defline_item.cpp
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上传日期:2007-06-13
资源大小:13604k
文件大小:3k
源码类别:

生物技术

开发平台:

C/C++

  1. /*
  2.  * ===========================================================================
  3.  * PRODUCTION $Log: defline_item.cpp,v $
  4.  * PRODUCTION Revision 1000.1  2004/06/01 19:44:04  gouriano
  5.  * PRODUCTION PRODUCTION: UPGRADED [GCC34_MSVC7] Dev-tree R1.4
  6.  * PRODUCTION
  7.  * ===========================================================================
  8.  */
  9. /*  $Id: defline_item.cpp,v 1000.1 2004/06/01 19:44:04 gouriano Exp $
  10. * ===========================================================================
  11. *
  12. *                            PUBLIC DOMAIN NOTICE
  13. *               National Center for Biotechnology Information
  14. *
  15. *  This software/database is a "United States Government Work" under the
  16. *  terms of the United States Copyright Act.  It was written as part of
  17. *  the author's official duties as a United States Government employee and
  18. *  thus cannot be copyrighted.  This software/database is freely available
  19. *  to the public for use. The National Library of Medicine and the U.S.
  20. *  Government have not placed any restriction on its use or reproduction.
  21. *
  22. *  Although all reasonable efforts have been taken to ensure the accuracy
  23. *  and reliability of the software and data, the NLM and the U.S.
  24. *  Government do not and cannot warrant the performance or results that
  25. *  may be obtained by using this software or data. The NLM and the U.S.
  26. *  Government disclaim all warranties, express or implied, including
  27. *  warranties of performance, merchantability or fitness for any particular
  28. *  purpose.
  29. *
  30. *  Please cite the author in any work or product based on this material.
  31. *
  32. * ===========================================================================
  33. *
  34. * Author:  Mati Shomrat, NCBI
  35. *
  36. * File Description:
  37. *   flat-file generator -- defline item implementation
  38. *
  39. */
  40. #include <ncbi_pch.hpp>
  41. #include <corelib/ncbistd.hpp>
  42. #include <objmgr/util/sequence.hpp>
  43. #include <objtools/format/formatter.hpp>
  44. #include <objtools/format/text_ostream.hpp>
  45. #include <objtools/format/items/defline_item.hpp>
  46. #include <objtools/format/context.hpp>
  47. BEGIN_NCBI_SCOPE
  48. BEGIN_SCOPE(objects)
  49. CDeflineItem::CDeflineItem(CBioseqContext& ctx) :
  50.     CFlatItem(&ctx)
  51. {
  52.     x_GatherInfo(ctx);
  53. }
  54. void CDeflineItem::Format
  55. (IFormatter& formatter,
  56.  IFlatTextOStream& text_os) const
  57. {
  58.     formatter.FormatDefline(*this, text_os);
  59. }
  60. const string& CDeflineItem::GetDefline(void) const
  61. {
  62.     return m_Defline;
  63. }
  64. /***************************************************************************/
  65. /*                                  PRIVATE                                */
  66. /***************************************************************************/
  67. void CDeflineItem::x_GatherInfo(CBioseqContext& ctx)
  68. {
  69.     m_Defline = sequence::GetTitle(ctx.GetHandle());
  70.     if ( !NStr::EndsWith(m_Defline, ".") ) {
  71.         m_Defline += '.';
  72.     }
  73. }
  74. END_SCOPE(objects)
  75. END_NCBI_SCOPE
  76. /*
  77. * ===========================================================================
  78. *
  79. * $Log: defline_item.cpp,v $
  80. * Revision 1000.1  2004/06/01 19:44:04  gouriano
  81. * PRODUCTION: UPGRADED [GCC34_MSVC7] Dev-tree R1.4
  82. *
  83. * Revision 1.4  2004/05/21 21:42:54  gorelenk
  84. * Added PCH ncbi_pch.hpp
  85. *
  86. * Revision 1.3  2004/04/22 15:55:41  shomrat
  87. * Changes in context
  88. *
  89. * Revision 1.2  2003/12/18 17:43:32  shomrat
  90. * context.hpp moved
  91. *
  92. * Revision 1.1  2003/12/17 20:19:43  shomrat
  93. * Initial Revision (adapted from flat lib)
  94. *
  95. *
  96. * ===========================================================================
  97. */