layout_chooser.cpp
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上传日期:2007-06-13
资源大小:13604k
文件大小:8k
源码类别:

生物技术

开发平台:

C/C++

  1. /*
  2.  * ===========================================================================
  3.  * PRODUCTION $Log: layout_chooser.cpp,v $
  4.  * PRODUCTION Revision 1000.1  2004/06/01 20:43:20  gouriano
  5.  * PRODUCTION PRODUCTION: UPGRADED [GCC34_MSVC7] Dev-tree R1.3
  6.  * PRODUCTION
  7.  * ===========================================================================
  8.  */
  9. /*  $Id: layout_chooser.cpp,v 1000.1 2004/06/01 20:43:20 gouriano Exp $
  10.  * ===========================================================================
  11.  *
  12.  *                            PUBLIC DOMAIN NOTICE
  13.  *               National Center for Biotechnology Information
  14.  *
  15.  *  This software/database is a "United States Government Work" under the
  16.  *  terms of the United States Copyright Act.  It was written as part of
  17.  *  the author's official duties as a United States Government employee and
  18.  *  thus cannot be copyrighted.  This software/database is freely available
  19.  *  to the public for use. The National Library of Medicine and the U.S.
  20.  *  Government have not placed any restriction on its use or reproduction.
  21.  *
  22.  *  Although all reasonable efforts have been taken to ensure the accuracy
  23.  *  and reliability of the software and data, the NLM and the U.S.
  24.  *  Government do not and cannot warrant the performance or results that
  25.  *  may be obtained by using this software or data. The NLM and the U.S.
  26.  *  Government disclaim all warranties, express or implied, including
  27.  *  warranties of performance, merchantability or fitness for any particular
  28.  *  purpose.
  29.  *
  30.  *  Please cite the author in any work or product based on this material.
  31.  *
  32.  * ===========================================================================
  33.  *
  34.  * Authors:  Robert G. Smith
  35.  *
  36.  * File Description:
  37.  *
  38.  */
  39. #include <ncbi_pch.hpp>
  40. #include <gui/config/layout_chooser.hpp>
  41. #include <gui/objutils/layout.hpp>
  42. #include <gui/objutils/feature.hpp>
  43. #include <gui/objutils/alignment.hpp>
  44. #include <gui/objutils/graph.hpp>
  45. #include <gui/config/feat_config.hpp>
  46. BEGIN_NCBI_SCOPE
  47. //
  48. // CLayoutObjectChooser 
  49. //
  50. CLayoutObjectChooser::~CLayoutObjectChooser()
  51. {
  52. }
  53. bool CLayoutObjectChooser::CanMatchFeats() const
  54. {
  55.     return false;
  56. }
  57. bool CLayoutObjectChooser::CanMatchAlignments() const
  58. {
  59.     return false;
  60. }
  61. bool CLayoutObjectChooser::CanMatchGraphs() const
  62. {
  63.     return false;
  64. }
  65. CLayoutObjectChooser* CLayoutObjectChooser::FromString(const string& s)
  66. {
  67.     string classkey, data;
  68.     NStr::SplitInTwo(s, ":", classkey, data);
  69.     if (classkey == CLayoutFeatChooser::GetClassKey()) {
  70.         return new CLayoutFeatChooser;
  71.     } else if (classkey == CLayoutAlignChooser::GetClassKey()) {
  72.         return new CLayoutAlignChooser;
  73.     } else if (classkey == CLayoutGraphChooser::GetClassKey()) {
  74.         return new CLayoutGraphChooser;
  75.     } else if (classkey == CLayoutFeatTypeChooser::GetClassKey()) {
  76.         return new CLayoutFeatTypeChooser(data);
  77.     } else if (classkey == CLayoutFeatTypeListChooser::GetClassKey()) {
  78.         return new CLayoutFeatTypeListChooser(data);
  79.     }
  80.     NCBI_THROW2(CStringException, eConvert, "String is not a CLayoutObjectChooser class: [" + s + "]", 0);
  81.     return NULL;
  82. }
  83. //
  84. // CLayoutFeatChooser 
  85. //
  86. bool CLayoutFeatChooser::Matches(const CLayoutObject* obj) const
  87. {
  88.     const CLayoutFeat* feat = dynamic_cast<const CLayoutFeat*> (obj);
  89.     if (feat == NULL) {
  90.         return false;
  91.     } 
  92.     
