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utils.cpp
资源名称：ncbi_cxx_win--Jul_08_2004.zip　[点击查看]
上传用户：yhdzpy8989
上传日期：2007-06-13
资源大小：13604k
文件大小：3k
源码类别：

生物技术

开发平台：

C/C++

utils.cpp：源码内容
  1. /*
  2.  * ===========================================================================
  3.  * PRODUCTION $Log: utils.cpp,v $
  4.  * PRODUCTION Revision 1000.1  2004/06/01 19:35:20  gouriano
  5.  * PRODUCTION PRODUCTION: UPGRADED [GCC34_MSVC7] Dev-tree R6.7
  6.  * PRODUCTION
  7.  * ===========================================================================
  8.  */
  10. /*  $Id: utils.cpp,v 1000.1 2004/06/01 19:35:20 gouriano Exp $
  11. * ===========================================================================
  12. *
  13. *                            PUBLIC DOMAIN NOTICE
  14. *               National Center for Biotechnology Information
  15. *
  16. *  This software/database is a "United States Government Work" under the
  17. *  terms of the United States Copyright Act.  It was written as part of
  18. *  the author's official duties as a United States Government employee and
  19. *  thus cannot be copyrighted.  This software/database is freely available
  20. *  to the public for use. The National Library of Medicine and the U.S.
  21. *  Government have not placed any restriction on its use or reproduction.
  22. *
  23. *  Although all reasonable efforts have been taken to ensure the accuracy
  24. *  and reliability of the software and data, the NLM and the U.S.
  25. *  Government do not and cannot warrant the performance or results that
  26. *  may be obtained by using this software or data. The NLM and the U.S.
  27. *  Government disclaim all warranties, express or implied, including
  28. *  warranties of performance, merchantability or fitness for any particular
  29. *  purpose.
  30. *
  31. *  Please cite the author in any work or product based on this material.
  32. *
  33. * ===========================================================================
  34. *
  35. * File Name:  utils.cpp
  36. *
  37. * Author:  Michael Domrachev
  38. *
  39. * File Description:  Taxon1 object module utility functions
  40. *
  41. */
  43. #include <ncbi_pch.hpp>
  44. #include <objects/taxon1/taxon1.hpp>
  46. #include "ctreecont.hpp"
  47. #include "cache.hpp"
  49. BEGIN_NCBI_SCOPE
  50. BEGIN_objects_SCOPE
  53. //////////////////////////////////
  54. //  CTaxon1Node implementation
  55. //
  56. #define TXC_INH_DIV 0x4000000
  57. #define TXC_INH_GC  0x8000000
  58. #define TXC_INH_MGC 0x10000000
  59. /* the following three flags are the same (it is not a bug) */
  60. #define TXC_SUFFIX  0x20000000
  61. #define TXC_UPDATED 0x20000000
  62. #define TXC_UNCULTURED 0x20000000
  64. #define TXC_GBHIDE  0x40000000
  65. #define TXC_STHIDE  0x80000000
  67. short
  68. CTaxon1Node::GetRank() const
  69. {
  70.     return ((m_ref->GetCde())&0xff)-1;
  71. }
  73. short
  74. CTaxon1Node::GetDivision() const
  75. {
  76.     return (m_ref->GetCde()>>8)&0x3f;
  77. }
  79. short
  80. CTaxon1Node::GetGC() const
  81. {
  82.     return (m_ref->GetCde()>>(8+6))&0x3f;
  83. }
  85. short
  86. CTaxon1Node::GetMGC() const
  87. {
  88.     return (m_ref->GetCde()>>(8+6+6))&0x3f;
  89. }
  91. bool
  92. CTaxon1Node::IsUncultured() const
  93. {
  94.     return m_ref->GetCde() & TXC_UNCULTURED ? true : false;
  95. }
  97. bool
  98. CTaxon1Node::IsGenBankHidden() const
  99. {
  100.     return m_ref->GetCde() & TXC_GBHIDE ? true : false;
  101. }
  104. END_objects_SCOPE
  105. END_NCBI_SCOPE