blast_rid_cache.hpp
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上传日期:2007-06-13
资源大小:13604k
文件大小:3k
源码类别:

生物技术

开发平台:

C/C++

  1. /*
  2.  * ===========================================================================
  3.  * PRODUCTION $Log: blast_rid_cache.hpp,v $
  4.  * PRODUCTION Revision 1000.0  2004/06/01 21:26:15  gouriano
  5.  * PRODUCTION PRODUCTION: IMPORTED [GCC34_MSVC7] Dev-tree R1.1
  6.  * PRODUCTION
  7.  * ===========================================================================
  8.  */
  9. #ifndef GUI_PLUGINS_ALGO_ALIGN___BLAST_RID_CACHE__HPP
  10. #define GUI_PLUGINS_ALGO_ALIGN___BLAST_RID_CACHE__HPP
  11. /*  $Id: blast_rid_cache.hpp,v 1000.0 2004/06/01 21:26:15 gouriano Exp $
  12.  * ===========================================================================
  13.  *
  14.  *                            PUBLIC DOMAIN NOTICE
  15.  *               National Center for Biotechnology Information
  16.  *
  17.  *  This software/database is a "United States Government Work" under the
  18.  *  terms of the United States Copyright Act.  It was written as part of
  19.  *  the author's official duties as a United States Government employee and
  20.  *  thus cannot be copyrighted.  This software/database is freely available
  21.  *  to the public for use. The National Library of Medicine and the U.S.
  22.  *  Government have not placed any restriction on its use or reproduction.
  23.  *
  24.  *  Although all reasonable efforts have been taken to ensure the accuracy
  25.  *  and reliability of the software and data, the NLM and the U.S.
  26.  *  Government do not and cannot warrant the performance or results that
  27.  *  may be obtained by using this software or data. The NLM and the U.S.
  28.  *  Government disclaim all warranties, express or implied, including
  29.  *  warranties of performance, merchantability or fitness for any particular
  30.  *  purpose.
  31.  *
  32.  *  Please cite the author in any work or product based on this material.
  33.  *
  34.  * ===========================================================================
  35.  *
  36.  * Authors:  Mike DiCuccio
  37.  *
  38.  * File Description:
  39.  *
  40.  */
  41. #include <corelib/ncbiobj.hpp>
  42. #include <objects/seq/Seq_annot.hpp>
  43. BEGIN_NCBI_SCOPE
  44. class CBDB_Cache;
  45. class CBlastRidCache : public CObject
  46. {
  47. public:
  48.     CBlastRidCache();
  49.     // add a seq-annot containing BLAST results to the cache.  The object
  50.     // is referenced by a request ID retrieved from the BLAST server.
  51.     void AddRID(const string& rid, const objects::CSeq_annot& annot);
  52.     // retrieve BLAST results corresponding to a given RID.
  53.     objects::CSeq_annot* GetRID(const string& rid);
  54. private:
  55.     auto_ptr<CBDB_Cache> m_Cache;
  56.     // forbidden
  57.     CBlastRidCache(const CBlastRidCache&);
  58.     CBlastRidCache& operator=(const CBlastRidCache&);
  59. };
  60. END_NCBI_SCOPE
  61. /*
  62.  * ===========================================================================
  63.  * $Log: blast_rid_cache.hpp,v $
  64.  * Revision 1000.0  2004/06/01 21:26:15  gouriano
  65.  * PRODUCTION: IMPORTED [GCC34_MSVC7] Dev-tree R1.1
  66.  *
  67.  * Revision 1.1  2004/04/22 12:22:36  dicuccio
  68.  * Initial revision
  69.  *
  70.  * ===========================================================================
  71.  */
  72. #endif  // GUI_PLUGINS_ALGO_ALIGN___BLAST_RID_CACHE__HPP