view_featid.cpp
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上传日期:2007-06-13
资源大小:13604k
文件大小:7k
源码类别:

生物技术

开发平台:

C/C++

  1. /*
  2.  * ===========================================================================
  3.  * PRODUCTION $Log: view_featid.cpp,v $
  4.  * PRODUCTION Revision 1000.2  2004/06/01 21:01:18  gouriano
  5.  * PRODUCTION PRODUCTION: UPGRADED [GCC34_MSVC7] Dev-tree R1.5
  6.  * PRODUCTION
  7.  * ===========================================================================
  8.  */
  9. /*  $Id: view_featid.cpp,v 1000.2 2004/06/01 21:01:18 gouriano Exp $
  10.  * ===========================================================================
  11.  *
  12.  *                            PUBLIC DOMAIN NOTICE
  13.  *               National Center for Biotechnology Information
  14.  *
  15.  *  This software/database is a "United States Government Work" under the
  16.  *  terms of the United States Copyright Act.  It was written as part of
  17.  *  the author's official duties as a United States Government employee and
  18.  *  thus cannot be copyrighted.  This software/database is freely available
  19.  *  to the public for use. The National Library of Medicine and the U.S.
  20.  *  Government have not placed any restriction on its use or reproduction.
  21.  *
  22.  *  Although all reasonable efforts have been taken to ensure the accuracy
  23.  *  and reliability of the software and data, the NLM and the U.S.
  24.  *  Government do not and cannot warrant the performance or results that
  25.  *  may be obtained by using this software or data. The NLM and the U.S.
  26.  *  Government disclaim all warranties, express or implied, including
  27.  *  warranties of performance, merchantability or fitness for any particular
  28.  *  purpose.
  29.  *
  30.  *  Please cite the author in any work or product based on this material.
  31.  *
  32.  * ===========================================================================
  33.  *
  34.  * Authors:  Mike DiCuccio
  35.  *
  36.  * File Description:
  37.  *
  38.  */
  39. #include <ncbi_pch.hpp>
  40. #include "view_featid.hpp"
  41. #include <gui/core/plugin_utils.hpp>
  42. #include <gui/core/version.hpp>
  43. #include <gui/plugin/PluginRequest.hpp>
  44. #include <gui/plugin/PluginCommand.hpp>
  45. #include <gui/plugin/PluginCommandSet.hpp>
  46. #include <gui/plugin/PluginValue.hpp>
  47. #include <objmgr/scope.hpp>
  48. #include <serial/typeinfo.hpp>
  49. #include <objmgr/util/sequence.hpp>
  50. #include <objmgr/util/feature.hpp>
  51. BEGIN_NCBI_SCOPE
  52. USING_SCOPE(objects);
  53. #include "view_featid_.cpp"
  54. void CViewFeatId::GetInfo(CPluginInfo& info)
  55. {
  56.     info.Reset();
  57.     // version info macro
  58.     info.SetInfo(CPluginVersion::eMajor, CPluginVersion::eMinor, 0,
  59.                  string(__DATE__) + " " + string(__TIME__),
  60.                  "CViewFeatId", "Feature IDs",
  61.                  "List of IDs in features", "");
  62.     // command info
  63.     CPluginCommandSet& cmds = info.SetCommands();
  64.     CPluginCommand&    args = cmds.AddViewCommand(eViewCommand_new_view);
  65.     args.AddArgument("feat", "Feature to display",
  66.                      CSeq_feat::GetTypeInfo());
  67. }
  68. CViewFeatId::CViewFeatId(const CPluginMessage& msg, 
  69.                          const string& pool_name)
  70.     : CView()
  71. {
  72.     m_Window.reset(x_CreateWindow());
  73.     // create our dynamic menu managers
  74.     m_AlgoMenuMgr.reset(new CAlgoMenuMgr(m_Menu, "Tools", this));
  75.     m_ViewMenuMgr.reset(new CViewMenuMgr(m_Menu, "View", this, pool_name));
  76.     // decode the argument
  77.     const CPluginCommand& args = msg.GetRequest().GetCommand();
  78.     const CPluginArg& arg = args["feat"];
  79.     const IDocument* doc = arg.GetDocument();
  80.     const CSeq_feat* feat =
  81.         dynamic_cast<const CSeq_feat*> (arg.GetObject());
  82.     // assign to our core components
  83.     if (doc  &&  feat) {
  84.         x_SetDocument(*doc);
  85.         m_Feature.Reset(feat);
  86.     }
  87. }
  88. /**
