生物技术

开发平台：
C/C++

entrez_search.cpp：源码内容
							/*
 * ===========================================================================
 * PRODUCTION $Log: entrez_search.cpp,v $
 * PRODUCTION Revision 1000.0  2004/06/01 21:26:50  gouriano
 * PRODUCTION PRODUCTION: IMPORTED [GCC34_MSVC7] Dev-tree R1.1
 * PRODUCTION
 * ===========================================================================
 */
/*  $Id: entrez_search.cpp,v 1000.0 2004/06/01 21:26:50 gouriano Exp $
 * ===========================================================================
 *
 *                            PUBLIC DOMAIN NOTICE
 *               National Center for Biotechnology Information
 *
 *  This software/database is a "United States Government Work" under the
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 *
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 *  purpose.
 *
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 *
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 *
 * Authors:  Mike DiCuccio
 *
 * File Description:
 *    CDataPlugin_EntrezSearch - load sequence information form Genbank.
 */
#include <ncbi_pch.hpp>
#include "entrez_search.hpp"
#include "entrez_search_dlg.hpp"
#include <gui/core/version.hpp>
#include <gui/core/plugin_utils.hpp>
#include <gui/plugin/PluginCommandSet.hpp>
#include <gui/plugin/PluginInfo.hpp>
#include <gui/plugin/PluginValue.hpp>
#include <gui/utils/message_box.hpp>
BEGIN_NCBI_SCOPE
USING_SCOPE(objects);
//
// class CDataPlugin_EntrezSearchException defines some internal exception types used in
// processing files.
//
// This class is used internally to avoid an ad-hoc exception mechanism;
// currently, it reports only errors concerning invalid format types.
//
class CDataPlugin_EntrezSearchException : EXCEPTION_VIRTUAL_BASE public CException
{
public:
    // Enumerated list of exception types
    enum EErrCode {
        eInvalidId
    };
    // Convert an enuerated exception to a human-readable string representation
    // of this exception.
    virtual const char* GetErrCodeString(void) const
    {
        switch (GetErrCode()) {
        case eInvalidId:        return "eInvalidId";
        default:                return CException::GetErrCodeString();
        }
    }
    // constructor boilerplate
    NCBI_EXCEPTION_DEFAULT(CDataPlugin_EntrezSearchException, CException);
};
void CDataPlugin_EntrezSearch::GetInfo(CPluginInfo& info)
{
    info.Reset();
    // version info macro
    info.SetInfo(CPluginVersion::eMajor, CPluginVersion::eMinor, 0,
                 string(__DATE__) + " " + string(__TIME__),
                 "CDataPlugin_EntrezSearch", "GenBank (Nucleotide\/Protein\/Genome)",
                 "Search public GenBank records", "");
    // command info
    CPluginCommandSet& cmds     = info.SetCommands();
    CPluginCommand& search_args = cmds.AddDataCommand(eDataCommand_search);
    {{
        CPluginArg& arg = 
            search_args.AddArgument("query", "Search string",
                                    CPluginArg::eString);
        arg.SetHidden(true);
    }}
    {{
        CPluginArg& arg = 
            search_args.AddArgument("db", "Database to search",
                                    CPluginArg::eString);
        arg.SetHidden(true);
    }}
}
CDataPlugin_EntrezSearch::CDataPlugin_EntrezSearch()
{
}
CDataPlugin_EntrezSearch::~CDataPlugin_EntrezSearch()
{
}
//
// load a record from Genbank into a fully-prepared document
//
void CDataPlugin_EntrezSearch::Search(CPluginMessage& msg)
{
    const CPluginCommand& args = msg.GetRequest().GetCommand();
    CPluginReply& reply = msg.SetReply();
    reply.SetStatus(eMessageStatus_success);
    if ( !m_Dialog.get() ) {
        m_Dialog.reset(new CEntrezSearchDlg());
    }
    if (args.HasArgument("query")  &&  CPluginUtils::IsValid(args["query"])) {
        string query = args["query"].AsString();
        m_Dialog->SetQuery(query);
    }
    if (args.HasArgument("db")  &&  CPluginUtils::IsValid(args["db"])) {
        string db = args["db"].AsString();
        m_Dialog->SetDB(db);
    }
    m_Dialog->Show();
}
END_NCBI_SCOPE
/*
 * ===========================================================================
 * $Log: entrez_search.cpp,v $
 * Revision 1000.0  2004/06/01 21:26:50  gouriano
 * PRODUCTION: IMPORTED [GCC34_MSVC7] Dev-tree R1.1
 *
 * Revision 1.1  2004/05/25 17:15:39  dicuccio
 * Initial revision - moved over from old GenBank search
 *
 * Revision 1.7  2003/12/22 19:29:20  dicuccio
