blast_poll_table.hpp
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上传日期:2007-06-13
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文件大小:5k
源码类别:

生物技术

开发平台:

C/C++

  1. /*
  2.  * ===========================================================================
  3.  * PRODUCTION $Log: blast_poll_table.hpp,v $
  4.  * PRODUCTION Revision 1000.1  2004/06/01 20:54:17  gouriano
  5.  * PRODUCTION PRODUCTION: UPGRADED [GCC34_MSVC7] Dev-tree R1.7
  6.  * PRODUCTION
  7.  * ===========================================================================
  8.  */
  9. #ifndef GUI_ALGO_PLUGINS_ALIGN___BLAST_POLL_TABLE__HPP
  10. #define GUI_ALGO_PLUGINS_ALIGN___BLAST_POLL_TABLE__HPP
  11. /*  $Id: blast_poll_table.hpp,v 1000.1 2004/06/01 20:54:17 gouriano Exp $
  12.  * ===========================================================================
  13.  *
  14.  *                            PUBLIC DOMAIN NOTICE
  15.  *               National Center for Biotechnology Information
  16.  *
  17.  *  This software/database is a "United States Government Work" under the
  18.  *  terms of the United States Copyright Act.  It was written as part of
  19.  *  the author's official duties as a United States Government employee and
  20.  *  thus cannot be copyrighted.  This software/database is freely available
  21.  *  to the public for use. The National Library of Medicine and the U.S.
  22.  *  Government have not placed any restriction on its use or reproduction.
  23.  *
  24.  *  Although all reasonable efforts have been taken to ensure the accuracy
  25.  *  and reliability of the software and data, the NLM and the U.S.
  26.  *  Government do not and cannot warrant the performance or results that
  27.  *  may be obtained by using this software or data. The NLM and the U.S.
  28.  *  Government disclaim all warranties, express or implied, including
  29.  *  warranties of performance, merchantability or fitness for any particular
  30.  *  purpose.
  31.  *
  32.  *  Please cite the author in any work or product based on this material.
  33.  *
  34.  * ===========================================================================
  35.  *
  36.  * Authors:  Mike DiCuccio
  37.  *
  38.  * File Description:
  39.  *
  40.  */
  41. #include <gui/widgets/fl/table_panel.hpp>
  42. #include <gui/core/idocument.hpp>
  43. #include <corelib/ncbitime.hpp>
  44. #include <gui/utils/fltk_utils.hpp>
  45. #include <gui/objutils/iselection.hpp>
  46. #include <gui/utils/command.hpp>
  47. #include <objects/seq/Seq_annot.hpp>
  48. #include <objects/seqloc/Seq_loc.hpp>
  49. #include <objects/seqalign/Seq_align_set.hpp>
  50. BEGIN_NCBI_SCOPE
  51. class CBlastPollItem : public CObject
  52. {
  53. public:
  54.     CBlastPollItem()
  55.         : m_Active(true),
  56.           m_Errors(false) {}
  57.     // RID we poll for
  58.     string m_Rid;
  59.     // Description of request
  60.     string m_Descr;
  61.     // polling status
  62.     string m_Status;
  63.     // flag: are we active?
  64.     bool m_Active;
  65.     // flag: were there errors on polling?
  66.     bool m_Errors;
  67.     // submit time
  68.     CTime m_SubmitTime;
  69.     // last poll time
  70.     CTime m_LastPollTime;
  71.     // Pointer to document of sequence to which m_Rid applies
  72.     CConstRef<IDocument> m_Document;
  73.     // Query Seq-loc to which m_Rid applies
  74.     CConstRef<objects::CSeq_loc> m_QueryLoc;
  75.     // results pulled from the BLAST server, for future reference
  76.     CRef<objects::CSeq_annot> m_Results;
  77. };
  78. class CBlastPollTable : public CTablePanel< CRef<CBlastPollItem> >,
  79.                         public ISelection,
  80.                         public CCommandTarget
  81. {
  82. public:
  83.     enum EColumnType {
  84.         eRid,
  85.         eLocation,
  86.         eStatus,
  87.         eSubmit,
  88.         eLastPoll
  89.     };
  90.     CBlastPollTable(int x, int y, int w, int h, const char* label = NULL);
  91.     // add an item to the table
  92.     void AddItem(CBlastPollItem& item);
  93.     // remove an item from the table
  94.     void RemoveItem(size_t row);
  95.     // remove all selected items
  96.     void RemoveSelected();
  97.     // update an item in the table
  98.     void UpdateItem(size_t row, CBlastPollItem& item); 
  99.     // deactivate an item
  100.     void DeactivateItem(size_t row); 
  101.     // activate an item
  102.     void ActivateItem(size_t row);
  103.     // move an item up or down in the list
  104.     void MoveUp(size_t item);
  105.     // move an item up or down in the list
  106.     void MoveDown(size_t item);
  107.     // check to see if a given RID is in the queue already
  108.     bool HasRid(const string& rid) const;
  109.     void GetSelections(TConstScopedObjects& objs) const;
  110.     void SetSelections(const TConstScopedObjects& objs);
  111.     // command map fo CCommandTarget
  112.     DECLARE_CMD_MAP();
  113.     // functions pinged by our popup menu
  114.     void OnNewDocument();
  115.     void OnSaveAs();
  116.     // FLTK override: handle FLTK events
  117.     int handle(int event);
  118.     // show our popup menu
  119.     void OnShowPopup();
  120. private:
  121.     void x_UpdateItem(size_t idx);
  122.     // overloaded copy handler
  123.     int x_OnCopy();
  124. };
  125. END_NCBI_SCOPE
  126. /*
  127.  * ===========================================================================
  128.  * $Log: blast_poll_table.hpp,v $
  129.  * Revision 1000.1  2004/06/01 20:54:17  gouriano
  130.  * PRODUCTION: UPGRADED [GCC34_MSVC7] Dev-tree R1.7
  131.  *
  132.  * Revision 1.7  2004/05/03 13:05:42  dicuccio
  133.  * gui/utils --> gui/objutils where needed
  134.  *
  135.  * Revision 1.6  2004/04/23 21:02:52  ucko
  136.  * +<Seq_annot.hpp>, since some compilers insist on seeing the full header
  137.  * before any relevant CRefs.
  138.  *
  139.  * Revision 1.5  2004/04/22 13:07:23  dicuccio
  140.  * Formatting changes
  141.  *
  142.  * Revision 1.4  2004/04/22 12:22:08  dicuccio
  143.  * Added BLAST RID caching.  Added better formatting for BLAST results
  144.  *
  145.  * Revision 1.3  2004/04/07 12:52:48  dicuccio
  146.  * m_document -> m_Document.  Added CSeq_align_set member CRef<> to store results
  147.  *
  148.  * Revision 1.2  2004/03/24 12:36:05  dicuccio
  149.  * Added include for CSeq_loc
  150.  *
  151.  * Revision 1.1  2004/03/05 17:30:34  dicuccio
  152.  * Initial revision
  153.  *
  154.  * ===========================================================================
  155.  */
  156. #endif  // GUI_ALGO_PLUGINS_ALIGN___BLAST_POLL_TABLE__HPP