genome_item.cpp
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上传日期:2007-06-13
资源大小:13604k
文件大小:3k
源码类别:

生物技术

开发平台:

C/C++

  1. /*
  2.  * ===========================================================================
  3.  * PRODUCTION $Log: genome_item.cpp,v $
  4.  * PRODUCTION Revision 1000.1  2004/06/01 19:44:43  gouriano
  5.  * PRODUCTION PRODUCTION: UPGRADED [GCC34_MSVC7] Dev-tree R1.4
  6.  * PRODUCTION
  7.  * ===========================================================================
  8.  */
  9. /*  $Id: genome_item.cpp,v 1000.1 2004/06/01 19:44:43 gouriano Exp $
  10. * ===========================================================================
  11. *
  12. *                            PUBLIC DOMAIN NOTICE
  13. *               National Center for Biotechnology Information
  14. *
  15. *  This software/database is a "United States Government Work" under the
  16. *  terms of the United States Copyright Act.  It was written as part of
  17. *  the author's official duties as a United States Government employee and
  18. *  thus cannot be copyrighted.  This software/database is freely available
  19. *  to the public for use. The National Library of Medicine and the U.S.
  20. *  Government have not placed any restriction on its use or reproduction.
  21. *
  22. *  Although all reasonable efforts have been taken to ensure the accuracy
  23. *  and reliability of the software and data, the NLM and the U.S.
  24. *  Government do not and cannot warrant the performance or results that
  25. *  may be obtained by using this software or data. The NLM and the U.S.
  26. *  Government disclaim all warranties, express or implied, including
  27. *  warranties of performance, merchantability or fitness for any particular
  28. *  purpose.
  29. *
  30. *  Please cite the author in any work or product based on this material.
  31. *
  32. * ===========================================================================
  33. *
  34. * Author:  Mati Shomrat, NCBI
  35. *
  36. * File Description:
  37. *   Genome item for flat-file
  38. *
  39. */
  40. #include <ncbi_pch.hpp>
  41. #include <corelib/ncbistd.hpp>
  42. #include <objtools/format/formatter.hpp>
  43. #include <objtools/format/text_ostream.hpp>
  44. #include <objtools/format/items/genome_item.hpp>
  45. #include <objtools/format/context.hpp>
  46. BEGIN_NCBI_SCOPE
  47. BEGIN_SCOPE(objects)
  48. CGenomeItem::CGenomeItem(CBioseqContext& ctx) :
  49.     CFlatItem(&ctx)
  50. {
  51. }
  52. void CGenomeItem::Format
  53. (IFormatter& formatter,
  54.  IFlatTextOStream& text_os) const
  55. {
  56.     formatter.FormatGenome(*this, text_os);
  57. }
  58. void CGenomeItem::x_GatherInfo(CBioseqContext& ctx)
  59. {
  60.     // !!!
  61. }
  62. END_SCOPE(objects)
  63. END_NCBI_SCOPE
  64. /*
  65. * ===========================================================================
  66. *
  67. * $Log: genome_item.cpp,v $
  68. * Revision 1000.1  2004/06/01 19:44:43  gouriano
  69. * PRODUCTION: UPGRADED [GCC34_MSVC7] Dev-tree R1.4
  70. *
  71. * Revision 1.4  2004/05/21 21:42:54  gorelenk
  72. * Added PCH ncbi_pch.hpp
  73. *
  74. * Revision 1.3  2004/04/22 16:00:44  shomrat
  75. * Changes in context
  76. *
  77. * Revision 1.2  2003/12/18 17:43:34  shomrat
  78. * context.hpp moved
  79. *
  80. * Revision 1.1  2003/12/17 20:22:30  shomrat
  81. * Initial Revision (adapted from flat lib)
  82. *
  83. *
  84. * ===========================================================================
  85. */