  89. void CViewFeatId::OnSelectionChanged(const CSelectionBuffer& buf)
  90. {
  91.     m_StatusBar->SetMessage("No features.");
  92.     if ( !m_FeatIdTable  ||  !GetDocument()  ||  &buf == &GetSelBuffer()) {
  93.         return;
  94.     }
  95.     // accept our selections
  96.     SetSelBuffer().Clear();
  97.     m_FeatIdTable->ClearSelections();
  98.     CSelectionBuffer::TSelList sels = buf.DecomposeToPairs();
  99.     ITERATE (CSelectionBuffer::TSelList, iter, sels) {
  100.         const IDocument* doc = iter->m_Document;
  101.         // only accept selections for the current document
  102.         if ( doc != m_Document) {
  103.             continue;
  104.         }
  105.         // only select seq-feat selections
  106.         const CSeq_feat* feat =
  107.             dynamic_cast<const CSeq_feat*>(iter->m_Object.GetPointer());
  108.         if ( !feat ) {
  109.             continue;
  110.         }
  111.         // select!
  112.         SetSelBuffer().AddSelection(doc, *feat);
  113.         m_FeatIdTable->SelectFeature(*feat);
  114.     }
  115.     m_FeatIdTable->redraw();
  116.     // prepare our status bar message
  117.     x_UpdateStatusMessage();
  118.     // reset our menus
  119.     x_UpdateDynMenus();
  120. }
  121. **/
  122. void CViewFeatId::OnDocumentChanged()
  123. {
  124.     x_Update();
  125. }
  126. void CViewFeatId::x_Update()
  127. {
  128.     SetTitle(GetTitle());
  129.     m_StatusBar->SetMessage("No features.");
  130.     if ( !m_FeatIdTable  || !GetDocument() ) {
  131.         return;
  132.     }
  133.     m_FeatIdTable->Update(*m_Feature);
  134.     string str = m_Document->GetShortTitle() + ": ";
  135.     feature::GetLabel(*m_Feature, &str, feature::eBoth,
  136.                       &m_Document->GetScope());
  137.     SetTitle(str);
  138.     // prepare our status bar message
  139.     x_UpdateStatusMessage();
  140.     // update our dynamic menus
  141.     x_UpdateDynMenus();
  142. }
  143. void CViewFeatId::x_UpdateStatusMessage()
  144. {
  145. }
  146. void CViewFeatId::x_UpdateDynMenus()
  147. {
  148.     m_ViewMenuMgr->Clear();
  149.     m_AlgoMenuMgr->Clear();
  150.     m_ViewMenuMgr->AddActiveViews(GetDocument());
  151.     m_ViewMenuMgr->AddNewViews();
  152.     m_AlgoMenuMgr->AddAlgoMenu();
  153. }
  154.     
  155. const string& CViewFeatId::GetTitle() const
  156. {
  157.     static string s_str("Feature ID View");
  158.     return s_str;
  159. }
  160. void CViewFeatId::x_OnHelp()
  161. {
  162. }
  163. void CViewFeatId::x_OnSelChanged()
  164. {
  165.     SetSelBuffer().Clear();
  166.     // find our selected IDs
  167.     for (size_t i = 0;  i < m_FeatIdTable->GetRows();  ++i) {
  168.         if ( !m_FeatIdTable->row_selected(i) ) {
  169.             continue;
  170.         }
  171.         const CSeq_loc* loc = m_FeatIdTable->GetData(i);
  172.         if (loc) {
  173.             SetSelBuffer().AddSelection(GetDocument(), *loc);
  174.         }
  175.     }
  176.     // update our dynamic menus
  177.     x_UpdateDynMenus();
  178.     //...and notify our connected views
  179.     PostSelectionChanged(GetSelBuffer());
  180. }
  181. END_NCBI_SCOPE
  182. /*
  183.  * ===========================================================================
  184.  * $Log: view_featid.cpp,v $
  185.  * Revision 1000.2  2004/06/01 21:01:18  gouriano
  186.  * PRODUCTION: UPGRADED [GCC34_MSVC7] Dev-tree R1.5
  187.  *
  188.  * Revision 1.5  2004/05/21 22:27:49  gorelenk
  189.  * Added PCH ncbi_pch.hpp
  190.  *
  191.  * Revision 1.4  2004/04/16 14:47:27  dicuccio
  192.  * Enabled alignment table view.  Use appropriate ISelection interface for dynamic menus
  193.  *
  194.  * Revision 1.3  2004/04/07 13:05:11  dicuccio
  195.  * Changed view API - require CPluginMessage instead of CPluginArgSet
  196.  *
  197.  * Revision 1.2  2004/01/20 18:17:53  dicuccio
  198.  * Changed to match new API in CTablePanel
  199.  *
  200.  * Revision 1.1  2004/01/13 20:38:47  dicuccio
  201.  * Added new view: feature IDs
  202.  *
  203.  * ===========================================================================
  204.  */