nmer.hpp
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上传日期:2007-06-13
资源大小:13604k
文件大小:4k
源码类别:

生物技术

开发平台:

C/C++

  1. /*
  2.  * ===========================================================================
  3.  * PRODUCTION $Log: nmer.hpp,v $
  4.  * PRODUCTION Revision 1000.2  2004/04/12 19:29:22  gouriano
  5.  * PRODUCTION PRODUCTION: UPGRADED [CATCHUP_003] Dev-tree R1.9
  6.  * PRODUCTION
  7.  * ===========================================================================
  8.  */
  9. #ifndef GUI_PLUGINS_ALGO_BASIC___NMER__HPP
  10. #define GUI_PLUGINS_ALGO_BASIC___NMER__HPP
  11. /*  $Id: nmer.hpp,v 1000.2 2004/04/12 19:29:22 gouriano Exp $
  12.  * ===========================================================================
  13.  *
  14.  *                            PUBLIC DOMAIN NOTICE
  15.  *               National Center for Biotechnology Information
  16.  *
  17.  *  This software/database is a "United States Government Work" under the
  18.  *  terms of the United States Copyright Act.  It was written as part of
  19.  *  the author's official duties as a United States Government employee and
  20.  *  thus cannot be copyrighted.  This software/database is freely available
  21.  *  to the public for use. The National Library of Medicine and the U.S.
  22.  *  Government have not placed any restriction on its use or reproduction.
  23.  *
  24.  *  Although all reasonable efforts have been taken to ensure the accuracy
  25.  *  and reliability of the software and data, the NLM and the U.S.
  26.  *  Government do not and cannot warrant the performance or results that
  27.  *  may be obtained by using this software or data. The NLM and the U.S.
  28.  *  Government disclaim all warranties, express or implied, including
  29.  *  warranties of performance, merchantability or fitness for any particular
  30.  *  purpose.
  31.  *
  32.  *  Please cite the author in any work or product based on this material.
  33.  *
  34.  * ===========================================================================
  35.  *
  36.  * Authors:  Josh Cherry
  37.  *
  38.  * File Description:
  39.  *   CNmer -- implements the algorithm to calculate n-mer frequencies
  40.  */
  41. #include <gui/core/algo.hpp>
  42. #include <gui/dialogs/col/multi_col_dlg.hpp>
  43. BEGIN_NCBI_SCOPE
  44. class CAlgoPlugin_Nmer : public CAlgorithm<CAlgoPlugin_Nmer>
  45. {
  46. public:
  47.     CAlgoPlugin_Nmer() { }
  48.     ~CAlgoPlugin_Nmer();
  49.     void RunCommand(objects::CPluginMessage& msg);
  50.     // standard info boilerplate
  51.     static void GetInfo(objects::CPluginInfo& info);
  52. private:
  53.     auto_ptr<CMultiColDlg> m_Dialog;
  54.     CAlgoPlugin_Nmer(const CAlgoPlugin_Nmer&);
  55.     CAlgoPlugin_Nmer& operator=(const CAlgoPlugin_Nmer&);
  56. };
  57. END_NCBI_SCOPE
  58. /*
  59.  * ===========================================================================
  60.  * $Log: nmer.hpp,v $
  61.  * Revision 1000.2  2004/04/12 19:29:22  gouriano
  62.  * PRODUCTION: UPGRADED [CATCHUP_003] Dev-tree R1.9
  63.  *
  64.  * Revision 1.9  2004/01/28 18:54:20  ucko
  65.  * Include full dialog declarations for GCC 2.95's auto_ptr<>.
  66.  *
  67.  * Revision 1.8  2004/01/27 18:37:46  dicuccio
  68.  * Code clean-up.  Use standard names for plugins.  Removed unnecessary #includes
  69.  *
  70.  * Revision 1.7  2003/11/04 17:49:23  dicuccio
  71.  * Changed calling parameters for plugins - pass CPluginMessage instead of paired
  72.  * CPluginCommand/CPluginReply
  73.  *
  74.  * Revision 1.6  2003/08/05 17:03:55  dicuccio
  75.  * Made multi-column output dialog a member variable - allows non-modal operation
  76.  *
  77.  * Revision 1.5  2003/07/28 11:51:48  dicuccio
  78.  * Rewrote CTablePanel<> to be more flexible and better contained.  Added standard
  79.  * multicolumn list dialog.  Deprecated use of COutputDlg.
  80.  *
  81.  * Revision 1.4  2003/07/14 11:12:54  shomrat
  82.  * Plugin messageing system related changes
  83.  *
  84.  * Revision 1.3  2003/06/20 14:52:36  dicuccio
  85.  * Revised plugin registration - moved GetInfo() into the plugin handler
  86.  *
  87.  * Revision 1.2  2003/06/10 14:45:22  jcherry
  88.  * Moved actual algorithms for n-mers to a separate class,
  89.  * implemented in count_nmers.?pp
  90.  *
  91.  * Revision 1.1  2003/06/09 17:30:38  jcherry
  92.  * Initial version
  93.  *
  94.  * ===========================================================================
  95.  */
  96. #endif  // GUI_PLUGINS_ALGO_BASIC___NMER__HPP