phylo_tree_slated_cladogram.cpp
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上传日期:2007-06-13
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文件大小:6k
源码类别:

生物技术

开发平台:

C/C++

  1. /*
  2.  * ===========================================================================
  3.  * PRODUCTION $Log: phylo_tree_slated_cladogram.cpp,v $
  4.  * PRODUCTION Revision 1000.1  2004/06/01 21:11:55  gouriano
  5.  * PRODUCTION PRODUCTION: UPGRADED [GCC34_MSVC7] Dev-tree R1.7
  6.  * PRODUCTION
  7.  * ===========================================================================
  8.  */
  9. /*  $Id: phylo_tree_slated_cladogram.cpp,v 1000.1 2004/06/01 21:11:55 gouriano Exp $
  10.  * ===========================================================================
  11.  *
  12.  *                            PUBLIC DOMAIN NOTICE
  13.  *               National Center for Biotechnology Information
  14.  *
  15.  *  This software/database is a "United States Government Work" under the
  16.  *  terms of the United States Copyright Act.  It was written as part of
  17.  *  the author's official duties as a United States Government employee and
  18.  *  thus cannot be copyrighted.  This software/database is freely available
  19.  *  to the public for use. The National Library of Medicine and the U.S.
  20.  *  Government have not placed any restriction on its use or reproduction.
  21.  *
  22.  *  Although all reasonable efforts have been taken to ensure the accuracy
  23.  *  and reliability of the software and data, the NLM and the U.S.
  24.  *  Government do not and cannot warrant the performance or results that
  25.  *  may be obtained by using this software or data. The NLM and the U.S.
  26.  *  Government disclaim all warranties, express or implied, including
  27.  *  warranties of performance, merchantability or fitness for any particular
  28.  *  purpose.
  29.  *
  30.  *  Please cite the author in any work or product based on this material.
  31.  *
  32.  * ===========================================================================
  33.  *
  34.  * Authors:  Vladimir Tereshkov
  35.  *
  36.  * File Description:
  37.  *
  38.  */
  39. #include <ncbi_pch.hpp>
  40. #include <corelib/ncbistl.hpp>
  41. #include <gui/opengl/glhelpers.hpp>
  42. #include <gui/graph/igraph_utils.hpp>
  43. #include <gui/widgets/phylo_tree/phylo_tree_render.hpp>
  44. #include <gui/widgets/phylo_tree/phylo_tree_slated_cladogram.hpp>
  45. #include <FL/Fl.H>
  46. #include <math.h>
  47. BEGIN_NCBI_SCOPE
  48. CPhyloSlatedCladogram::CPhyloSlatedCladogram()
  49. {   
  50. }
  51. CPhyloSlatedCladogram::~CPhyloSlatedCladogram()
  52. {
  53. }
  54. void  CPhyloSlatedCladogram::x_Layout(CPhyloTreeDataSource& ds)
  55. {
  56.     m_Leafs = ds.GetSize();
  57.     m_Width = ds.GetWidth();
  58.     //m_xStep = (m_DimX - m_LeftMargin - m_RightMargin) /  width;
  59.     m_yStep = (m_DimY - m_TopMargin - m_BottomMargin) / (m_Leafs-1); 
  60.     m_xStep = m_yStep;
  61.     x_Calculate(ds.GetTree()); 
  62.     
  63.     
  64.     // changing raster - x_Calculate for shure changed size in unpredictable way
  65.     TModelRect newRect = ds.GetBoundRect();
  66.     
  67.     m_RasterRect.Init(newRect.Left() - m_LeftMargin, 
  68.                       newRect.Top() - m_TopMargin,                      
  69.                       newRect.Right() + m_RightMargin, 
  70.                       newRect.Bottom() + m_BottomMargin);    
  71. }
  72. void  CPhyloSlatedCladogram::x_Render(CGlPane& pane, CPhyloTreeDataSource& ds)
  73. {    
  74.     pane.OpenOrtho();        
  75.     x_DrawTree(ds.GetTree());    
  76.     pane.Close();   
  77. }
  78. void CPhyloSlatedCladogram:: x_Calculate(CPhyloTreeNode * node)
  79.     if (node->IsLeaf()) {