  93.     return MatchFeat(*feat);
  94. }
  95. bool CLayoutFeatChooser::CanMatchFeats() const
  96. {
  97.     return true;
  98. }
  99. bool CLayoutFeatChooser::MatchFeat(const CLayoutFeat& feat) const
  100. {
  101.     return true;
  102. }
  103. string CLayoutFeatChooser::ToString() const
  104. {
  105.     return GetClassKey();
  106. }
  107. string CLayoutFeatChooser::GetClassKey()
  108. {
  109.     return "All Features";
  110. }
  111. //
  112. // CLayoutAlignChooser 
  113. //
  114. bool CLayoutAlignChooser::Matches(const CLayoutObject* obj) const
  115. {
  116.     const CLayoutAlign* align = dynamic_cast<const CLayoutAlign*> (obj);
  117.     return align != NULL;
  118. }
  119. bool CLayoutAlignChooser::CanMatchAlignments() const
  120. {
  121.     return true;
  122. }
  123. string CLayoutAlignChooser::ToString() const
  124. {
  125.     return GetClassKey();
  126. }
  127. string CLayoutAlignChooser::GetClassKey()
  128. {
  129.     return "Alignments";
  130. }
  131. //
  132. // CLayoutGraphChooser 
  133. //
  134. bool CLayoutGraphChooser::Matches(const CLayoutObject* obj) const
  135. {
  136.     const CLayoutGraph* graph = dynamic_cast<const CLayoutGraph*> (obj);
  137.     return graph != NULL;
  138. }
  139. bool CLayoutGraphChooser::CanMatchGraphs() const
  140. {
  141.     return true;
  142. }
  143. string CLayoutGraphChooser::ToString() const
  144. {
  145.     return GetClassKey();
  146. }
  147. string CLayoutGraphChooser::GetClassKey()
  148. {
  149.     return "Graphs";
  150. }
  151. //
  152. // CLayoutFeatTypeChooser 
  153. //
  154. CLayoutFeatTypeChooser::CLayoutFeatTypeChooser() :
  155.     m_MatchingType(objects::CSeqFeatData::e_not_set), 
  156.     m_MatchingSubtype(objects::CSeqFeatData::eSubtype_any)
  157. {
  158. }
  159. CLayoutFeatTypeChooser::CLayoutFeatTypeChooser(int type, int subtype) :
  160.     m_MatchingType(type), 
  161.     m_MatchingSubtype(subtype)
  162. {}
  163. CLayoutFeatTypeChooser::CLayoutFeatTypeChooser(const string& data)
  164. {
  165.     const CFeatConfigList& feat_types = *GetFeatConfigList();
  166.     CFeatConfigItem feat_info;
  167.     if (feat_types.GetItemByKey(data, feat_info)) {
  168.         SetMatchingType(feat_info.GetType());
  169.         SetMatchingSubtype(feat_info.GetSubtype());
  170.     } else {
  171.         NCBI_THROW2(CStringException, eConvert, "String is not a feature type: [" + data + "]", 0);
  172.     }
  173. }
  174. bool CLayoutFeatTypeChooser::MatchFeat(const CLayoutFeat& feat) const
  175. {
  176.     if (m_MatchingType == objects::CSeqFeatData::e_not_set) {
  177.         return true;
  178.     } 
  179.     
  180.     const objects::CSeqFeatData& data = feat.GetFeature().GetData();
  181.     
