seqdbvolset.cpp
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上传日期:2007-06-13
资源大小:13604k
文件大小:2k
源码类别:

生物技术

开发平台:

C/C++

  1. /*
  2.  * ===========================================================================
  3.  * PRODUCTION $Log: seqdbvolset.cpp,v $
  4.  * PRODUCTION Revision 1000.1  2004/06/01 19:46:57  gouriano
  5.  * PRODUCTION PRODUCTION: UPGRADED [GCC34_MSVC7] Dev-tree R1.4
  6.  * PRODUCTION
  7.  * ===========================================================================
  8.  */
  9. /*  $Id: seqdbvolset.cpp,v 1000.1 2004/06/01 19:46:57 gouriano Exp $
  10.  * ===========================================================================
  11.  *
  12.  *                            PUBLIC DOMAIN NOTICE
  13.  *               National Center for Biotechnology Information
  14.  *
  15.  *  This software/database is a "United States Government Work" under the
  16.  *  terms of the United States Copyright Act.  It was written as part of
  17.  *  the author's official duties as a United States Government employee and
  18.  *  thus cannot be copyrighted.  This software/database is freely available
  19.  *  to the public for use. The National Library of Medicine and the U.S.
  20.  *  Government have not placed any restriction on its use or reproduction.
  21.  *
  22.  *  Although all reasonable efforts have been taken to ensure the accuracy
  23.  *  and reliability of the software and data, the NLM and the U.S.
  24.  *  Government do not and cannot warrant the performance or results that
  25.  *  may be obtained by using this software or data. The NLM and the U.S.
  26.  *  Government disclaim all warranties, express or implied, including
  27.  *  warranties of performance, merchantability or fitness for any particular
  28.  *  purpose.
  29.  *
  30.  *  Please cite the author in any work or product based on this material.
  31.  *
  32.  * ===========================================================================
  33.  *
  34.  * Author:  Kevin Bealer
  35.  *
  36.  */
  37. #include <ncbi_pch.hpp>
  38. #include "seqdbvolset.hpp"
  39. BEGIN_NCBI_SCOPE
  40. CSeqDBVolSet::CSeqDBVolSet(CSeqDBMemPool        & mempool,
  41.                            const vector<string> & vol_names,
  42.                            char                   prot_nucl,
  43.                            bool                   use_mmap)
  44.     : m_RecentVol(0)
  45. {
  46.     for(Uint4 i = 0; i < vol_names.size(); i++) {
  47.         x_AddVolume(mempool, vol_names[i], prot_nucl, use_mmap);
  48.         
  49.         if (prot_nucl == kSeqTypeUnkn) {
  50.             // Once one volume picks a prot/nucl type, enforce that
  51.             // for the rest of the volumes.  This should happen at
  52.             // most once.
  53.             
  54.             prot_nucl = m_VolList.back().Vol()->GetSeqType();
  55.         }
  56.     }
  57. }
  58. END_NCBI_SCOPE