生物技术

开发平台：
C/C++

moduleset.cpp：源码内容
							/*
 * ===========================================================================
 * PRODUCTION $Log: moduleset.cpp,v $
 * PRODUCTION Revision 1000.1  2004/06/01 19:43:23  gouriano
 * PRODUCTION PRODUCTION: UPGRADED [GCC34_MSVC7] Dev-tree R1.35
 * PRODUCTION
 * ===========================================================================
 */
/*  $Id: moduleset.cpp,v 1000.1 2004/06/01 19:43:23 gouriano Exp $
* ===========================================================================
*
*                            PUBLIC DOMAIN NOTICE
*               National Center for Biotechnology Information
*
*  This software/database is a "United States Government Work" under the
*  terms of the United States Copyright Act.  It was written as part of
*  the author's official duties as a United States Government employee and
*  thus cannot be copyrighted.  This software/database is freely available
*  to the public for use. The National Library of Medicine and the U.S.
*  Government have not placed any restriction on its use or reproduction.
*
*  Although all reasonable efforts have been taken to ensure the accuracy
*  and reliability of the software and data, the NLM and the U.S.
*  Government do not and cannot warrant the performance or results that
*  may be obtained by using this software or data. The NLM and the U.S.
*  Government disclaim all warranties, express or implied, including
*  warranties of performance, merchantability or fitness for any particular
*  purpose.
*
*  Please cite the author in any work or product based on this material.
*
* ===========================================================================
*
* Author: Eugene Vasilchenko
*
* File Description:
*   Set of modules: equivalent of ASN.1 source file
*
* ---------------------------------------------------------------------------
* $Log: moduleset.cpp,v $
* Revision 1000.1  2004/06/01 19:43:23  gouriano
* PRODUCTION: UPGRADED [GCC34_MSVC7] Dev-tree R1.35
*
* Revision 1.35  2004/05/17 21:03:14  gorelenk
* Added include of PCH ncbi_pch.hpp
*
* Revision 1.34  2003/05/14 14:42:22  gouriano
* added generation of XML schema
*
* Revision 1.33  2003/03/11 20:06:47  kuznets
* iterate -> ITERATE
*
* Revision 1.32  2003/03/10 18:55:18  gouriano
* use new structured exceptions (based on CException)
*
* Revision 1.31  2001/05/17 15:07:12  lavr
* Typos corrected
*
* Revision 1.30  2001/02/02 16:20:01  vasilche
* Fixed file path processing on Mac
*
* Revision 1.29  2000/11/29 17:42:45  vasilche
* Added CComment class for storing/printing ASN.1/XML module comments.
* Added srcutil.hpp file to reduce file dependency.
*
* Revision 1.28  2000/11/15 20:34:55  vasilche
* Added user comments to ENUMERATED types.
* Added storing of user comments to ASN.1 module definition.
*
* Revision 1.27  2000/11/14 21:41:25  vasilche
* Added preserving of ASN.1 definition comments.
*
* Revision 1.26  2000/11/08 17:02:51  vasilche
* Added generation of modular DTD files.
*
* Revision 1.25  2000/09/26 17:38:26  vasilche
* Fixed incomplete choiceptr implementation.
* Removed temporary comments.
*
* Revision 1.24  2000/08/25 15:59:22  vasilche
* Renamed directory tool -> datatool.
*
* Revision 1.23  2000/07/10 17:32:00  vasilche
* Macro arguments made more clear.
* All old ASN stuff moved to serialasn.hpp.
* Changed prefix of enum info functions to GetTypeInfo_enum_.
*
* Revision 1.22  2000/06/16 20:01:30  vasilche
* Avoid use of unexpected_exception() which is unimplemented on Mac.
*
* Revision 1.21  2000/05/24 20:09:29  vasilche
* Implemented DTD generation.
*
* Revision 1.20  2000/04/07 19:26:29  vasilche
* Added namespace support to datatool.
* By default with argument -oR datatool will generate objects in namespace
* NCBI_NS_NCBI::objects (aka ncbi::objects).
* Datatool's classes also moved to NCBI namespace.
*
* Revision 1.19  2000/03/15 21:24:12  vasilche
* Error diagnostic about ambiguous types made more clear.
*
* Revision 1.18  2000/02/01 21:48:03  vasilche
* Added CGeneratedChoiceTypeInfo for generated choice classes.
* Removed CMemberInfo subclasses.
* Added support for DEFAULT/OPTIONAL members.
* Changed class generation.
* Moved datatool headers to include/internal/serial/tool.
*
* Revision 1.17  1999/12/30 21:33:40  vasilche
* Changed arguments - more structured.
* Added intelligence in detection of source directories.
