view_asn.cpp
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上传日期:2007-06-13
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文件大小:7k
源码类别:

生物技术

开发平台:

C/C++

  1. /*
  2.  * ===========================================================================
  3.  * PRODUCTION $Log: view_asn.cpp,v $
  4.  * PRODUCTION Revision 1000.5  2004/06/01 21:02:27  gouriano
  5.  * PRODUCTION PRODUCTION: UPGRADED [GCC34_MSVC7] Dev-tree R1.9
  6.  * PRODUCTION
  7.  * ===========================================================================
  8.  */
  9. /*  $Id: view_asn.cpp,v 1000.5 2004/06/01 21:02:27 gouriano Exp $
  10.  * ===========================================================================
  11.  *
  12.  *                            PUBLIC DOMAIN NOTICE
  13.  *               National Center for Biotechnology Information
  14.  *
  15.  *  This software/database is a "United States Government Work" under the
  16.  *  terms of the United States Copyright Act.  It was written as part of
  17.  *  the author's official duties as a United States Government employee and
  18.  *  thus cannot be copyrighted.  This software/database is freely available
  19.  *  to the public for use. The National Library of Medicine and the U.S.
  20.  *  Government have not placed any restriction on its use or reproduction.
  21.  *
  22.  *  Although all reasonable efforts have been taken to ensure the accuracy
  23.  *  and reliability of the software and data, the NLM and the U.S.
  24.  *  Government do not and cannot warrant the performance or results that
  25.  *  may be obtained by using this software or data. The NLM and the U.S.
  26.  *  Government disclaim all warranties, express or implied, including
  27.  *  warranties of performance, merchantability or fitness for any particular
  28.  *  purpose.
  29.  *
  30.  *  Please cite the author in any work or product based on this material.
  31.  *
  32.  * ===========================================================================
  33.  *
  34.  * Authors:  Mike DiCuccio
  35.  *
  36.  * File Description:
  37.  *    User-modifiable implementation file for extension of basic text viewer
  38.  */
  39. #include <ncbi_pch.hpp>
  40. #include <gui/core/plugin_utils.hpp>
  41. #include <gui/core/version.hpp>
  42. #include <gui/plugin/PluginRequest.hpp>
  43. #include <gui/plugin/PluginCommand.hpp>
  44. #include <gui/plugin/PluginCommandSet.hpp>
  45. #include <gui/plugin/PluginInfo.hpp>
  46. #include <gui/plugin/PluginValue.hpp>
  47. #include <objects/seq/Bioseq.hpp>
  48. #include <objects/seqset/Seq_entry.hpp>
  49. #include <objmgr/util/sequence.hpp>
  50. #include <serial/serial.hpp>
  51. #include <serial/objostrasn.hpp>
  52. #include <connect/ncbi_conn_stream.hpp>
  53. #include "view_asn.hpp"
  54. BEGIN_NCBI_SCOPE
  55. USING_SCOPE(objects);
  56. #include "view_asn_.cpp"
  57. void CViewAsn::GetInfo(CPluginInfo& info)
  58. {
  59.     info.Reset();
  60.     // version info macro
  61.     info.SetInfo(CPluginVersion::eMajor, CPluginVersion::eMinor, 0,
  62.                  string(__DATE__) + " " + string(__TIME__),
  63.                  "CViewAsn", "Text/ASN.1 Text Format",
  64.                  "ASN.1 Text Viewer", "");
  65.     // command info
  66.     CPluginCommandSet& cmds = info.SetCommands();
  67.     CPluginCommand&    args = cmds.AddViewCommand(eViewCommand_new_view);
  68.     args.AddArgument("id", "Seq-id of the record we wish to display",
  69.                      CSeq_id::GetTypeInfo());
  70. }
  71. CViewAsn::CViewAsn(const CPluginMessage& msg, const string& pool_name)
  72.     : CView()
  73.     , m_CurrentFont(FL_COURIER)
  74.     , m_CurrentFontSize(12)
  75. {
  76.     m_Window.reset(x_CreateWindow());
  77.     m_Buffer.reset(new Fl_Text_Buffer());
  78.     m_Text->buffer(m_Buffer.get());
  79.     m_Text->textfont(m_CurrentFont);
  80.     m_Text->textsize(m_CurrentFontSize);
  81.     m_TextSize->value(1);
  82.     m_TextFont->value(2);
  83.     // create our view menu manager
  84.     m_ViewMenuMgr.reset(new CViewMenuMgr(m_Menu, "View", this, pool_name));
  85.     // decode the argument
  86.     const CPluginCommand& args = msg.GetRequest().GetCommand();
  87.     const CPluginArg& arg = args["id"];
  88.     const IDocument* doc = arg.GetDocument();
  89.     const CSeq_id* id =
  90.         dynamic_cast<const CSeq_id*> (arg.GetObject());