  182.     if (m_MatchingType == data.Which()) {
  183.         if (m_MatchingSubtype == objects::CSeqFeatData::eSubtype_any  ||
  184.             m_MatchingSubtype == data.GetSubtype()) {
  185.             return true;
  186.         }
  187.     }
  188.     return false;
  189. }
  190. int CLayoutFeatTypeChooser::GetMatchingType() const
  191. {
  192.     return m_MatchingType;
  193. }
  194. int CLayoutFeatTypeChooser::GetMatchingSubtype() const
  195. {
  196.     return m_MatchingSubtype;
  197. }
  198. void CLayoutFeatTypeChooser::SetMatchingType(int type)
  199. {
  200.     m_MatchingType = type;
  201. }
  202. void CLayoutFeatTypeChooser::SetMatchingSubtype(int subtype)
  203. {
  204.     m_MatchingSubtype = subtype;
  205. }
  206. string CLayoutFeatTypeChooser::ToString() const
  207. {
  208.     return GetClassKey() + ":" + 
  209.         GetFeatConfigList()->GetStoragekey(m_MatchingType, m_MatchingSubtype);
  210. }
  211. string CLayoutFeatTypeChooser::GetClassKey()
  212. {
  213.     return "Feature";
  214. }
  215. //
  216. // CLayoutFeatTypeListChooser 
  217. //
  218. CLayoutFeatTypeListChooser::CLayoutFeatTypeListChooser()
  219. {
  220. }
  221. CLayoutFeatTypeListChooser::CLayoutFeatTypeListChooser(const string& data)
  222. {
  223.     list<string> dataKeys;
  224.     NStr::Split(data, ":", dataKeys);
  225.     ITERATE(list<string>, key_it, dataKeys) {
  226.         m_MatchTypes.push_back(CLayoutFeatTypeChooser(*key_it));
  227.     }
  228. }
  229. CLayoutFeatTypeListChooser::CLayoutFeatTypeListChooser(const vector<CLayoutFeatTypeChooser>& types) :
  230.     m_MatchTypes(types)
  231. {
  232. }
  233. bool CLayoutFeatTypeListChooser::MatchFeat(const CLayoutFeat& feat) const
  234. {
  235.     ITERATE(vector<CLayoutFeatTypeChooser>, chooser_it, m_MatchTypes) {
  236.         if (chooser_it->MatchFeat(feat)) {
  237.             return true;
  238.         }
  239.     }
  240.     return false;
  241. }
  242. void CLayoutFeatTypeListChooser::AddTypeSubtype(int type, int subtype)
  243. {
  244.     m_MatchTypes.push_back(CLayoutFeatTypeChooser(type, subtype));
  245. }
  246. string CLayoutFeatTypeListChooser::ToString() const
  247. {
  248.     const CFeatConfigList& feat_types = *GetFeatConfigList();
  249.     string myStr = GetClassKey() + ":";
  250.     ITERATE(vector<CLayoutFeatTypeChooser>, typeChooser_it, m_MatchTypes) {
  251.         string feat_key = feat_types.GetStoragekey(typeChooser_it->GetMatchingType(), 
  252.                                                     typeChooser_it->GetMatchingSubtype());
  253.         myStr += feat_key + ";";
  254.     }
  255.     return myStr;
  256. }
  257. string CLayoutFeatTypeListChooser::GetClassKey()
  258. {
  259.     return "FeatureList";
  260. }
  261. END_NCBI_SCOPE
  262. /*
  263.  * ===========================================================================
  264.  * $Log: layout_chooser.cpp,v $
  265.  * Revision 1000.1  2004/06/01 20:43:20  gouriano
  266.  * PRODUCTION: UPGRADED [GCC34_MSVC7] Dev-tree R1.3
  267.  *
  268.  * Revision 1.3  2004/05/21 22:27:40  gorelenk
  269.  * Added PCH ncbi_pch.hpp
  270.  *
  271.  * Revision 1.2  2004/05/03 12:47:44  dicuccio
  272.  * gui/utils ->gui/objutils where needed
  273.  *
  274.  * Revision 1.1  2003/12/30 15:01:57  dicuccio
  275.  * Moved all FLTK code into gui/dialogs/config.  Moved layout_chooser from
  276.  * gui/utils to avoid circular dependency
  277.  *
  278.  * Revision 1.2  2003/12/29 19:26:29  rsmith
  279.  * Add serialization (ToString, from string) to Layout Chooser classes.
  280.  *
  281.  * Revision 1.1  2003/11/26 21:14:51  rsmith
  282.  * Initial checkin
  283.  *
  284.  *
  285.  * ===========================================================================
  286.  */