lds_loader.hpp
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上传日期:2007-06-13
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文件大小:6k
源码类别:

生物技术

开发平台:

C/C++

  1. /*
  2.  * ===========================================================================
  3.  * PRODUCTION $Log: lds_loader.hpp,v $
  4.  * PRODUCTION Revision 1000.3  2004/06/01 20:58:10  gouriano
  5.  * PRODUCTION PRODUCTION: UPGRADED [GCC34_MSVC7] Dev-tree R1.13
  6.  * PRODUCTION
  7.  * ===========================================================================
  8.  */
  9. #ifndef GUI_PLUGINS_DOC_BASIC___LDS_LOADER__HPP
  10. #define GUI_PLUGINS_DOC_BASIC___LDS_LOADER__HPP
  11. /*  $Id: lds_loader.hpp,v 1000.3 2004/06/01 20:58:10 gouriano Exp $
  12.  * ===========================================================================
  13.  *
  14.  *                            PUBLIC DOMAIN NOTICE
  15.  *               National Center for Biotechnology Information
  16.  *
  17.  *  This software/database is a "United States Government Work" under the
  18.  *  terms of the United States Copyright Act.  It was written as part of
  19.  *  the author's official duties as a United States Government employee and
  20.  *  thus cannot be copyrighted.  This software/database is freely available
  21.  *  to the public for use. The National Library of Medicine and the U.S.
  22.  *  Government have not placed any restriction on its use or reproduction.
  23.  *
  24.  *  Although all reasonable efforts have been taken to ensure the accuracy
  25.  *  and reliability of the software and data, the NLM and the U.S.
  26.  *  Government do not and cannot warrant the performance or results that
  27.  *  may be obtained by using this software or data. The NLM and the U.S.
  28.  *  Government disclaim all warranties, express or implied, including
  29.  *  warranties of performance, merchantability or fitness for any particular
  30.  *  purpose.
  31.  *
  32.  *  Please cite the author in any work or product based on this material.
  33.  *
  34.  * ===========================================================================
  35.  *
  36.  * Authors:  Anatoliy Kuznetsov
  37.  *
  38.  * File Description:
  39.  *    CDataPlugin_LDSLoader - load sequence information from the local data storage(LDS).
  40.  */
  41. #include <gui/core/doc_loader.hpp>
  42. #include <objmgr/scope.hpp>
  43. #include <objtools/lds/lds.hpp>
  44. #include <objtools/lds/lds_set.hpp>
  45. #include <objtools/lds/lds_query.hpp>
  46. BEGIN_NCBI_SCOPE
  47. BEGIN_SCOPE(objects)
  48.   class CLDS_Database;
  49. END_SCOPE(objects)
  50. //////////////////////////////////////////////////////////////////
  51. //
  52. // LDS document loader for Genome Workbench.
  53. //
  54. class CDataPlugin_LDSLoader : public CDocLoader<CDataPlugin_LDSLoader>
  55. {
  56. public:
  57.     CDataPlugin_LDSLoader();
  58.     ~CDataPlugin_LDSLoader();
  59.     // load a given document
  60.     void Load(objects::CPluginMessage& msg);
  61.     // Search command
  62.     void Search(objects::CPluginMessage& msg);
  63.     static void GetInfo(objects::CPluginInfo& info);
  64. private:
  65.     // Open document, return "TRUE" if success, insert loaded object's id 
  66.     // into the obj_read set
  67.     bool x_LoadLDS_BioTSE(int                     object_id,
  68.                           objects::CLDS_Database* db, 
  69.                           objects::CLDS_Set*      obj_read,
  70.                           objects::CPluginReply&  reply);
  71.     // Open document, return "TRUE" if success, insert loaded object's id 
  72.     // into the obj_read set
  73.     bool x_LoadLDS_Annot(const objects::CLDS_Query::SObjectDescr& obj_descr,
  74.                          objects::CLDS_Database*                  db,  
  75.                          objects::CLDS_Set*                       obj_read,
  76.                          objects::CPluginReply&                   reply);
  77.     // Check the object type, if it's one of the known ones, load it as a 
  78.     // molecule or an annotation
  79.     bool x_Load(const objects::CLDS_Query::SObjectDescr& obj_descr,
  80.                 objects::CLDS_Database*                  db,
  81.                 objects::CLDS_Set*                       obj_read,
  82.                 objects::CPluginReply&                   reply);
  83. private:
  84.     objects::CLDS_DatabaseHolder*  m_DbHolder;
  85. };
  86. END_NCBI_SCOPE
  87. /*
  88.  * ===========================================================================
  89.  * $Log: lds_loader.hpp,v $
  90.  * Revision 1000.3  2004/06/01 20:58:10  gouriano
  91.  * PRODUCTION: UPGRADED [GCC34_MSVC7] Dev-tree R1.13
  92.  *
  93.  * Revision 1.13  2004/05/25 17:21:59  dicuccio
  94.  * Modified class names.  Fonts to 12 point
  95.  *
  96.  * Revision 1.12  2003/11/18 17:49:02  dicuccio
  97.  * Added standard processing of return values
  98.  *
  99.  * Revision 1.11  2003/11/06 20:12:15  dicuccio
  100.  * Cleaned up handling of USING_SCOPE - removed from all headers
  101.  *
  102.  * Revision 1.10  2003/11/04 17:49:25  dicuccio
  103.  * Changed calling parameters for plugins - pass CPluginMessage instead of paired
  104.  * CPluginCommand/CPluginReply
  105.  *
  106.  * Revision 1.9  2003/10/28 14:21:01  kuznets
  107.  * Chages to lds loader to support multiple LDS databases
  108.  *
  109.  * Revision 1.8  2003/09/29 15:39:10  dicuccio
  110.  * Header file clean-up.  Deprecated gui/scope.hpp and gui/core/types.hpp.  Added
  111.  * GenBank data loader management dialog
  112.  *
  113.  * Revision 1.7  2003/08/07 20:31:35  kuznets
  114.  * Implemented document opening based on lds_search_dlg selection
  115.  *
  116.  * Revision 1.6  2003/08/05 17:16:25  kuznets
  117.  * Changes to improve code reuse between loaders + CLDS_Database passed as the
  118.  * construction parameter to the lds search dialog
  119.  *
  120.  * Revision 1.5  2003/07/15 17:57:08  kuznets
  121.  * Added annotaion/alignment search capabilities
  122.  *
  123.  * Revision 1.4  2003/07/14 11:17:00  shomrat
  124.  * Plugin messageing system related changes
  125.  *
  126.  * Revision 1.3  2003/07/01 19:29:14  kuznets
  127.  * Open command implementation
  128.  *
  129.  * Revision 1.2  2003/06/20 14:52:57  dicuccio
  130.  * Revised plugin registration - moved GetInfo() into the plugin handler
  131.  *
  132.  * Revision 1.1  2003/06/17 20:16:09  kuznets
  133.  * Initial revision.
  134.  *
  135.  *
  136.  * ===========================================================================
  137.  */
  138. #endif  // GUI_PLUGINS_DOC_BASIC___LDS_LOADER__HPP