view_multialign.hpp
上传用户:yhdzpy8989
上传日期:2007-06-13
资源大小:13604k
文件大小:5k
源码类别:

生物技术

开发平台:

C/C++

  1. /*
  2.  * ===========================================================================
  3.  * PRODUCTION $Log: view_multialign.hpp,v $
  4.  * PRODUCTION Revision 1000.1  2004/04/12 19:33:51  gouriano
  5.  * PRODUCTION PRODUCTION: UPGRADED [CATCHUP_003] Dev-tree R1.15
  6.  * PRODUCTION
  7.  * ===========================================================================
  8.  */
  9. #ifndef GUI_CORE_VIEW_ALIGN___VIEW_MULTIALIGN___HPP
  10. #define GUI_CORE_VIEW_ALIGN___VIEW_MULTIALIGN___HPP
  11. /*  $Id: view_multialign.hpp,v 1000.1 2004/04/12 19:33:51 gouriano Exp $
  12.  * ===========================================================================
  13.  *
  14.  *                            PUBLIC DOMAIN NOTICE
  15.  *               National Center for Biotechnology Information
  16.  *
  17.  *  This software/database is a "United States Government Work" under the
  18.  *  terms of the United States Copyright Act.  It was written as part of
  19.  *  the author's official duties as a United States Government employee and
  20.  *  thus cannot be copyrighted.  This software/database is freely available
  21.  *  to the public for use. The National Library of Medicine and the U.S.
  22.  *  Government have not placed any restriction on its use or reproduction.
  23.  *
  24.  *  Although all reasonable efforts have been taken to ensure the accuracy
  25.  *  and reliability of the software and data, the NLM and the U.S.
  26.  *  Government do not and cannot warrant the performance or results that
  27.  *  may be obtained by using this software or data. The NLM and the U.S.
  28.  *  Government disclaim all warranties, express or implied, including
  29.  *  warranties of performance, merchantability or fitness for any particular
  30.  *  purpose.
  31.  *
  32.  *  Please cite the author in any work or product based on this material.
  33.  *
  34.  * ===========================================================================
  35.  *
  36.  * Authors:  Mike DiCuccio
  37.  *
  38.  * File Description:
  39.  *    User-modifiable header file for future extension of Multiple Alignment
  40.  *    viewer for GBENCH.
  41.  */
  42. #include <gui/core/idocument.hpp>
  43. #include <gui/core/iview.hpp>
  44. #include <gui/core/view_menu.hpp>
  45. #include <gui/core/algo_menu.hpp>
  46. #include <gui/plugin/PluginInfo.hpp>
  47. #include <gui/plugin/PluginMessage.hpp>
  48. #include <gui/types.hpp>
  49. #include <gui/widgets/aln_multiple/alnvec_multi_ds.hpp>
  50. #include <gui/widgets/aln_multiple/alnvec_multi_widget.hpp>
  51. #include <FL/Fl.H>
  52. #include <FL/Fl_Group.H>
  53. #include <FL/Fl_Menu_Bar.H> 
  54. #include <FL/Fl_Menu_Button.H> 
  55. #include <FL/Fl_Text_Display.H>
  56. #include <FL/Fl_Tile.H>
  57. #include <FL/Fl_Window.H>
  58. #include "alnview_base.hpp"
  59. #include <memory>
  60. BEGIN_NCBI_SCOPE
  61. #include "view_multialign_.hpp"
  62. END_NCBI_SCOPE
  63. #endif  // GUI_CORE_VIEW_ALIGN___VIEW_MULTIALIGN___HPP
  64. /*
  65.  * ===========================================================================
  66.  * $Log: view_multialign.hpp,v $
  67.  * Revision 1000.1  2004/04/12 19:33:51  gouriano
  68.  * PRODUCTION: UPGRADED [CATCHUP_003] Dev-tree R1.15
  69.  *
  70.  * Revision 1.15  2004/04/07 13:05:10  dicuccio
  71.  * Changed view API - require CPluginMessage instead of CPluginArgSet
  72.  *
  73.  * Revision 1.14  2003/12/22 19:33:16  dicuccio
  74.  * Lots of changes.  Changed to match new APIs in IView.  Added better handling of messages received from other views
  75.  *
  76.  * Revision 1.13  2003/10/30 17:09:08  yazhuk
  77.  * Updated includes
  78.  *
  79.  * Revision 1.12  2003/09/30 20:22:37  dicuccio
  80.  * Exposed marking interface.  Implemented consensus creation
  81.  *
  82.  * Revision 1.11  2003/09/29 15:41:08  dicuccio
  83.  * Deprecated gui/scope.hpp.  Merged gui/core/types.hpp into gui/types.hpp.  Made
  84.  * all menu bars flat (used FL_FLAT_BOX)
  85.  *
  86.  * Revision 1.10  2003/09/12 12:55:41  dicuccio
  87.  * Switched to use Andrey's new viewer.
  88.  *
  89.  * Revision 1.9  2003/09/04 14:54:21  dicuccio
  90.  * Use IDocument instead of CDocument.  Changed APIs to match changes in IView
  91.  *
  92.  * Revision 1.8  2003/06/25 17:03:00  dicuccio
  93.  * Split CPluginHandle into a handle (pointer-to-implementation) and
  94.  * implementation file.  Lots of #include file clean-ups.
  95.  *
  96.  * Revision 1.7  2003/06/20 14:53:52  dicuccio
  97.  * Revised plugin registration - moved GetInfo() into the plugin handler
  98.  *
  99.  * Revision 1.6  2003/06/02 16:06:22  dicuccio
  100.  * Rearranged src/objects/ subtree.  This includes the following shifts:
  101.  *     - src/objects/asn2asn --> arc/app/asn2asn
  102.  *     - src/objects/testmedline --> src/objects/ncbimime/test
  103.  *     - src/objects/objmgr --> src/objmgr
  104.  *     - src/objects/util --> src/objmgr/util
  105.  *     - src/objects/alnmgr --> src/objtools/alnmgr
  106.  *     - src/objects/flat --> src/objtools/flat
  107.  *     - src/objects/validator --> src/objtools/validator
  108.  *     - src/objects/cddalignview --> src/objtools/cddalignview
  109.  * In addition, libseq now includes six of the objects/seq... libs, and libmmdb
  110.  * replaces the three libmmdb? libs.
  111.  *
  112.  * Revision 1.5  2003/05/22 18:50:04  dicuccio
  113.  * Standardized construction, argument specification for all alignment views
  114.  *
  115.  * Revision 1.4  2003/04/24 16:40:38  dicuccio
  116.  * Updated to reflect changes in plugin API.  Added new common alignment view base
  117.  * class - handles notions of creating alignment manager in a standard way
  118.  *
  119.  * Revision 1.3  2003/03/03 18:31:22  dicuccio
  120.  * Deprecated CAlnUtils::GetTitle() in favor of sequence::GetTitle()
  121.  *
  122.  * Revision 1.2  2003/01/13 13:10:08  dicuccio
  123.  * Namespace clean-up.  Retired namespace gui -> converted all to namespace ncbi.
  124.  * Moved all FLUID-generated code into namespace ncbi.
  125.  *
  126.  * Revision 1.1  2002/11/19 17:04:36  dicuccio
  127.  * Initial revision.
  128.  *
  129.  * ===========================================================================
  130.  */