gc_content.hpp
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上传日期:2007-06-13
资源大小:13604k
文件大小:5k
源码类别:

生物技术

开发平台:

C/C++

  1. /*
  2.  * ===========================================================================
  3.  * PRODUCTION $Log: gc_content.hpp,v $
  4.  * PRODUCTION Revision 1000.2  2004/04/12 19:29:16  gouriano
  5.  * PRODUCTION PRODUCTION: UPGRADED [CATCHUP_003] Dev-tree R1.17
  6.  * PRODUCTION
  7.  * ===========================================================================
  8.  */
  9. #ifndef GUI_PLUGINS_ALGO_BASIC___GC_CONTENT__HPP
  10. #define GUI_PLUGINS_ALGO_BASIC___GC_CONTENT__HPP
  11. /*  $Id: gc_content.hpp,v 1000.2 2004/04/12 19:29:16 gouriano Exp $
  12.  * ===========================================================================
  13.  *
  14.  *                            PUBLIC DOMAIN NOTICE
  15.  *               National Center for Biotechnology Information
  16.  *
  17.  *  This software/database is a "United States Government Work" under the
  18.  *  terms of the United States Copyright Act.  It was written as part of
  19.  *  the author's official duties as a United States Government employee and
  20.  *  thus cannot be copyrighted.  This software/database is freely available
  21.  *  to the public for use. The National Library of Medicine and the U.S.
  22.  *  Government have not placed any restriction on its use or reproduction.
  23.  *
  24.  *  Although all reasonable efforts have been taken to ensure the accuracy
  25.  *  and reliability of the software and data, the NLM and the U.S.
  26.  *  Government do not and cannot warrant the performance or results that
  27.  *  may be obtained by using this software or data. The NLM and the U.S.
  28.  *  Government disclaim all warranties, express or implied, including
  29.  *  warranties of performance, merchantability or fitness for any particular
  30.  *  purpose.
  31.  *
  32.  *  Please cite the author in any work or product based on this material.
  33.  *
  34.  * ===========================================================================
  35.  *
  36.  * Authors:  Mike DiCuccio
  37.  *
  38.  * File Description:
  39.  *    CGcContent -- implements the algorithm to calculate GC composition
  40.  */
  41. #include <gui/core/algo.hpp>
  42. #include <gui/dialogs/col/multi_col_dlg.hpp>
  43. BEGIN_NCBI_SCOPE
  44. class CAlgoPlugin_GcContent : public CAlgorithm<CAlgoPlugin_GcContent>
  45. {
  46. public:
  47.     CAlgoPlugin_GcContent() { }
  48.     ~CAlgoPlugin_GcContent();
  49.     void RunCommand(objects::CPluginMessage& msg);
  50.     // standard info boilerplate
  51.     static void GetInfo(objects::CPluginInfo& info);
  52. private:
  53.     auto_ptr<CMultiColDlg> m_Dialog;
  54.     CAlgoPlugin_GcContent(const CAlgoPlugin_GcContent&);
  55.     CAlgoPlugin_GcContent& operator=(const CAlgoPlugin_GcContent&);
  56. };
  57. END_NCBI_SCOPE
  58. /*
  59.  * ===========================================================================
  60.  * $Log: gc_content.hpp,v $
  61.  * Revision 1000.2  2004/04/12 19:29:16  gouriano
  62.  * PRODUCTION: UPGRADED [CATCHUP_003] Dev-tree R1.17
  63.  *
  64.  * Revision 1.17  2004/01/28 18:54:20  ucko
  65.  * Include full dialog declarations for GCC 2.95's auto_ptr<>.
  66.  *
  67.  * Revision 1.16  2004/01/27 18:37:45  dicuccio
  68.  * Code clean-up.  Use standard names for plugins.  Removed unnecessary #includes
  69.  *
  70.  * Revision 1.15  2003/11/04 17:49:23  dicuccio
  71.  * Changed calling parameters for plugins - pass CPluginMessage instead of paired
  72.  * CPluginCommand/CPluginReply
  73.  *
  74.  * Revision 1.14  2003/08/05 17:03:55  dicuccio
  75.  * Made multi-column output dialog a member variable - allows non-modal operation
  76.  *
  77.  * Revision 1.13  2003/07/28 11:51:48  dicuccio
  78.  * Rewrote CTablePanel<> to be more flexible and better contained.  Added standard
  79.  * multicolumn list dialog.  Deprecated use of COutputDlg.
  80.  *
  81.  * Revision 1.12  2003/07/14 11:12:34  shomrat
  82.  * Plugin messageing system related changes
  83.  *
  84.  * Revision 1.11  2003/07/08 13:13:11  dicuccio
  85.  * +<memory> for auto_ptr<>
  86.  *
  87.  * Revision 1.10  2003/07/02 14:37:05  dicuccio
  88.  * Fixed USING_SCOPE() for brain-dead MSVC.
  89.  *
  90.  * Revision 1.9  2003/07/01 23:05:54  dicuccio
  91.  * Compiler fixes for MSVC
  92.  *
  93.  * Revision 1.8  2003/06/20 14:52:36  dicuccio
  94.  * Revised plugin registration - moved GetInfo() into the plugin handler
  95.  *
  96.  * Revision 1.7  2003/06/02 16:06:21  dicuccio
  97.  * Rearranged src/objects/ subtree.  This includes the following shifts:
  98.  *     - src/objects/asn2asn --> arc/app/asn2asn
  99.  *     - src/objects/testmedline --> src/objects/ncbimime/test
  100.  *     - src/objects/objmgr --> src/objmgr
  101.  *     - src/objects/util --> src/objmgr/util
  102.  *     - src/objects/alnmgr --> src/objtools/alnmgr
  103.  *     - src/objects/flat --> src/objtools/flat
  104.  *     - src/objects/validator --> src/objtools/validator
  105.  *     - src/objects/cddalignview --> src/objtools/cddalignview
  106.  * In addition, libseq now includes six of the objects/seq... libs, and libmmdb
  107.  * replaces the three libmmdb? libs.
  108.  *
  109.  * Revision 1.6  2003/02/24 13:03:15  dicuccio
  110.  * Renamed classes in plugin spec:
  111.  *     CArgSeg --> CPluginArgSet
  112.  *     CArgument --> CPluginArg
  113.  *     CPluginArgs --> CPluginCommand
  114.  *     CPluginCommands --> CPluginCommandSet
  115.  *
  116.  * Revision 1.5  2003/02/20 19:49:53  dicuccio
  117.  * Created new plugin architecture, based on ASN.1 spec.  Moved GBENCH frameowrk
  118.  * over to use new plugin architecture.
  119.  *
  120.  * Revision 1.4  2003/02/05 19:47:23  dicuccio
  121.  * Fixed memory leak with output dialog.  Changed ambiguous 'R' to 'S' for G+C
  122.  *
  123.  * Revision 1.3  2003/01/13 13:10:05  dicuccio
  124.  * Namespace clean-up.  Retired namespace gui -> converted all to namespace ncbi.
  125.  * Moved all FLUID-generated code into namespace ncbi.
  126.  *
  127.  * Revision 1.2  2002/12/30 17:21:40  ostell
  128.  * Added support for most document type selections. Changed labels to use Labelxxx functions.
  129.  *
  130.  * Revision 1.1  2002/11/05 20:59:20  dicuccio
  131.  * Initial revision
  132.  *
  133.  * ===========================================================================
  134.  */
  135. #endif  // GUI_PLUGINS_ALGO_BASIC___GC_CONTENT__HPP