prosite_search.hpp
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上传日期:2007-06-13
资源大小:13604k
文件大小:4k
源码类别:

生物技术

开发平台:

C/C++

  1. /*
  2.  * ===========================================================================
  3.  * PRODUCTION $Log: prosite_search.hpp,v $
  4.  * PRODUCTION Revision 1000.2  2004/04/12 19:30:10  gouriano
  5.  * PRODUCTION PRODUCTION: UPGRADED [CATCHUP_003] Dev-tree R1.7
  6.  * PRODUCTION
  7.  * ===========================================================================
  8.  */
  9. #ifndef GUI_PLUGINS_ALGO_BASIC___PROSITE_SEARCH__HPP
  10. #define GUI_PLUGINS_ALGO_BASIC___PROSITE_SEARCH__HPP
  11. /*  $Id: prosite_search.hpp,v 1000.2 2004/04/12 19:30:10 gouriano Exp $
  12.  * ===========================================================================
  13.  *
  14.  *                            PUBLIC DOMAIN NOTICE
  15.  *               National Center for Biotechnology Information
  16.  *
  17.  *  This software/database is a "United States Government Work" under the
  18.  *  terms of the United States Copyright Act.  It was written as part of
  19.  *  the author's official duties as a United States Government employee and
  20.  *  thus cannot be copyrighted.  This software/database is freely available
  21.  *  to the public for use. The National Library of Medicine and the U.S.
  22.  *  Government have not placed any restriction on its use or reproduction.
  23.  *
  24.  *  Although all reasonable efforts have been taken to ensure the accuracy
  25.  *  and reliability of the software and data, the NLM and the U.S.
  26.  *  Government do not and cannot warrant the performance or results that
  27.  *  may be obtained by using this software or data. The NLM and the U.S.
  28.  *  Government disclaim all warranties, express or implied, including
  29.  *  warranties of performance, merchantability or fitness for any particular
  30.  *  purpose.
  31.  *
  32.  *  Please cite the author in any work or product based on this material.
  33.  *
  34.  * ===========================================================================
  35.  *
  36.  * Authors:  Josh Cherry
  37.  *
  38.  * File Description:  gbench plugin for searching against prosite patterns
  39.  *
  40.  */
  41. #include <gui/core/algo.hpp>
  42. #include <gui/dialogs/col/multi_col_dlg.hpp>
  43. #include "prosite_entry.hpp"
  44. BEGIN_NCBI_SCOPE
  45. class CAlgoPlugin_PrositeSearch : public CAlgorithm<CAlgoPlugin_PrositeSearch>
  46. {
  47. public:
  48.     CAlgoPlugin_PrositeSearch() { }
  49.     ~CAlgoPlugin_PrositeSearch();
  50.     void RunCommand(objects::CPluginMessage& msg);
  51.     // standard info boilerplate
  52.     static void GetInfo(objects::CPluginInfo& info);
  53. private:
  54.     void x_LoadPrositeData(vector<CPrositeEntry>& entries);
  55.     
  56.     auto_ptr<CMultiColDlg> m_Dialog;
  57.     CAlgoPlugin_PrositeSearch(const CAlgoPlugin_PrositeSearch&);
  58.     CAlgoPlugin_PrositeSearch& operator=(const CAlgoPlugin_PrositeSearch&);
  59. };
  60. END_NCBI_SCOPE
  61. /*
  62.  * ===========================================================================
  63.  * $Log: prosite_search.hpp,v $
  64.  * Revision 1000.2  2004/04/12 19:30:10  gouriano
  65.  * PRODUCTION: UPGRADED [CATCHUP_003] Dev-tree R1.7
  66.  *
  67.  * Revision 1.7  2004/01/28 18:54:21  ucko
  68.  * Include full dialog declarations for GCC 2.95's auto_ptr<>.
  69.  *
  70.  * Revision 1.6  2004/01/27 18:38:08  dicuccio
  71.  * Code clean-up.  Use standard names for plugins.  Removed unnecessary #includes
  72.  *
  73.  * Revision 1.5  2003/12/16 18:02:22  jcherry
  74.  * Moved find_pattern to algo/sequence
  75.  *
  76.  * Revision 1.4  2003/11/04 17:49:23  dicuccio
  77.  * Changed calling parameters for plugins - pass CPluginMessage instead of paired
  78.  * CPluginCommand/CPluginReply
  79.  *
  80.  * Revision 1.3  2003/08/22 15:47:45  dicuccio
  81.  * Added 'objects::' where necessary
  82.  *
  83.  * Revision 1.2  2003/08/15 18:48:06  jcherry
  84.  * Brought dialog handling up to date.
  85.  *
  86.  * Revision 1.1  2003/08/04 20:05:45  jcherry
  87.  * Initial version
  88.  *
  89.  * ===========================================================================
  90.  */
  91. #endif  // GUI_PLUGINS_ALGO_BASIC___PROSITE_SEARCH__HPP