align_to_neighbors.hpp
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上传日期:2007-06-13
资源大小:13604k
文件大小:3k
源码类别:

生物技术

开发平台:

C/C++

  1. /*
  2.  * ===========================================================================
  3.  * PRODUCTION $Log: align_to_neighbors.hpp,v $
  4.  * PRODUCTION Revision 1000.3  2004/04/12 19:27:09  gouriano
  5.  * PRODUCTION PRODUCTION: UPGRADED [CATCHUP_003] Dev-tree R1.5
  6.  * PRODUCTION
  7.  * ===========================================================================
  8.  */
  9. #ifndef GUI_PLUGINS_ALGO_ALIGN___ALIGN_TO_NEIGHBORS__HPP
  10. #define GUI_PLUGINS_ALGO_ALIGN___ALIGN_TO_NEIGHBORS__HPP
  11. /*  $Id: align_to_neighbors.hpp,v 1000.3 2004/04/12 19:27:09 gouriano Exp $
  12.  * ===========================================================================
  13.  *
  14.  *                            PUBLIC DOMAIN NOTICE
  15.  *               National Center for Biotechnology Information
  16.  *
  17.  *  This software/database is a "United States Government Work" under the
  18.  *  terms of the United States Copyright Act.  It was written as part of
  19.  *  the author's official duties as a United States Government employee and
  20.  *  thus cannot be copyrighted.  This software/database is freely available
  21.  *  to the public for use. The National Library of Medicine and the U.S.
  22.  *  Government have not placed any restriction on its use or reproduction.
  23.  *
  24.  *  Although all reasonable efforts have been taken to ensure the accuracy
  25.  *  and reliability of the software and data, the NLM and the U.S.
  26.  *  Government do not and cannot warrant the performance or results that
  27.  *  may be obtained by using this software or data. The NLM and the U.S.
  28.  *  Government disclaim all warranties, express or implied, including
  29.  *  warranties of performance, merchantability or fitness for any particular
  30.  *  purpose.
  31.  *
  32.  *  Please cite the author in any work or product based on this material.
  33.  *
  34.  * ===========================================================================
  35.  *
  36.  * Authors:  Josh Cherry
  37.  *
  38.  * File Description:
  39.  *    gbench plugin for aligning to neighbors
  40.  */
  41. #include <gui/core/algo.hpp>
  42. #include <gui/plugin/PluginCommand.hpp>
  43. #include <gui/plugin/PluginReply.hpp>
  44. #include <gui/dialogs/progress/progress_dlg_ex.hpp>
  45. BEGIN_NCBI_SCOPE
  46. class CAlignToNeighbors
  47. {
  48. public:
  49.     void Run(objects::CPluginMessage& msg);
  50. };
  51. END_NCBI_SCOPE
  52. /*
  53.  * ===========================================================================
  54.  * $Log: align_to_neighbors.hpp,v $
  55.  * Revision 1000.3  2004/04/12 19:27:09  gouriano
  56.  * PRODUCTION: UPGRADED [CATCHUP_003] Dev-tree R1.5
  57.  *
  58.  * Revision 1.5  2004/03/05 17:33:44  dicuccio
  59.  * Changed plugin to run single-threaded until thread issues can be sorted out.
  60.  * Use sequence::GetId() instead of CSeq_id::GetStringDescr()
  61.  *
  62.  * Revision 1.4  2003/11/26 17:12:30  dicuccio
  63.  * Switched to use CThreadedAlgorithm<>
  64.  *
  65.  * Revision 1.3  2003/11/04 17:49:22  dicuccio
  66.  * Changed calling parameters for plugins - pass CPluginMessage instead of paired
  67.  * CPluginCommand/CPluginReply
  68.  *
  69.  * Revision 1.2  2003/10/15 18:17:07  dicuccio
  70.  * Split algo into two front-ends (one for mRNA, one for proteins)
  71.  *
  72.  * Revision 1.1  2003/10/10 17:36:30  jcherry
  73.  * Initial version
  74.  *
  75.  * ===========================================================================
  76.  */
  77. #endif  // GUI_PLUGINS_ALGO_ALIGN___ALIGN_TO_NEIGHBORS__HPP