*
* Revision 1.16  1999/12/28 18:55:59  vasilche
* Reduced size of compiled object files:
* 1. avoid inline or implicit virtual methods (especially destructors).
* 2. avoid std::string's methods usage in inline methods.
* 3. avoid string literals ("xxx") in inline methods.
*
* Revision 1.15  1999/12/21 17:18:36  vasilche
* Added CDelayedFostream class which rewrites file only if contents is changed.
*
* Revision 1.14  1999/12/20 21:00:19  vasilche
* Added generation of sources in different directories.
*
* Revision 1.13  1999/11/15 19:36:17  vasilche
* Fixed warnings on GCC
*
* ===========================================================================
*/
#include <ncbi_pch.hpp>
#include <typeinfo>
#include <serial/datatool/moduleset.hpp>
#include <serial/datatool/module.hpp>
#include <serial/datatool/type.hpp>
#include <serial/datatool/exceptions.hpp>
#include <serial/datatool/fileutil.hpp>
BEGIN_NCBI_SCOPE
CFileModules::CFileModules(const string& name)
    : m_SourceFileName(name)
{
}
void CFileModules::AddModule(const AutoPtr<CDataTypeModule>& module)
{
    module->SetModuleContainer(this);
    CDataTypeModule*& mptr = m_ModulesByName[module->GetName()];
    if ( mptr ) {
        ERR_POST(GetSourceFileName() << ": duplicate module: " <<
                 module->GetName());
    }
    else {
        mptr = module.get();
        m_Modules.push_back(module);
    }
}
bool CFileModules::Check(void) const
{
    bool ok = true;
    ITERATE ( TModules, mi, m_Modules ) {
        if ( !(*mi)->Check() )
            ok = false;
    }
    return ok;
}
bool CFileModules::CheckNames(void) const
{
    bool ok = true;
    ITERATE ( TModules, mi, m_Modules ) {
        if ( !(*mi)->CheckNames() )
            ok = false;
    }
    return ok;
}
void CFileModules::PrintASN(CNcbiOstream& out) const
{
    ITERATE ( TModules, mi, m_Modules ) {
        (*mi)->PrintASN(out);
    }
    m_LastComments.PrintASN(out, 0, CComments::eMultiline);
}
void CFileModules::PrintDTD(CNcbiOstream& out) const
{
    ITERATE ( TModules, mi, m_Modules ) {
        (*mi)->PrintDTD(out);
    }
    m_LastComments.PrintDTD(out, CComments::eMultiline);
}
void CFileModules::PrintDTDModular(void) const
{
    ITERATE ( TModules, mi, m_Modules ) {
        string fileNameBase = (*mi)->GetDTDFileNameBase();
        {
            string fileName = fileNameBase + ".mod";
            CNcbiOfstream out(fileName.c_str());
            (*mi)->PrintDTD(out);
            if ( !out )
                ERR_POST(Fatal << "Cannot write to file "<<fileName);
        }
        {
            string fileName = fileNameBase + ".dtd";
            CNcbiOfstream out(fileName.c_str());
            (*mi)->PrintDTDModular(out);
            if ( !out )
                ERR_POST(Fatal << "Cannot write to file "<<fileName);
        }
    }
}
// XML schema generator submitted by
// Marc Dumontier, Blueprint initiative, dumontier@mshri.on.ca
void CFileModules::PrintXMLSchema(CNcbiOstream& out) const
{
    out << "<?xml version="1.0" ?>n"
        << "<xs:scheman"
        << "  xmlns:xs="http://www.w3.org/2001/XMLSchema"n"
        << "  xmlns="http://www.ncbi.nlm.nih.gov"n"
        << "  targetNamespace="http://www.ncbi.nlm.nih.gov"n"
        << "  elementFormDefault="qualified"n"
        << "  attributeFormDefault="unqualified">nn";
    ITERATE ( TModules, mi, m_Modules ) {
        (*mi)->PrintXMLSchema(out);
    }
    m_LastComments.PrintDTD(out, CComments::eMultiline);
    out << "</xs:schema>n";
}
const string& CFileModules::GetSourceFileName(void) const
{
    return m_SourceFileName;
}
string CFileModules::GetFileNamePrefix(void) const
{
    if ( MakeFileNamePrefixFromSourceFileName() ) {
        if ( m_PrefixFromSourceFileName.empty() ) {
            m_PrefixFromSourceFileName = DirName(m_SourceFileName);
            if ( !IsLocalPath(m_PrefixFromSourceFileName) ) {
                // path absent or non local
                m_PrefixFromSourceFileName.erase();
                return GetModuleContainer().GetFileNamePrefix();
            }
        }
        _TRACE("file " << m_SourceFileName << ": "" << m_PrefixFromSourceFileName << """);
