ftable_gather.cpp
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上传日期:2007-06-13
资源大小:13604k
文件大小:3k
源码类别:

生物技术

开发平台:

C/C++

  1. /*
  2.  * ===========================================================================
  3.  * PRODUCTION $Log: ftable_gather.cpp,v $
  4.  * PRODUCTION Revision 1000.1  2004/06/01 19:44:29  gouriano
  5.  * PRODUCTION PRODUCTION: UPGRADED [GCC34_MSVC7] Dev-tree R1.4
  6.  * PRODUCTION
  7.  * ===========================================================================
  8.  */
  9. /*  $Id: ftable_gather.cpp,v 1000.1 2004/06/01 19:44:29 gouriano Exp $
  10. * ===========================================================================
  11. *
  12. *                            PUBLIC DOMAIN NOTICE
  13. *               National Center for Biotechnology Information
  14. *
  15. *  This software/database is a "United States Government Work" under the
  16. *  terms of the United States Copyright Act.  It was written as part of
  17. *  the author's official duties as a United States Government employee and
  18. *  thus cannot be copyrighted.  This software/database is freely available
  19. *  to the public for use. The National Library of Medicine and the U.S.
  20. *  Government have not placed any restriction on its use or reproduction.
  21. *
  22. *  Although all reasonable efforts have been taken to ensure the accuracy
  23. *  and reliability of the software and data, the NLM and the U.S.
  24. *  Government do not and cannot warrant the performance or results that
  25. *  may be obtained by using this software or data. The NLM and the U.S.
  26. *  Government disclaim all warranties, express or implied, including
  27. *  warranties of performance, merchantability or fitness for any particular
  28. *  purpose.
  29. *
  30. *  Please cite the author in any work or product based on this material.
  31. *
  32. * ===========================================================================
  33. *
  34. * Author:  Aaron Ucko, NCBI
  35. *
  36. * File Description:
  37. *   5-Column feature table data gathering  
  38. *
  39. * ===========================================================================
  40. */
  41. #include <ncbi_pch.hpp>
  42. #include <corelib/ncbistd.hpp>
  43. #include <objtools/format/item_ostream.hpp>
  44. #include <objtools/format/items/source_item.hpp>
  45. #include <objtools/format/items/reference_item.hpp>
  46. #include <objtools/format/items/ctrl_items.hpp>
  47. #include <objtools/format/items/feature_item.hpp>
  48. #include <objtools/format/gather_items.hpp>
  49. #include <objtools/format/ftable_gather.hpp>
  50. #include <objtools/format/context.hpp>
  51. BEGIN_NCBI_SCOPE
  52. BEGIN_SCOPE(objects)
  53. CFtableGatherer::CFtableGatherer(void)
  54. {
  55. }
  56. void CFtableGatherer::x_DoSingleSection(CBioseqContext& ctx) const
  57. {
  58.     ItemOS() << new CStartSectionItem(ctx);
  59.     ItemOS() << new CFeatHeaderItem(ctx);
  60.     if ( ctx.Config().ShowFtableRefs() ) {
  61.         x_GatherReferences();
  62.     }
  63.     if ( !ctx.Config().HideSourceFeats() ) {
  64.         x_GatherSourceFeatures();
  65.     }
  66.     x_GatherFeatures();
  67.     
  68.     ItemOS() << new CEndSectionItem(ctx);
  69. }
  70. END_SCOPE(objects)
  71. END_NCBI_SCOPE
  72. /*
  73. * ===========================================================================
  74. *
  75. * $Log: ftable_gather.cpp,v $
  76. * Revision 1000.1  2004/06/01 19:44:29  gouriano
  77. * PRODUCTION: UPGRADED [GCC34_MSVC7] Dev-tree R1.4
  78. *
  79. * Revision 1.4  2004/05/21 21:42:54  gorelenk
  80. * Added PCH ncbi_pch.hpp
  81. *
  82. * Revision 1.3  2004/04/22 15:58:27  shomrat
  83. * Changes in context
  84. *
  85. * Revision 1.2  2004/04/07 14:51:24  shomrat
  86. * Fixed typo
  87. *
  88. * Revision 1.1  2004/04/07 14:26:40  shomrat
  89. * Initial Revision
  90. *
  91. *
  92. * ===========================================================================
  93. */