alnview_base.hpp
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上传日期:2007-06-13
资源大小:13604k
文件大小:4k
源码类别:

生物技术

开发平台:

C/C++

  1. /*
  2.  * ===========================================================================
  3.  * PRODUCTION $Log: alnview_base.hpp,v $
  4.  * PRODUCTION Revision 1000.1  2004/04/12 19:33:09  gouriano
  5.  * PRODUCTION PRODUCTION: UPGRADED [CATCHUP_003] Dev-tree R1.5
  6.  * PRODUCTION
  7.  * ===========================================================================
  8.  */
  9. #ifndef GUI_PLUGINS_VIEW_ALIGN___ALNVIEW_BASE__HPP
  10. #define GUI_PLUGINS_VIEW_ALIGN___ALNVIEW_BASE__HPP
  11. /*  $Id: alnview_base.hpp,v 1000.1 2004/04/12 19:33:09 gouriano Exp $
  12.  * ===========================================================================
  13.  *
  14.  *                            PUBLIC DOMAIN NOTICE
  15.  *               National Center for Biotechnology Information
  16.  *
  17.  *  This software/database is a "United States Government Work" under the
  18.  *  terms of the United States Copyright Act.  It was written as part of
  19.  *  the author's official duties as a United States Government employee and
  20.  *  thus cannot be copyrighted.  This software/database is freely available
  21.  *  to the public for use. The National Library of Medicine and the U.S.
  22.  *  Government have not placed any restriction on its use or reproduction.
  23.  *
  24.  *  Although all reasonable efforts have been taken to ensure the accuracy
  25.  *  and reliability of the software and data, the NLM and the U.S.
  26.  *  Government do not and cannot warrant the performance or results that
  27.  *  may be obtained by using this software or data. The NLM and the U.S.
  28.  *  Government disclaim all warranties, express or implied, including
  29.  *  warranties of performance, merchantability or fitness for any particular
  30.  *  purpose.
  31.  *
  32.  *  Please cite the author in any work or product based on this material.
  33.  *
  34.  * ===========================================================================
  35.  *
  36.  * Authors:  Mike DiCuccio
  37.  *
  38.  * File Description:
  39.  *    User-modifiable header for future extension of the alignment
  40.  *    informational viewer for GBENCH.
  41.  */
  42. #include <gui/utils/command.hpp>
  43. #include <gui/core/view.hpp>
  44. #include <objtools/alnmgr/alnvec.hpp>
  45. #include <objects/seqalign/Seq_align.hpp>
  46. #include <objects/seqalign/Seq_align_set.hpp>
  47. BEGIN_NCBI_SCOPE
  48. USING_SCOPE(objects);
  49. class CAlnView : public CView,
  50.                  public CCommandTarget
  51. {
  52. public:
  53.     CAlnView();
  54. protected:
  55.     // the seq-annot we reference
  56.     CConstRef<CSeq_annot> m_AnnotData;
  57. };
  58. END_NCBI_SCOPE
  59. /*
  60.  * ===========================================================================
  61.  * $Log: alnview_base.hpp,v $
  62.  * Revision 1000.1  2004/04/12 19:33:09  gouriano
  63.  * PRODUCTION: UPGRADED [CATCHUP_003] Dev-tree R1.5
  64.  *
  65.  * Revision 1.5  2004/04/07 13:05:10  dicuccio
  66.  * Changed view API - require CPluginMessage instead of CPluginArgSet
  67.  *
  68.  * Revision 1.4  2004/01/08 20:15:57  yazhuk
  69.  * Inherited CAlnView from CCommandTarget
  70.  *
  71.  * Revision 1.3  2003/09/24 18:26:46  dicuccio
  72.  * Large clean-ups to alignment viewers.  Reimplemented data sources and alignment
  73.  * generation mechanism to be more generic.
  74.  *
  75.  * Revision 1.2  2003/06/02 16:06:22  dicuccio
  76.  * Rearranged src/objects/ subtree.  This includes the following shifts:
  77.  *     - src/objects/asn2asn --> arc/app/asn2asn
  78.  *     - src/objects/testmedline --> src/objects/ncbimime/test
  79.  *     - src/objects/objmgr --> src/objmgr
  80.  *     - src/objects/util --> src/objmgr/util
  81.  *     - src/objects/alnmgr --> src/objtools/alnmgr
  82.  *     - src/objects/flat --> src/objtools/flat
  83.  *     - src/objects/validator --> src/objtools/validator
  84.  *     - src/objects/cddalignview --> src/objtools/cddalignview
  85.  * In addition, libseq now includes six of the objects/seq... libs, and libmmdb
  86.  * replaces the three libmmdb? libs.
  87.  *
  88.  * Revision 1.1  2003/04/24 16:39:58  dicuccio
  89.  * Initial revision
  90.  *
  91.  * ===========================================================================
  92.  */
  93. #endif  // GUI_PLUGINS_VIEW_ALIGN___ALNVIEW_BASE__HPP