生物技术

开发平台：
C/C++

web_algo_init.cpp：源码内容
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 * PRODUCTION $Log: web_algo_init.cpp,v $
 * PRODUCTION Revision 1000.3  2004/06/01 20:56:16  gouriano
 * PRODUCTION PRODUCTION: UPGRADED [GCC34_MSVC7] Dev-tree R1.8
 * PRODUCTION
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 */
/*  $Id: web_algo_init.cpp,v 1000.3 2004/06/01 20:56:16 gouriano Exp $
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 *
 *                            PUBLIC DOMAIN NOTICE
 *               National Center for Biotechnology Information
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 *
 *  Please cite the author in any work or product based on this material.
 *
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 *
 * Authors:  Josh Cherry
 *
 * File Description:  Auto-run plugin to initialize
 *                    "web algorithms"
 *
 */
#include <ncbi_pch.hpp>
#include <objmgr/object_manager.hpp>
#include <gui/core/idocument.hpp>
#include <gui/core/plugin_utils.hpp>
#include <gui/core/doc_manager.hpp>
#include <gui/core/version.hpp>
#include <gui/plugin/PluginInfo.hpp>
#include <gui/plugin/PluginCommandSet.hpp>
#include <gui/plugin/PluginCommand.hpp>
#include <corelib/ncbifile.hpp>
#include <corelib/ncbiapp.hpp>
#include <corelib/ncbireg.hpp>
#include <gui/core/plugin_registry.hpp>
#include <gui/core/algo_factory.hpp>
#include <gui/utils/system_path.hpp>
#include "web_algo_init.hpp"
#include "web_algo.hpp"
#include <serial/objistr.hpp>
#include <serial/objistrasn.hpp>
#include <serial/objistrasnb.hpp>
#include <serial/objistrxml.hpp>
#include <serial/serial.hpp>
#include <gui/utils/fetch_url.hpp>
#include "plugin_info_from_reg.hpp"
BEGIN_NCBI_SCOPE
USING_SCOPE(objects);
void CAlgoWebServiceInit::GetInfo(CPluginInfo& info)
{
    info.Reset();
    // version info macro
    info.SetInfo(CPluginVersion::eMajor, CPluginVersion::eMinor, 0,
                 string(__DATE__) + " " + string(__TIME__),
                 "CAlgoWebServiceInit", "", "", "");
    // command info
    info.SetCommands().AddAlgoCommand(eAlgoCommand_run);
    info.SetAutorun(true);
}
// one instance of algo factory for all web algos
static CAlgoFactory<CAlgoWebService> s_AlgoFactory_CAlgoWebService;
void CAlgoWebServiceInit::RunCommand(CPluginMessage& msg)
{
    CPluginReply& reply = msg.SetReply();
    string dir;
    // load web algo plugins
    x_LoadWebPlugins("<std>, <home>");
    reply.SetStatus(eMessageStatus_success);
}
void CAlgoWebServiceInit::x_LoadWebPlugins(const string& path)
{
    list<string> paths;
    NStr::Split(path, ", tnr", paths);
    ITERATE (list<string>, iter, paths) {
        string fname;
        if (*iter == "<std>") {
            fname = CSystemPath::ResolvePath(*iter, "etc/algo_urls");
        } else if (*iter == "<home>") {
            fname = CSystemPath::ResolvePath(*iter, "algo_urls");
        } else {
            fname = CSystemPath::ResolvePath(*iter, "");
        }
        if (fname.empty()) {
            continue;
        }
        
        CFile file(fname);
        if (!file.Exists()) {
            _TRACE("File " << fname << " does not exist");
            continue;
        }
        CNcbiIfstream is(fname.c_str());
        vector<string> urls;
        string line;
        while(getline(is, line)) {
            line = NStr::TruncateSpaces(line);
            if (line.empty() || line[0] == '#') {
                // skip blank lines and lines starting with '#'
                continue;
            }
            urls.push_back(line);
        }
        ITERATE (vector<string>, url, urls) {
            //
            // get PluginInfo by retrieving url
            //
            string std_in, std_out, std_err;
            vector<string> arguments;
            CFetchURL::Fetch(*url + "?action=info", std_out);
            CNcbiIstrstream istr(std_out.c_str());
            vector<CRef<CPluginInfo> > plugins;
            // see if it's in registry format
            try {
                PluginInfoFromRegistry(istr, plugins);
            }
            catch (...) {
                _TRACE(*url << " not valid as .ini format; "
                       "trying asn1 text");
                // read as many PluginInfos as are present
                istr.seekg(0);
                auto_ptr<CObjectIStream> is
                    (CObjectIStream::Open(eSerial_AsnText, istr));
                while (1) {
                    CRef<CPluginInfo> info(new CPluginInfo);
                    try {
                        *is >> *info;
                    }
                    catch (...) {
                        break;
                    }
                    plugins.push_back(info);
                }
            }
            int count = 0;
            NON_CONST_ITERATE (vector<CRef<CPluginInfo> >, iter, plugins) {
                CRef<CPluginInfo>& info = *iter;
                CPluginCommandSet& cmds = info->SetCommands();
                if (!cmds.IsAlgo()) {
                    LOG_POST(Error << "skipping " << *url <<
                             "; invalid PluginInfo (not an algo)");
                    continue;
                }
                
                CPluginCommand& args = *cmds.SetAlgo().front();
                
                // if __url not set, take this to signify
                // the url we just hit
                if (!args.HasArgument("__url")) {
                    CPluginArg& arg = args.SetArgs()
                        .AddDefaultArgument("__url",
                                            "url",
                                            CPluginArg::eString, *url);
                    arg.SetHidden(1);  // url argument should be invisible
                }
                
                // for security, make sure no path name slips in from the net!
                if (args.HasArgument("__executable_path")) {
                    LOG_POST(Info << "rejecting path " <<
                             args["__executable_path"].AsString() <<
                             " from url " << *url);
                    args["__executable_path"].SetString("");
                }
                
                
                CPluginRegistry::RegisterPlugin
                    (info, &s_AlgoFactory_CAlgoWebService);
                count++;
                LOG_POST(Info << "  registered "
                         << args["__url"].AsString() << " as web algorithm");
                
            }
            LOG_POST(Info << "configured " << count << " plugins from url "
                     << *url);
        }
    }
}
    
END_NCBI_SCOPE
/*
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 * $Log: web_algo_init.cpp,v $
 * Revision 1000.3  2004/06/01 20:56:16  gouriano
 * PRODUCTION: UPGRADED [GCC34_MSVC7] Dev-tree R1.8
 *
 * Revision 1.8  2004/05/21 22:27:47  gorelenk
 * Added PCH ncbi_pch.hpp
 *
 * Revision 1.7  2004/02/17 20:35:26  rsmith
 * moved core/settings.[ch]pp and core/system_path.[ch]pp to config and utils, respectively.
 *
 * Revision 1.6  2004/01/07 17:39:03  vasilche
 * Fixed include path to genbank loader.
 *
 * Revision 1.5  2003/12/04 00:36:54  jcherry
 * Preserve order of plugin parameters specified in registry format
 *
 * Revision 1.4  2003/12/02 14:41:23  dicuccio
 * Restored autorun
 *
 * Revision 1.3  2003/12/01 23:22:02  jcherry
 * Added registry file format for plugin info
 *
 * Revision 1.2  2003/11/26 17:13:08  dicuccio
 * Lots of code clean-up.  CHanged names of algorithms to CAlgoWebServices{Init}
 *
 * Revision 1.1  2003/11/25 19:08:51  jcherry
 * Initial version
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