wbplg_aligner.hpp
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上传日期:2007-06-13
资源大小:13604k
文件大小:4k
源码类别:

生物技术

开发平台:

C/C++

  1. /*
  2.  * ===========================================================================
  3.  * PRODUCTION $Log: wbplg_aligner.hpp,v $
  4.  * PRODUCTION Revision 1000.2  2004/04/12 19:28:29  gouriano
  5.  * PRODUCTION PRODUCTION: UPGRADED [CATCHUP_003] Dev-tree R1.11
  6.  * PRODUCTION
  7.  * ===========================================================================
  8.  */
  9. #ifndef GUI_CORE_ALGO_ALIGN___WBPLUGIN_ALIGNER__HPP
  10. #define GUI_CORE_ALGO_ALIGN___WBPLUGIN_ALIGNER__HPP
  11. /*  $Id: wbplg_aligner.hpp,v 1000.2 2004/04/12 19:28:29 gouriano Exp $
  12.  * ===========================================================================
  13.  *
  14.  *                            PUBLIC DOMAIN NOTICE
  15.  *               National Center for Biotechnology Information
  16.  *
  17.  *  This software/database is a "United States Government Work" under the
  18.  *  terms of the United States Copyright Act.  It was written as part of
  19.  *  the author's official duties as a United States Government employee and
  20.  *  thus cannot be copyrighted.  This software/database is freely available
  21.  *  to the public for use. The National Library of Medicine and the U.S.
  22.  *  Government have not placed any restriction on its use or reproduction.
  23.  *
  24.  *  Although all reasonable efforts have been taken to ensure the accuracy
  25.  *  and reliability of the software and data, the NLM and the U.S.
  26.  *  Government do not and cannot warrant the performance or results that
  27.  *  may be obtained by using this software or data. The NLM and the U.S.
  28.  *  Government disclaim all warranties, express or implied, including
  29.  *  warranties of performance, merchantability or fitness for any particular
  30.  *  purpose.
  31.  *
  32.  *  Please cite the author in any work or product based on this material.
  33.  *
  34.  * ===========================================================================
  35.  *
  36.  * Authors:  Yuri Kapustin
  37.  *
  38.  * File Description:
  39.  *    CAlgoPlugin_NeedlemanWunsch -- wraps global alignment algorithms
  40.  */
  41. #include <gui/core/algo.hpp>
  42. BEGIN_NCBI_SCOPE
  43. class CAlgoPlugin_NeedlemanWunsch
  44.     : public CAlgorithm<CAlgoPlugin_NeedlemanWunsch>
  45. {
  46. public:
  47.     virtual void RunCommand(objects::CPluginMessage& msg);
  48.     // static GetInfo() - required by factory
  49.     static void GetInfo(objects::CPluginInfo& info);
  50. };
  51. END_NCBI_SCOPE
  52. #endif
  53. /*
  54.  * ===========================================================================
  55.  * $Log: wbplg_aligner.hpp,v $
  56.  * Revision 1000.2  2004/04/12 19:28:29  gouriano
  57.  * PRODUCTION: UPGRADED [CATCHUP_003] Dev-tree R1.11
  58.  *
  59.  * Revision 1.11  2004/01/27 18:40:31  dicuccio
  60.  * Code clean-up.  Renamed plugin classes to follow standard pattern
  61.  *
  62.  * Revision 1.10  2003/11/04 17:49:22  dicuccio
  63.  * Changed calling parameters for plugins - pass CPluginMessage instead of paired
  64.  * CPluginCommand/CPluginReply
  65.  *
  66.  * Revision 1.9  2003/10/07 13:46:59  dicuccio
  67.  * Renamed CPluginURL* to CPluginValue*
  68.  *
  69.  * Revision 1.8  2003/07/14 11:10:14  shomrat
  70.  * Plugin messageing system related changes
  71.  *
  72.  * Revision 1.7  2003/06/20 14:52:35  dicuccio
  73.  * Revised plugin registration - moved GetInfo() into the plugin handler
  74.  *
  75.  * Revision 1.6  2003/02/25 14:44:34  dicuccio
  76.  * Changed accessors to match API changes in plugin arguments
  77.  *
  78.  * Revision 1.5  2003/02/24 13:03:14  dicuccio
  79.  * Renamed classes in plugin spec:
  80.  *     CArgSeg --> CPluginArgSet
  81.  *     CArgument --> CPluginArg
  82.  *     CPluginArgs --> CPluginCommand
  83.  *     CPluginCommands --> CPluginCommandSet
  84.  *
  85.  * Revision 1.4  2003/02/21 17:13:54  dicuccio
  86.  * Changed enums in CDlgMessageBox - added leading 'e' to avoid
  87.  * impossible-to-remove conflict with Windows code.
  88.  *
  89.  * Revision 1.3  2003/02/20 19:49:53  dicuccio
  90.  * Created new plugin architecture, based on ASN.1 spec.  Moved GBENCH frameowrk
  91.  * over to use new plugin architecture.
  92.  *
  93.  * Revision 1.2  2003/02/04 22:58:33  kapustin
  94.  * Split plugin activation into x_Verify() and x_Run(). Add progress callback
  95.  *
  96.  * Revision 1.1  2003/01/29 19:10:42  kapustin
  97.  * Initial revision
  98.  *
  99.  * ===========================================================================
  100.  */