  91.     // assign to our core components
  92.     if (doc  &&  id) {
  93.         x_SetDocument(*doc);
  94.         m_SeqId.Reset(id);
  95.     }
  96. }
  97. CViewAsn::~CViewAsn()
  98. {
  99.     m_Window.reset();
  100.     m_Buffer.reset();
  101. }
  102. void CViewAsn::OnDocumentChanged()
  103. {
  104.     CBioseq_Handle handle =
  105.         m_Document->GetScope().GetBioseqHandle(*m_SeqId);
  106.     string str;
  107.     if (handle) {
  108.         CConn_MemoryStream ostr;
  109.         {{
  110.             auto_ptr<CObjectOStream> os
  111.                 (CObjectOStream::Open(eSerial_AsnText, ostr));
  112.             *os << handle.GetTopLevelSeqEntry();
  113.         }}
  114.         str.resize(ostr.tellp() - CT_POS_TYPE(0));
  115.         ostr.read(const_cast<char*>(str.data()), str.size());
  116.     }
  117.     m_Buffer->text(str.c_str());
  118.     // retrieve a nice title
  119.     SetTitle(x_GetTitle(handle));
  120.     m_Window->redraw();
  121.     if ( !GetSelBuffer() ) {
  122.         SetSelBuffer().AddSelection(m_Document, *m_SeqId);
  123.     }
  124.     m_ViewMenuMgr->AddActiveViews(m_Document);
  125.     m_ViewMenuMgr->AddNewViews();//   (m_Document);
  126. }
  127. const string& CViewAsn::GetTitle(void) const
  128. {
  129.     static string s_str("ASN.1 Text View");
  130.     return s_str;
  131. }
  132. //
  133. // view submenu
  134. //
  135. void CViewAsn::x_OnFontHelvetica()
  136. {
  137.     m_CurrentFont = FL_HELVETICA;
  138.     m_Text->textfont(FL_HELVETICA);
  139.     m_Text->redraw();
  140.     m_TextFont->value(0);
  141.     m_TextFont->redraw();
  142. }
  143. void CViewAsn::x_OnFontTimes()
  144. {
  145.     m_CurrentFont = FL_TIMES;
  146.     m_Text->textfont(FL_TIMES);
  147.     m_Text->redraw();
  148.     m_TextFont->value(1);
  149.     m_TextFont->redraw();
  150. }
  151. void CViewAsn::x_OnFontCourier()
  152. {
  153.     m_CurrentFont = FL_COURIER;
  154.     m_Text->textfont(FL_COURIER);
  155.     m_Text->redraw();
  156.     m_TextFont->value(2);
  157.     m_TextFont->redraw();
  158. }
  159. void CViewAsn::x_OnFontSmall()
  160. {
  161.     m_CurrentFontSize = 10;
  162.     m_Text->textsize(10);
  163.     m_Text->redraw();
  164.     m_TextSize->value(0);
  165.     m_TextSize->redraw();
  166. }
  167. void CViewAsn::x_OnFontNormal()
  168. {
  169.     m_CurrentFontSize = 12;
  170.     m_Text->textsize(12);
  171.     m_Text->redraw();
  172.     m_TextSize->value(1);
  173.     m_TextSize->redraw();
  174. }
  175. void CViewAsn::x_OnFontLarge()
  176. {
  177.     m_CurrentFontSize = 14;
  178.     m_Text->textsize(14);
  179.     m_Text->redraw();
  180.     m_TextSize->value(2);
  181.     m_TextSize->redraw();
  182. }
  183. //
  184. // help submenu
  185. //
  186. void CViewAsn::x_OnHelpTextViewHelp()
  187. {
  188. }
  189. END_NCBI_SCOPE
  190. /*
  191.  * ===========================================================================
  192.  * $Log: view_asn.cpp,v $
  193.  * Revision 1000.5  2004/06/01 21:02:27  gouriano
  194.  * PRODUCTION: UPGRADED [GCC34_MSVC7] Dev-tree R1.9
  195.  *
  196.  * Revision 1.9  2004/05/21 22:27:50  gorelenk
  197.  * Added PCH ncbi_pch.hpp
  198.  *
  199.  * Revision 1.8  2004/04/16 14:47:57  dicuccio
  200.  * Use appropriate ISelection interface for dynamic menus
  201.  *
  202.  * Revision 1.7  2004/04/07 13:05:11  dicuccio
  203.  * Changed view API - require CPluginMessage instead of CPluginArgSet
  204.  *
  205.  * Revision 1.6  2004/02/20 20:03:27  ucko
  206.  * Fix to compile with stricter implementations of CT_POS_TYPE
  207.  *
  208.  * Revision 1.5  2004/01/22 17:44:47  dicuccio
  209.  * Use CConn_MemoryStream instead of CNcbiOstrstream for in-code streaming
  210.  *
  211.  * Revision 1.4  2003/12/22 19:35:39  dicuccio
  212.  * Updated to match new APIs in IView.  Added taxonomy tree / common tree browser
  213.  *
  214.  * Revision 1.3  2003/11/24 15:45:46  dicuccio
  215.  * Renamed CVersion to CPluginVersion
  216.  *
  217.  * Revision 1.2  2003/11/20 13:19:17  dicuccio
  218.  * Fixed calling parameters for views to match new requirements - pass view's message pool name as second param
  219.  *
  220.  * Revision 1.1  2003/11/04 17:27:21  dicuccio
  221.  * Split text views into three components
  222.  *
  223.  * ===========================================================================
  224.  */