生物技术

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C/C++

datatool.sh.in：源码内容

							#! /bin/sh
# $Id: datatool.sh.in,v 1000.0 2003/10/29 17:48:43 gouriano Exp $
#
base="${1:-@srcdir@/testdata}"
if test ! -d $base; then
    echo "Error -- test data dir not found: $base"
    exit 1
fi
if test -d "$1"; then
    shift
fi
d="$base/data"
r="$base/res"
tool="datatool"
asn="$base/all.asn"
do_test() {
    eval args=""$1""
    shift
    file="$1"
    shift
    echo "$tool" -m "$asn" $args out "$@"
    cmd=`echo "$tool" -m "$asn" $args out "$@"`
    time $cmd
    if test "$?" != 0; then
        echo "datatool failed!"
        exit 1
    fi
    cmp out "$r/$file"
    if test "$?" != 0; then
        echo "wrong result!"
        exit 1
    fi
    rm out
}
for i in "-t Seq-entry -d $d/set.bin" "-v $d/set.ent" "-vx $d/set.xml"; do
    do_test "$i -e" set.bin "$@"
    do_test "$i -p" set.ent "$@"
    do_test "$i -px" set.xml "$@"
done
echo "Done!"
# 
#  ===========================================================================
#  PRODUCTION $Log: datatool.sh.in,v $
#  PRODUCTION Revision 1000.0  2003/10/29 17:48:43  gouriano
#  PRODUCTION PRODUCTION: IMPORTED [ORIGINAL] Dev-tree R1.6
#  PRODUCTION
#  ===========================================================================
# 

						