prosite_entry.hpp
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上传日期:2007-06-13
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文件大小:5k
源码类别:

生物技术

开发平台:

C/C++

  1. /*
  2.  * ===========================================================================
  3.  * PRODUCTION $Log: prosite_entry.hpp,v $
  4.  * PRODUCTION Revision 1000.1  2004/04/12 19:29:58  gouriano
  5.  * PRODUCTION PRODUCTION: UPGRADED [CATCHUP_003] Dev-tree R1.4
  6.  * PRODUCTION
  7.  * ===========================================================================
  8.  */
  9. #ifndef GUI_PLUGINS_ALGO_BASIC___PROSITE_ENTRY__HPP
  10. #define GUI_PLUGINS_ALGO_BASIC___PROSITE_ENTRY__HPP
  11. /*  $Id: prosite_entry.hpp,v 1000.1 2004/04/12 19:29:58 gouriano Exp $
  12.  * ===========================================================================
  13.  *
  14.  *                            PUBLIC DOMAIN NOTICE
  15.  *               National Center for Biotechnology Information
  16.  *
  17.  *  This software/database is a "United States Government Work" under the
  18.  *  terms of the United States Copyright Act.  It was written as part of
  19.  *  the author's official duties as a United States Government employee and
  20.  *  thus cannot be copyrighted.  This software/database is freely available
  21.  *  to the public for use. The National Library of Medicine and the U.S.
  22.  *  Government have not placed any restriction on its use or reproduction.
  23.  *
  24.  *  Although all reasonable efforts have been taken to ensure the accuracy
  25.  *  and reliability of the software and data, the NLM and the U.S.
  26.  *  Government do not and cannot warrant the performance or results that
  27.  *  may be obtained by using this software or data. The NLM and the U.S.
  28.  *  Government disclaim all warranties, express or implied, including
  29.  *  warranties of performance, merchantability or fitness for any particular
  30.  *  purpose.
  31.  *
  32.  *  Please cite the author in any work or product based on this material.
  33.  *
  34.  * ===========================================================================
  35.  *
  36.  * Authors:  Josh Cherry
  37.  *
  38.  * File Description:  Class for representing some of the information in an
  39.  *           entry in a prosite-format pattern database
  40.  *
  41.  */
  42. #include <corelib/ncbistr.hpp>
  43. BEGIN_NCBI_SCOPE
  44. class CPrositeEntry
  45. {
  46. public:
  47.     // constructors
  48.     CPrositeEntry(void);
  49.     void Reset(void);
  50.     void SetId(const string& s);
  51.     string& SetId(void);
  52.     const string& GetId(void) const;
  53.     void SetAccession(const string& s);
  54.     string& SetAccession(void);
  55.     const string& GetAccession(void) const;
  56.     void SetDesc(const string& s);
  57.     string& SetDesc(void);
  58.     const string& GetDesc(void) const;
  59.     void SetPattern(const string& s);
  60.     string& SetPattern(void);
  61.     const string& GetPattern(void) const;
  62.     void SetDoc(const string& s);
  63.     string& SetDoc(void);
  64.     const string& GetDoc(void) const;
  65.     void SetSkipFlag(bool b);
  66.     bool GetSkipFlag(void) const;
  67. private:
  68.     // data
  69.     string m_Id;
  70.     string m_Accession;
  71.     string m_Desc;
  72.     string m_Pattern;
  73.     string m_Doc;
  74.     bool   m_SkipFlag;
  75. };
  76. ///////////////////////////////////////////////////////////
  77. ///////////////////// inline methods //////////////////////
  78. ///////////////////////////////////////////////////////////
  79. inline
  80. void CPrositeEntry::SetId(const string& s)
  81. {
  82.     m_Id = s;
  83. }
  84. inline
  85. string& CPrositeEntry::SetId(void)
  86. {
  87.     return m_Id;
  88. }
  89. inline
  90. const string& CPrositeEntry::GetId(void) const
  91. {
  92.     return m_Id;
  93. }
  94. inline
  95. void CPrositeEntry::SetAccession(const string& s)
  96. {
  97.     m_Accession = s;
  98. }
  99. inline
  100. string& CPrositeEntry::SetAccession(void)
  101. {
  102.     return m_Accession;
  103. }
  104. inline
  105. const string& CPrositeEntry::GetAccession(void) const
  106. {
  107.     return m_Accession;
  108. }
  109. inline
  110. void CPrositeEntry::SetDesc(const string& s)
  111. {
  112.     m_Desc = s;
  113. }
  114. inline
  115. string& CPrositeEntry::SetDesc(void)
  116. {
  117.     return m_Desc;
  118. }
  119. inline
  120. const string& CPrositeEntry::GetDesc(void) const
  121. {
  122.     return m_Desc;
  123. }
  124. inline
  125. void CPrositeEntry::SetPattern(const string& s)
  126. {
  127.     m_Pattern = s;
  128. }
  129. inline
  130. string& CPrositeEntry::SetPattern(void)
  131. {
  132.     return m_Pattern;
  133. }
  134. inline
  135. const string& CPrositeEntry::GetPattern(void) const
  136. {
  137.     return m_Pattern;
  138. }
  139. inline
  140. void CPrositeEntry::SetDoc(const string& s)
  141. {
  142.     m_Doc = s;
  143. }
  144. inline
  145. string& CPrositeEntry::SetDoc(void)
  146. {
  147.     return m_Doc;
  148. }
  149. inline
  150. const string& CPrositeEntry::GetDoc(void) const
  151. {
  152.     return m_Doc;
  153. }
  154. inline
  155. void CPrositeEntry::SetSkipFlag(bool b)
  156. {
  157.     m_SkipFlag = b;
  158. }
  159. inline
  160. bool CPrositeEntry::GetSkipFlag(void) const
  161. {
  162.     return m_SkipFlag;
  163. }
  164. END_NCBI_SCOPE
  165. /*
  166.  * ===========================================================================
  167.  * $Log: prosite_entry.hpp,v $
  168.  * Revision 1000.1  2004/04/12 19:29:58  gouriano
  169.  * PRODUCTION: UPGRADED [CATCHUP_003] Dev-tree R1.4
  170.  *
  171.  * Revision 1.4  2004/01/27 18:38:08  dicuccio
  172.  * Code clean-up.  Use standard names for plugins.  Removed unnecessary #includes
  173.  *
  174.  * Revision 1.3  2003/08/17 19:25:30  jcherry
  175.  * Changed member variable names to follow convention
  176.  *
  177.  * Revision 1.2  2003/08/05 12:06:42  dicuccio
  178.  * Fixed compilation errors: string::clear() not valid for all libraries; use
  179.  * string::erase() instead.
  180.  *
  181.  * Revision 1.1  2003/08/04 20:05:45  jcherry
  182.  * Initial version
  183.  *
  184.  * ===========================================================================
  185.  */
  186. #endif  // GUI_PLUGINS_ALGO_BASIC___PROSITE_ENTRY__HPP