text_fasta.cpp
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上传日期:2007-06-13
资源大小:13604k
文件大小:4k
源码类别:

生物技术

开发平台:

C/C++

  1. /*
  2.  * ===========================================================================
  3.  * PRODUCTION $Log: text_fasta.cpp,v $
  4.  * PRODUCTION Revision 1000.1  2004/06/01 21:12:17  gouriano
  5.  * PRODUCTION PRODUCTION: UPGRADED [GCC34_MSVC7] Dev-tree R1.5
  6.  * PRODUCTION
  7.  * ===========================================================================
  8.  */
  9. /*  $Id: text_fasta.cpp,v 1000.1 2004/06/01 21:12:17 gouriano Exp $
  10.  * ===========================================================================
  11.  *
  12.  *                            PUBLIC DOMAIN NOTICE
  13.  *               National Center for Biotechnology Information
  14.  *
  15.  *  This software/database is a "United States Government Work" under the
  16.  *  terms of the United States Copyright Act.  It was written as part of
  17.  *  the author's official duties as a United States Government employee and
  18.  *  thus cannot be copyrighted.  This software/database is freely available
  19.  *  to the public for use. The National Library of Medicine and the U.S.
  20.  *  Government have not placed any restriction on its use or reproduction.
  21.  *
  22.  *  Although all reasonable efforts have been taken to ensure the accuracy
  23.  *  and reliability of the software and data, the NLM and the U.S.
  24.  *  Government do not and cannot warrant the performance or results that
  25.  *  may be obtained by using this software or data. The NLM and the U.S.
  26.  *  Government disclaim all warranties, express or implied, including
  27.  *  warranties of performance, merchantability or fitness for any particular
  28.  *  purpose.
  29.  *
  30.  *  Please cite the author in any work or product based on this material.
  31.  *
  32.  * ===========================================================================
  33.  *
  34.  * Authors:  Mike DiCuccio
  35.  *
  36.  * File Description:
  37.  *
  38.  */
  39. #include <ncbi_pch.hpp>
  40. #include <gui/widgets/seq/text_fasta.hpp>
  41. #include <gui/widgets/seq/text_fasta_ds.hpp>
  42. #include <gui/objutils/obj_clipboard.hpp>
  43. #include <objmgr/bioseq_handle.hpp>
  44. #include <connect/ncbi_conn_stream.hpp>
  45. #include <objmgr/util/sequence.hpp>
  46. BEGIN_NCBI_SCOPE
  47. USING_SCOPE(objects);
  48. CFastaTextDisplay::CFastaTextDisplay(int x, int y, int w, int h,
  49.                                      const char* label)
  50.     : CTextDisplay(x, y, w, h, label)
  51. {
  52. }
  53. CFastaTextDisplay::~CFastaTextDisplay()
  54. {
  55. }
  56. void CFastaTextDisplay::SetDataSource(CFastaTextDS& ds)
  57. {
  58.     m_DataSource.Reset(&ds);
  59.     Update();
  60. }
  61. void CFastaTextDisplay::Update()
  62. {
  63.     if ( !buffer() ) {
  64.         return;
  65.     }
  66.     if ( !m_DataSource ) {
  67.         return;
  68.     }
  69.     string str;
  70.     CBioseq_Handle handle = m_DataSource->GetBioseqHandle();
  71.     if (handle) {
  72.         CConn_MemoryStream ostr;
  73.         {{
  74.             CFastaOstream fasta_str(ostr);
  75.             fasta_str.Write(handle, &m_DataSource->GetLocation());
  76.         }}
  77.         str.resize(ostr.tellp() - CT_POS_TYPE(0));
  78.         ostr.read(const_cast<char*>(str.data()), str.size());
  79.     }
  80.     buffer()->text(str.c_str());
  81. }
  82. int CFastaTextDisplay::x_OnCopy()
  83. {
  84.     if (buffer()) {
  85.         const char* sel = buffer()->selection_text();
  86.         if (sel) {
  87.             CClipboard::Clear();
  88.             CClipboard::Add(sel);
  89.             CClipboard::Copy();
  90.             return 1;
  91.         }
  92.     }
  93.     return CTextDisplay::x_OnCopy();
  94. }
  95. END_NCBI_SCOPE
  96. /*
  97.  * ===========================================================================
  98.  * $Log: text_fasta.cpp,v $
  99.  * Revision 1000.1  2004/06/01 21:12:17  gouriano
  100.  * PRODUCTION: UPGRADED [GCC34_MSVC7] Dev-tree R1.5
  101.  *
  102.  * Revision 1.5  2004/05/21 22:27:54  gorelenk
  103.  * Added PCH ncbi_pch.hpp
  104.  *
  105.  * Revision 1.4  2004/05/07 15:43:21  dicuccio
  106.  * Use CObjClipboard
  107.  *
  108.  * Revision 1.3  2004/05/03 13:23:57  dicuccio
  109.  * gui/utils --> gui/objutils where needed
  110.  *
  111.  * Revision 1.2  2004/02/20 20:03:28  ucko
  112.  * Fix to compile with stricter implementations of CT_POS_TYPE
  113.  *
  114.  * Revision 1.1  2004/01/30 17:11:10  dicuccio
  115.  * Initial revision
  116.  *
  117.  * ===========================================================================
  118.  */