view_taxtree.cpp
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上传日期:2007-06-13
资源大小:13604k
文件大小:5k
源码类别:

生物技术

开发平台:

C/C++

  1. /*
  2.  * ===========================================================================
  3.  * PRODUCTION $Log: view_taxtree.cpp,v $
  4.  * PRODUCTION Revision 1000.2  2004/06/01 21:02:59  gouriano
  5.  * PRODUCTION PRODUCTION: UPGRADED [GCC34_MSVC7] Dev-tree R1.7
  6.  * PRODUCTION
  7.  * ===========================================================================
  8.  */
  9. /*  $Id: view_taxtree.cpp,v 1000.2 2004/06/01 21:02:59 gouriano Exp $
  10.  * ===========================================================================
  11.  *
  12.  *                            PUBLIC DOMAIN NOTICE
  13.  *               National Center for Biotechnology Information
  14.  *
  15.  *  This software/database is a "United States Government Work" under the
  16.  *  terms of the United States Copyright Act.  It was written as part of
  17.  *  the author's official duties as a United States Government employee and
  18.  *  thus cannot be copyrighted.  This software/database is freely available
  19.  *  to the public for use. The National Library of Medicine and the U.S.
  20.  *  Government have not placed any restriction on its use or reproduction.
  21.  *
  22.  *  Although all reasonable efforts have been taken to ensure the accuracy
  23.  *  and reliability of the software and data, the NLM and the U.S.
  24.  *  Government do not and cannot warrant the performance or results that
  25.  *  may be obtained by using this software or data. The NLM and the U.S.
  26.  *  Government disclaim all warranties, express or implied, including
  27.  *  warranties of performance, merchantability or fitness for any particular
  28.  *  purpose.
  29.  *
  30.  *  Please cite the author in any work or product based on this material.
  31.  *
  32.  * ===========================================================================
  33.  *
  34.  * Authors:  Mike DiCuccio
  35.  *
  36.  * File Description:
  37.  *
  38.  */
  39. #include <ncbi_pch.hpp>
  40. #include <gui/core/plugin_utils.hpp>
  41. #include <gui/core/version.hpp>
  42. #include <gui/plugin/PluginRequest.hpp>
  43. #include <gui/plugin/PluginCommand.hpp>
  44. #include <gui/plugin/PluginCommandSet.hpp>
  45. #include <gui/plugin/PluginInfo.hpp>
  46. #include <gui/plugin/PluginValue.hpp>
  47. #include <gui/widgets/tax_tree/tax_tree_ds.hpp>
  48. #include <objects/seq/Bioseq.hpp>
  49. #include <objects/seqloc/Seq_id.hpp>
  50. #include <algorithm>
  51. #include "view_taxtree.hpp"
  52. BEGIN_NCBI_SCOPE
  53. USING_SCOPE(objects);
  54. #include "view_taxtree_.cpp"
  55. EVENT_MAP_RX_BEGIN(CViewTaxTree)
  56.     EVENT_FORWARD(CViewEvent::eSelectionChanged,  m_TaxTree)
  57. EVENT_MAP_RX_END
  58. void CViewTaxTree::GetInfo(CPluginInfo& info)
  59. {
  60.     info.Reset();
  61.     // version info macro
  62.     info.SetInfo(CPluginVersion::eMajor, CPluginVersion::eMinor, 0,
  63.                  string(__DATE__) + " " + string(__TIME__),
  64.                  "CViewTaxTree", "Common Tree",
  65.                  "View a common tree created around the selected sequences",
  66.                  "");
  67.     // command info
  68.     CPluginCommandSet& cmds = info.SetCommands();
  69.     CPluginCommand&    args = cmds.AddViewCommand(eViewCommand_new_view);
  70.     args.AddArgument("ids", "Sequences",
  71.                      CSeq_id::GetTypeInfo(),
  72.                      CPluginArg::TData::e_Array);
  73. }
  74. CViewTaxTree::CViewTaxTree(const CPluginMessage& msg, const string& pool_name)
  75.     : CView()
  76. {
  77.     m_Window.reset(x_CreateWindow());
  78.     const CPluginCommand& args = msg.GetRequest().GetCommand();
  79.     GetArgValue(args["ids"], m_Ids);
  80.     x_SetDocument(*m_Ids.front().first);
  81.     CTaxTreeDS_ObjMgr::TUidVec ids;
  82.     ids.reserve(m_Ids.size());
  83.     ITERATE (plugin_args::TIdList, iter, m_Ids) {
  84.         ids.push_back(iter->second);
  85.     }
  86.     m_DataSource.Reset
  87.         (new CTaxTreeDS_ObjMgr(GetDocument()->GetScope(), ids));
  88.     // create our view menu manager
  89.     //m_ViewMenuMgr.reset(new CViewMenuMgr(m_Menu, "View/New View", this, pool_name));
  90.     m_ViewMenuMgr.reset(new CViewMenuMgr(m_Menu, "View", this, pool_name));
  91.     // setting host for sending events
  92.     m_TaxTree->SetHost(this);
  93. }
  94. void CViewTaxTree::OnDocumentChanged()
  95. {
  96.     m_TaxTree->SetDataSource(*m_DataSource);
  97.     m_TaxTree->SetDisplayMode(CTaxTreeDataSource::eDisplay_Best);
  98.     SetTitle(GetTitle());
  99.     m_Window->redraw();
  100.     if ( !GetSelBuffer() ) {
  101.         ITERATE (plugin_args::TIdList, iter, m_Ids) {
  102.             SetSelBuffer().AddSelection(iter->first, *iter->second);
  103.         }
  104.     }
  105.     m_ViewMenuMgr->AddActiveViews(m_Document);
  106.     m_ViewMenuMgr->AddNewViews();//   (m_Document);
  107. }
  108. const string& CViewTaxTree::GetTitle(void) const
  109. {
  110.     static const string s_Title("Common Tree");
  111.     return s_Title;
  112. }
  113. END_NCBI_SCOPE
  114. /*
  115.  * ===========================================================================
  116.  * $Log: view_taxtree.cpp,v $
  117.  * Revision 1000.2  2004/06/01 21:02:59  gouriano
  118.  * PRODUCTION: UPGRADED [GCC34_MSVC7] Dev-tree R1.7
  119.  *
  120.  * Revision 1.7  2004/05/21 22:27:50  gorelenk
  121.  * Added PCH ncbi_pch.hpp
  122.  *
  123.  * Revision 1.6  2004/05/13 17:35:12  dicuccio
  124.  * Renamed tax tree data source
  125.  *
  126.  * Revision 1.5  2004/04/16 14:47:57  dicuccio
  127.  * Use appropriate ISelection interface for dynamic menus
  128.  *
  129.  * Revision 1.4  2004/04/09 16:53:49  tereshko
  130.  * Added functionality to send/accept selections
  131.  *
  132.  * Revision 1.3  2004/04/07 13:05:11  dicuccio
  133.  * Changed view API - require CPluginMessage instead of CPluginArgSet
  134.  *
  135.  * Revision 1.2  2004/04/01 19:07:15  dicuccio
  136.  * Limit the nodes to the best representative nodes by default
  137.  *
  138.  * Revision 1.1  2003/12/22 19:35:42  dicuccio
  139.  * Updated to match new APIs in IView.  Added taxonomy tree / common tree browser
  140.  *
  141.  * ===========================================================================
  142.  */