  80.         node->XY().first  = (m_DimX - m_RightMargin);                                  // all leafs on the right
  81.         node->XY().second = (m_DimY - m_TopMargin - node->IDX().second * m_yStep);     // y coordinate 
  82.         node->SetAngle(0); // for correct labeling
  83.     }
  84.     else {        
  85.         Int4 childLeafs = 0;
  86.         x_CountLeafs(node, childLeafs);                            
  87.        
  88.         node->XY().first  = (m_DimX - m_RightMargin - (childLeafs-1) * m_xStep);                          
  89.         node->XY().second = (m_DimY - m_TopMargin - node->IDX().second * m_yStep - ((childLeafs-1)*m_yStep)/2.0);
  90.         
  91.         for(CPhyloTreeNode::TNodeList_I  it = node->SubNodeBegin();  it != node->SubNodeEnd(); it++ )  x_Calculate((*it)->GetValue());                 
  92.     }   
  93. }
  94. void CPhyloSlatedCladogram :: x_DrawTree(CPhyloTreeNode * node)
  95. {      
  96.     // label
  97.     if (m_pLabelFont && node->IsLeaf()) {
  98.      //   x_RenderText(node->GetValue()->XY().first, node->GetValue()->XY().second, node->GetLabel());
  99.           CGlPoint<int> labelPos(node->GetValue()->XY().first, node->GetValue()->XY().second);
  100.           m_Label.Render(*m_pPane, labelPos, node->GetLabel(), node->GetSelected());
  101.     }
  102.     
  103.     // drawing leaf node                             
  104.     if (node->GetParent()){
  105.         x_RenderLine(node->GetParent()->GetValue()->XY().first + m_LineWidth, node->GetParent()->GetValue()->XY().second,
  106.                      node->GetValue()->XY().first, node->GetValue()->XY().second, m_LineWidth, node->GetSelected()?m_LineSelColor:m_LineColor, node->GetSelected()?m_LineSelHiColor:m_LineHiColor);
  107.         //x_RenderSpline(node->GetParent()->GetValue()->XY().first + m_LineWidth, node->GetParent()->GetValue()->XY().second,
  108.           //             node->GetValue()->XY().first, node->GetValue()->XY().second);
  109.     }
  110.     for(CPhyloTreeNode::TNodeList_I  it = node->SubNodeBegin();  it != node->SubNodeEnd(); it++ )  x_DrawTree((*it)->GetValue());         
  111.     x_RenderNode(node->GetValue()->XY().first, node->GetValue()->XY().second, m_NodeSize,   node->GetSelected()?m_NodeSelColor:m_NodeColor);
  112. }
  113.     
  114. void CPhyloSlatedCladogram :: x_CountLeafs(CPhyloTreeNode * node, Int4 & lfCount)
  115. {     
  116.     if (node->IsLeaf()) lfCount++;
  117.     for (CPhyloTreeNode::TNodeList_I  it = node->SubNodeBegin();  it != node->SubNodeEnd(); it++) x_CountLeafs((*it)->GetValue(), lfCount);    
  118. }
  119. string CPhyloSlatedCladogram::GetDescription(void)
  120. {
  121.     return "Slated Cladogram";
  122. }
  123. END_NCBI_SCOPE
  124. /*
  125.  * ===========================================================================
  126.  * $Log: phylo_tree_slated_cladogram.cpp,v $
  127.  * Revision 1000.1  2004/06/01 21:11:55  gouriano
  128.  * PRODUCTION: UPGRADED [GCC34_MSVC7] Dev-tree R1.7
  129.  *
  130.  * Revision 1.7  2004/05/21 22:27:54  gorelenk
  131.  * Added PCH ncbi_pch.hpp
  132.  *
  133.  * Revision 1.6  2004/04/20 21:57:19  tereshko
  134.  * Major rendering, labeling and performance improvements
  135.  *
  136.  * Revision 1.5  2004/04/13 20:28:53  tereshko
  137.  * Numerous renderers improvements
  138.  *
  139.  * Revision 1.4  2004/04/01 21:47:25  tereshko
  140.  * Code clean-up
  141.  *
  142.  * Revision 1.3  2004/02/23 22:52:27  tereshko
  143.  * Rendering Improvements
  144.  *
  145.  * Revision 1.2  2004/02/23 15:40:30  tereshko
  146.  * Layout improvements
  147.  *
  148.  * Revision 1.1  2004/02/13 17:05:14  tereshko
  149.  * Phylogenetic Tree Widget initial revision
  150.  *
  151.  * ===========================================================================
  152.  */