buffer;
    WriteChecksum(buffer);
    size_t bufferLength = buffer.pcount() - 1; // do not include 'n'
    if ( bufferLength != length ) {
        return false;
    }
    const char* bufferPtr = buffer.str();
    buffer.freeze(false);
    return memcmp(line, bufferPtr, length) == 0;
}
CNcbiOstream& CChecksum::WriteChecksumData(CNcbiOstream& out) const
{
    switch ( GetMethod() ) {
    case eCRC32:
        return out << "CRC32: " << hex << setprecision(8)
                   << m_Checksum.m_CRC32;
    case eMD5:
        return out << "MD5: " << m_Checksum.m_MD5->GetHexSum();
    default:
        return out << "none";
    }
}
void CChecksum::AddChars(const char* str, size_t count)
{
    switch ( GetMethod() ) {
    case eCRC32:
        m_Checksum.m_CRC32 = UpdateCRC32(m_Checksum.m_CRC32, str, count);
        break;
    case eMD5:
        m_Checksum.m_MD5->Update(str, count);
        break;
    default:
        break;
    }
    m_CharCount += count;
}
void CChecksum::NextLine(void)
{
    char eol = 'n';
    switch ( GetMethod() ) {
    case eCRC32:
        m_Checksum.m_CRC32 = UpdateCRC32(m_Checksum.m_CRC32, &eol, 1);
        break;
    case eMD5:
        m_Checksum.m_MD5->Update(&eol, 1);
        break;
    default:
        break;
    }
    ++m_LineCount;
}
//  This code assumes that an unsigned is at least 32 bits wide and
//  that the predefined type char occupies one 8-bit byte of storage.
//  The polynomial used is
//  x^32+x^26+x^23+x^22+x^16+x^12+x^11+x^10+x^8+x^7+x^5+x^4+x^2+x^1+x^0
#define CRC32_POLYNOM 0x04c11db7
Uint4 CChecksum::sm_CRC32Table[256];
void CChecksum::InitTables(void)
{
    if ( sm_CRC32Table[0] == 0 ) {
        for ( size_t i = 0;  i < 256;  ++i ) {
            Uint4 byteCRC = Uint4(i) << 24;
            for ( int j = 0;  j < 8;  ++j ) {
                if ( byteCRC & 0x80000000L )
                    byteCRC = (byteCRC << 1) ^ CRC32_POLYNOM;
                else
                    byteCRC = (byteCRC << 1);
            }
            sm_CRC32Table[i] = byteCRC;
        }
    }
}
Uint4 CChecksum::UpdateCRC32(Uint4 checksum, const char *str, size_t count)
{
    for ( size_t j = 0;  j < count;  ++j ) {
        size_t tableIndex = (int(checksum >> 24) ^ *str++) & 0xff;
        checksum = ((checksum << 8) ^ sm_CRC32Table[tableIndex]) & 0xffffffff;
    }
    return checksum;
}
CChecksum ComputeFileChecksum(const string& path, CChecksum::EMethod method)
{
    CNcbiIfstream input(path.c_str(), IOS_BASE::in | IOS_BASE::binary);
    CChecksum cks(method);
    return ComputeFileChecksum(path, cks);
}
CChecksum& ComputeFileChecksum(const string& path,
                               CChecksum& checksum)
{
    CNcbiIfstream input(path.c_str(), IOS_BASE::in | IOS_BASE::binary);
    if ( !input.is_open() ) {
        return checksum;
    }
    while ( !input.eof() ) {
        char buf[1024*4];
        input.read(buf, sizeof(buf));
        size_t count = input.gcount();
        if ( count ) {
            checksum.AddChars(buf, count);
        }
    }
    input.close();
    return checksum;
}
END_NCBI_SCOPE
/*
 * ===========================================================================
 * $Log: checksum.cpp,v $
 * Revision 1000.1  2004/06/01 19:39:56  gouriano
 * PRODUCTION: UPGRADED [GCC34_MSVC7] Dev-tree R1.11
 *
 * Revision 1.11  2004/05/17 21:06:02  gorelenk
 * Added include of PCH ncbi_pch.hpp
 *
 * Revision 1.10  2003/10/17 20:22:30  kuznets
 * Minor code clean-up.
 * Also increased checksum buffer up to 4K
 * (better performance on Windows and most likely other platforms too)
 *
 * Revision 1.9  2003/10/01 21:15:15  ivanov
 * Get rid of compilation warnings; some formal code rearrangement
 *
 * Revision 1.8  2003/08/11 16:54:20  kuznets
 * Improved Reset() implementation
 *
 * Revision 1.7  2003/08/11 16:47:02  kuznets
 * + Reset() implementation.
 * Fixed memory leak in assignment operator (MD5) mode.
 *
 * Revision 1.6  2003/07/29 21:29:26  ucko
 * Add MD5 support (cribbed from the C Toolkit)
 *
 * Revision 1.5  2003/05/09 14:08:28  ucko
 * ios_base:: -> IOS_BASE:: for gcc 2.9x compatibility
 *
 * Revision 1.4  2003/05/08 19:11:16  kuznets
 * + ComputeFileCRC32
 *
 * Revision 1.3  2001/05/17 15:07:15  lavr
 * Typos corrected
 *
 * Revision 1.2  2001/01/05 20:09:05  vasilche
 * Added util directory for various algorithms and utility classes.
 *
 * Revision 1.1  2000/11/22 16:26:29  vasilche
 * Added generation/checking of checksum to user files.
 *
 * ===========================================================================
 */

						