flat_file_config.cpp
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上传日期:2007-06-13
资源大小:13604k
文件大小:5k
源码类别:

生物技术

开发平台:

C/C++

  1. /*
  2.  * ===========================================================================
  3.  * PRODUCTION $Log: flat_file_config.cpp,v $
  4.  * PRODUCTION Revision 1000.0  2004/06/01 19:50:00  gouriano
  5.  * PRODUCTION PRODUCTION: IMPORTED [GCC34_MSVC7] Dev-tree R1.2
  6.  * PRODUCTION
  7.  * ===========================================================================
  8.  */
  9. /*  $Id: flat_file_config.cpp,v 1000.0 2004/06/01 19:50:00 gouriano Exp $
  10. * ===========================================================================
  11. *
  12. *                            PUBLIC DOMAIN NOTICE
  13. *               National Center for Biotechnology Information
  14. *
  15. *  This software/database is a "United States Government Work" under the
  16. *  terms of the United States Copyright Act.  It was written as part of
  17. *  the author's official duties as a United States Government employee and
  18. *  thus cannot be copyrighted.  This software/database is freely available
  19. *  to the public for use. The National Library of Medicine and the U.S.
  20. *  Government have not placed any restriction on its use or reproduction.
  21. *
  22. *  Although all reasonable efforts have been taken to ensure the accuracy
  23. *  and reliability of the software and data, the NLM and the U.S.
  24. *  Government do not and cannot warrant the performance or results that
  25. *  may be obtained by using this software or data. The NLM and the U.S.
  26. *  Government disclaim all warranties, express or implied, including
  27. *  warranties of performance, merchantability or fitness for any particular
  28. *  purpose.
  29. *
  30. *  Please cite the author in any work or product based on this material.
  31. *
  32. * ===========================================================================
  33. *
  34. * Author:  Mati Shomrat
  35. *
  36. * File Description:
  37. *   Configuration class for flat-file generator
  38. *   
  39. */
  40. #include <ncbi_pch.hpp>
  41. #include <corelib/ncbistd.hpp>
  42. #include <objtools/format/flat_file_config.hpp>
  43. BEGIN_NCBI_SCOPE
  44. BEGIN_SCOPE(objects)
  45. // -- constructor
  46. CFlatFileConfig::CFlatFileConfig
  47. (TFormat format,
  48.  TMode mode,
  49.  TStyle style,
  50.  TFlags flags,
  51.  TView view) :
  52.     m_Format(format), m_Mode(mode), m_Style(style), m_View(view), m_Flags(flags)
  53. {
  54. }
  55. // -- destructor
  56. CFlatFileConfig::~CFlatFileConfig(void)
  57. {
  58. }
  59. // -- mode flags
  60. // mode flags initialization
  61. const bool CFlatFileConfig::sm_ModeFlags[4][26] = {
  62.     // Release
  63.     { 
  64.         true, true, true, true, true, true, true, true, true, true,
  65.         true, true, true, true, true, true, true, true, true, true,
  66.         true, true, true, true, true, true
  67.     },
  68.     // Entrez
  69.     {
  70.         false, true, true, true, true, false, true, true, true, true,
  71.         true, false, true, true, true, true, false, false, true, true,
  72.         true, true, true, true, false, true
  73.     },
  74.     // GBench
  75.     {
  76.         false, false, false, false, false, false, false, true, false, false,
  77.         false, false, false, false, false, false, false, false, false, false,
  78.         false, false, false, false, false, false
  79.     },
  80.     // Dump
  81.     {
  82.         false, false, false, false, false, false, false, false, false, false,
  83.         false, false, false, false, false, false, false, false, false, false,
  84.         false, false, false, false, false, false
  85.     }
  86. };
  87. #define MODE_FLAG_GET(x, y) 
  88. bool CFlatFileConfig::x(void) const 
  89.     return sm_ModeFlags[static_cast<size_t>(m_Mode)][y]; 
  90.     
  91. MODE_FLAG_GET(SuppressLocalId, 0);
  92. MODE_FLAG_GET(ValidateFeats, 1);
  93. MODE_FLAG_GET(IgnorePatPubs, 2);
  94. MODE_FLAG_GET(DropShortAA, 3);
  95. MODE_FLAG_GET(AvoidLocusColl, 4);
  96. MODE_FLAG_GET(IupacaaOnly, 5);
  97. MODE_FLAG_GET(DropBadCitGens, 6);
  98. MODE_FLAG_GET(NoAffilOnUnpub, 7);
  99. MODE_FLAG_GET(DropIllegalQuals, 8);
  100. MODE_FLAG_GET(CheckQualSyntax, 9);
  101. MODE_FLAG_GET(NeedRequiredQuals, 10);
  102. MODE_FLAG_GET(NeedOrganismQual, 11);
  103. MODE_FLAG_GET(NeedAtLeastOneRef, 12);
  104. MODE_FLAG_GET(CitArtIsoJta, 13);
  105. MODE_FLAG_GET(DropBadDbxref, 14);
  106. MODE_FLAG_GET(UseEmblMolType, 15);
  107. MODE_FLAG_GET(HideBankItComment, 16);
  108. MODE_FLAG_GET(CheckCDSProductId, 17);
  109. MODE_FLAG_GET(SuppressSegLoc, 18);
  110. MODE_FLAG_GET(SrcQualsToNote, 19);
  111. MODE_FLAG_GET(HideEmptySource, 20);
  112. MODE_FLAG_GET(GoQualsToNote, 21);
  113. MODE_FLAG_GET(GeneSynsToNote, 22);
  114. MODE_FLAG_GET(SelenocysteineToNote, 23);
  115. MODE_FLAG_GET(ForGBRelease, 24);
  116. MODE_FLAG_GET(HideUnclassPartial, 25);
  117. #undef MODE_FLAG_GET
  118. END_SCOPE(objects)
  119. END_NCBI_SCOPE
  120. /*
  121. * ===========================================================================
  122. *
  123. * $Log: flat_file_config.cpp,v $
  124. * Revision 1000.0  2004/06/01 19:50:00  gouriano
  125. * PRODUCTION: IMPORTED [GCC34_MSVC7] Dev-tree R1.2
  126. *
  127. * Revision 1.2  2004/05/21 21:42:54  gorelenk
  128. * Added PCH ncbi_pch.hpp
  129. *
  130. * Revision 1.1  2004/04/22 16:03:23  shomrat
  131. * Initial Revision (from context)
  132. *
  133. *
  134. * ===========================================================================
  135. */