 * Added explicit passing of query string and database
 *
 * Revision 1.6  2003/12/04 18:14:07  dicuccio
 * Lots of updates.  Added a status bar to track actions.  General code-clean-up
 *
 * Revision 1.5  2003/11/24 15:45:34  dicuccio
 * Renamed CVersion to CPluginVersion
 *
 * Revision 1.4  2003/11/04 17:49:24  dicuccio
 * Changed calling parameters for plugins - pass CPluginMessage instead of paired
 * CPluginCommand/CPluginReply
 *
 * Revision 1.3  2003/10/07 13:47:05  dicuccio
 * Renamed CPluginURL* to CPluginValue*
 *
 * Revision 1.2  2003/08/01 14:37:20  dicuccio
 * Solved issue with plugin communication - make sure that sequences are loaded
 * when the load button is clicked, not when the dialog closes
 *
 * Revision 1.1  2003/07/31 17:04:00  dicuccio
 * Added GenBank search
 *
 * Revision 1.22  2003/07/14 11:16:52  shomrat
 * Plugin messageing system related changes
 *
 * Revision 1.21  2003/06/25 17:02:58  dicuccio
 * Split CPluginHandle into a handle (pointer-to-implementation) and
 * implementation file.  Lots of #include file clean-ups.
 *
 * Revision 1.20  2003/06/20 14:52:57  dicuccio
 * Revised plugin registration - moved GetInfo() into the plugin handler
 *
 * Revision 1.19  2003/06/02 16:06:22  dicuccio
 * Rearranged src/objects/ subtree.  This includes the following shifts:
 *     - src/objects/asn2asn --> arc/app/asn2asn
 *     - src/objects/testmedline --> src/objects/ncbimime/test
 *     - src/objects/objmgr --> src/objmgr
 *     - src/objects/util --> src/objmgr/util
 *     - src/objects/alnmgr --> src/objtools/alnmgr
 *     - src/objects/flat --> src/objtools/flat
 *     - src/objects/validator --> src/objtools/validator
 *     - src/objects/cddalignview --> src/objtools/cddalignview
 * In addition, libseq now includes six of the objects/seq... libs, and libmmdb
 * replaces the three libmmdb? libs.
 *
 * Revision 1.18  2003/05/30 14:15:42  dicuccio
 * Renamed MessageBox to NcbiMessageBox because brain-dead MSVC thinks this is
 * ::MessageBox and rewrites the symbol as MessageBoxA, which results in an
 * unresolved external and conflict with the Win32 API :(.
 *
 * Revision 1.17  2003/05/30 13:10:37  dicuccio
 * Use MessageBox() instead of fl_alter()
 *
 * Revision 1.16  2003/05/19 13:40:44  dicuccio
 * Moved gui/core/plugin/ -> gui/plugin/.  Merged core libraries into libgui_core.
 * Removed old, unused dialog box.
 *
 * Revision 1.15  2003/05/01 12:54:34  dicuccio
 * Changed a useful trace -> log post for failure to load accession
 *
 * Revision 1.14  2003/04/29 14:52:31  dicuccio
 * Deprecated old accession entry dialog.  Added correct plugin argument to specify accession names
 *
 * Revision 1.13  2003/04/24 16:39:08  dicuccio
 * Updated to reflect changes in plugin API.  Changed location of document
 * marshal from framework to plugin
 *
 * Revision 1.12  2003/02/26 14:26:56  dicuccio
 * Removed unnecessary _TRACE() statements
 *
 * Revision 1.11  2003/02/24 13:03:16  dicuccio
 * Renamed classes in plugin spec:
 *     CArgSeg --> CPluginArgSet
 *     CArgument --> CPluginArg
 *     CPluginArgs --> CPluginCommand
 *     CPluginCommands --> CPluginCommandSet
 *
 * Revision 1.10  2003/02/20 19:49:56  dicuccio
 * Created new plugin architecture, based on ASN.1 spec.  Moved GBENCH
 * frameowrk over to use new plugin architecture.
 *
 * Revision 1.9  2003/02/06 18:48:36  dicuccio
 * Made 'catch (...)' conditional for non-debug builds
 *
 * Revision 1.8  2003/01/15 21:08:34  dicuccio
 * Removed dead _TRACE() statements
 *
 * Revision 1.7  2003/01/13 13:10:07  dicuccio
 * Namespace clean-up.  Retired namespace gui -> converted all to namespace
 * ncbi.  Moved all FLUID-generated code into namespace ncbi.
 *
 * Revision 1.6  2003/01/03 17:25:50  dicuccio
 * Fixed (finally!) issues regarding input validation of seq-ids.
 *
 * Revision 1.5  2002/12/30 18:44:20  dicuccio
 * Fixed a number of buglets in accession dialog and in handling of empty
 * accessions.
 *
 * Revision 1.4  2002/12/30 17:48:28  dicuccio
 * Added mechanism for data loader plugins to announce supported modes of
 * operation (load, import, save currently)
 *
 * Revision 1.3  2002/12/20 19:17:58  dicuccio
 * Added better handling of sueqnece ID errors (try not to segfault...)
 *
 * Revision 1.2  2002/12/12 15:22:38  dicuccio
 * Minot tweak to avoid a compiler warning.
 *
 * Revision 1.1  2002/11/25 20:51:01  dicuccio
 * Initial revision.
 *
 * ===========================================================================
 */

						