        if ( UseAllFileNamePrefixes() ) {
            return Path(GetModuleContainer().GetFileNamePrefix(),
                        m_PrefixFromSourceFileName);
        }
        else {
            return m_PrefixFromSourceFileName;
        }
    }
    return GetModuleContainer().GetFileNamePrefix();
}
CDataType* CFileModules::ExternalResolve(const string& moduleName,
                                         const string& typeName,
                                         bool allowInternal) const
{
    // find module definition
    TModulesByName::const_iterator mi = m_ModulesByName.find(moduleName);
    if ( mi == m_ModulesByName.end() ) {
        // no such module
        NCBI_THROW(CNotFoundException,eModule,
                     "module not found: "+moduleName+" for type "+typeName);
    }
    return mi->second->ExternalResolve(typeName, allowInternal);
}
CDataType* CFileModules::ResolveInAnyModule(const string& typeName,
                                            bool allowInternal) const
{
    CResolvedTypeSet types(typeName);
    ITERATE ( TModules, i, m_Modules ) {
        try {
            types.Add((*i)->ExternalResolve(typeName, allowInternal));
        }
        catch ( CAmbiguiousTypes& exc ) {
            types.Add(exc);
        }
        catch ( CNotFoundException& /* ignored */) {
        }
    }
    return types.GetType();
}
void CFileSet::AddFile(const AutoPtr<CFileModules>& moduleSet)
{
    moduleSet->SetModuleContainer(this);
    m_ModuleSets.push_back(moduleSet);
}
void CFileSet::PrintASN(CNcbiOstream& out) const
{
    ITERATE ( TModuleSets, i, m_ModuleSets ) {
        (*i)->PrintASN(out);
    }
}
void CFileSet::PrintDTD(CNcbiOstream& out) const
{
#if 0
    out <<
        "<!-- ======================== -->n"
        "<!-- NCBI DTD                 -->n"
        "<!-- NCBI ASN.1 mapped to XML -->n"
        "<!-- ======================== -->n"
        "n"
        "<!-- Entities used to give specificity to #PCDATA -->n"
        "<!ENTITY % INTEGER '#PCDATA'>n"
        "<!ENTITY % ENUM 'EMPTY'>n"
        "<!ENTITY % BOOLEAN 'EMPTY'>n"
        "<!ENTITY % NULL 'EMPTY'>n"
        "<!ENTITY % REAL '#PCDATA'>n"
        "<!ENTITY % OCTETS '#PCDATA'>n"
        "<!-- ============================================ -->n"
        "n";
#endif
    ITERATE ( TModuleSets, i, m_ModuleSets ) {
        (*i)->PrintDTD(out);
    }
}
void CFileSet::PrintDTDModular(void) const
{
    ITERATE ( TModuleSets, i, m_ModuleSets ) {
        (*i)->PrintDTDModular();
    }
}
// XML schema generator submitted by
// Marc Dumontier, Blueprint initiative, dumontier@mshri.on.ca
void CFileSet::PrintXMLSchema(CNcbiOstream& out) const
{
    ITERATE ( TModuleSets, i, m_ModuleSets ) {
        (*i)->PrintXMLSchema(out);
    }
}
CDataType* CFileSet::ExternalResolve(const string& module, const string& name,
                                     bool allowInternal) const
{
    CResolvedTypeSet types(module, name);
    ITERATE ( TModuleSets, i, m_ModuleSets ) {
        try {
            types.Add((*i)->ExternalResolve(module, name, allowInternal));
        }
        catch ( CAmbiguiousTypes& exc ) {
            types.Add(exc);
        }
        catch ( CNotFoundException& /* ignored */) {
        }
    }
    return types.GetType();
}
CDataType* CFileSet::ResolveInAnyModule(const string& name,
                                        bool allowInternal) const
{
    CResolvedTypeSet types(name);
    ITERATE ( TModuleSets, i, m_ModuleSets ) {
        try {
            types.Add((*i)->ResolveInAnyModule(name, allowInternal));
        }
        catch ( CAmbiguiousTypes& exc ) {
            types.Add(exc);
        }
        catch ( CNotFoundException& /* ignored */) {
        }
    }
    return types.GetType();
}
bool CFileSet::Check(void) const
{
    bool ok = true;
    ITERATE ( TModuleSets, mi, m_ModuleSets ) {
        if ( !(*mi)->Check() )
            ok = false;
    }
    return ok;
}
bool CFileSet::CheckNames(void) const
{
    bool ok = true;
    ITERATE ( TModuleSets, mi, m_ModuleSets ) {
        if ( !(*mi)->CheckNames() )
            ok = false;
    }
    return ok;
}
END_NCBI_SCOPE

						