Seqdesc.cpp
上传用户:yhdzpy8989
上传日期:2007-06-13
资源大小:13604k
文件大小:6k
源码类别:

生物技术

开发平台:

C/C++

  1. /*
  2.  * ===========================================================================
  3.  * PRODUCTION $Log: Seqdesc.cpp,v $
  4.  * PRODUCTION Revision 1000.1  2004/06/01 19:33:22  gouriano
  5.  * PRODUCTION PRODUCTION: UPGRADED [GCC34_MSVC7] Dev-tree R6.4
  6.  * PRODUCTION
  7.  * ===========================================================================
  8.  */
  9. /* $Id: Seqdesc.cpp,v 1000.1 2004/06/01 19:33:22 gouriano Exp $
  10.  * ===========================================================================
  11.  *
  12.  *                            PUBLIC DOMAIN NOTICE
  13.  *               National Center for Biotechnology Information
  14.  *
  15.  *  This software/database is a "United States Government Work" under the
  16.  *  terms of the United States Copyright Act.  It was written as part of
  17.  *  the author's official duties as a United States Government employee and
  18.  *  thus cannot be copyrighted.  This software/database is freely available
  19.  *  to the public for use. The National Library of Medicine and the U.S.
  20.  *  Government have not placed any restriction on its use or reproduction.
  21.  *
  22.  *  Although all reasonable efforts have been taken to ensure the accuracy
  23.  *  and reliability of the software and data, the NLM and the U.S.
  24.  *  Government do not and cannot warrant the performance or results that
  25.  *  may be obtained by using this software or data. The NLM and the U.S.
  26.  *  Government disclaim all warranties, express or implied, including
  27.  *  warranties of performance, merchantability or fitness for any particular
  28.  *  purpose.
  29.  *
  30.  *  Please cite the author in any work or product based on this material.
  31.  *
  32.  * ===========================================================================
  33.  *
  34.  * Author:  .......
  35.  *
  36.  * File Description:
  37.  *   .......
  38.  *
  39.  * Remark:
  40.  *   This code was originally generated by application DATATOOL
  41.  *   using specifications from the ASN data definition file
  42.  *   'seq.asn'.
  43.  */
  44. // standard includes
  45. #include <ncbi_pch.hpp>
  46. #include <serial/enumvalues.hpp>
  47. // generated includes
  48. #include <objects/general/Date.hpp>
  49. #include <objects/general/Dbtag.hpp>
  50. #include <objects/general/User_object.hpp>
  51. #include <objects/pub/Pub_equiv.hpp>
  52. #include <objects/seq/Seqdesc.hpp>
  53. #include <objects/seq/MolInfo.hpp>
  54. #include <objects/seqfeat/Org_ref.hpp>
  55. #include <objects/seqfeat/BioSource.hpp>
  56. // generated classes
  57. BEGIN_NCBI_SCOPE
  58. BEGIN_objects_SCOPE // namespace ncbi::objects::
  59. // destructor
  60. CSeqdesc::~CSeqdesc(void)
  61. {
  62. }
  63. static void s_GetContentLabel(const CSeqdesc& desc, string* const label)
  64. {
  65.     const CEnumeratedTypeValues* tv;
  66.     switch (desc.Which()) {
  67.     case CSeqdesc::e_Comment:
  68.         (*label) += desc.GetComment();
  69.         return;
  70.     case CSeqdesc::e_Region:
  71.         (*label) += desc.GetRegion();
  72.         return;
  73.     case CSeqdesc::e_Het:
  74.         (*label) += desc.GetHet();
  75.         return;
  76.     case CSeqdesc::e_Title:
  77.         (*label) += desc.GetTitle();
  78.         return;
  79.     case CSeqdesc::e_Name:
  80.         (*label) += desc.GetName();
  81.         return;
  82.     case CSeqdesc::e_Create_date:
  83.         desc.GetCreate_date().GetDate(label);
  84.         return;
  85.     case CSeqdesc::e_Update_date:
  86.         desc.GetUpdate_date().GetDate(label);
  87.         return;
  88.     case CSeqdesc::e_Org:
  89.         desc.GetOrg().GetLabel(label);
  90.         return;
  91.     case CSeqdesc::e_Pub:
  92.         desc.GetPub().GetPub().GetLabel(label);
  93.         return;
  94.     case CSeqdesc::e_User:
  95.         desc.GetUser().GetLabel(label);
  96.         return;
  97.     case CSeqdesc::e_Method:
  98.         tv = GetTypeInfo_enum_EGIBB_method();
  99.         (*label) += tv->FindName(desc.GetMethod(), true);
  100.         return;
  101.     case CSeqdesc::e_Mol_type:
  102.         tv = GetTypeInfo_enum_EGIBB_mol();
  103.         (*label) += tv->FindName(desc.GetMol_type(), true);
  104.         return;
  105.     case CSeqdesc::e_Modif:
  106.         ITERATE(list<EGIBB_mod>, it, desc.GetModif()) {
  107.             tv = GetTypeInfo_enum_EGIBB_mod();
  108.             if (!label->empty()) {
  109.                 (*label) += string(",") + tv->FindName(*it, true);
  110.             } else {
  111.                 (*label) += tv->FindName(*it, true);
  112.             }
  113.         }
  114.         return;
  115.     case CSeqdesc::e_Source:
  116.         desc.GetSource().GetOrg().GetLabel(label);
  117.         return;
  118.     case CSeqdesc::e_Maploc:
  119.         desc.GetMaploc().GetLabel(label);
  120.         return;
  121.     case CSeqdesc::e_Molinfo:
  122.         desc.GetMolinfo().GetLabel(label);
  123.         return;
  124.     case CSeqdesc::e_Dbxref:
  125.         desc.GetDbxref().GetLabel(label);
  126.         return;
  127.     default:
  128.         return;
  129.     }
  130. }
  131. void CSeqdesc::GetLabel(string* const label, ELabelType label_type) const
  132. {
  133.     // Return if label is null
  134.     if (!label) {
  135.         return;
  136.     }
  137.     // Get type name for choice of this CSeqdesc object
  138.     string name = SelectionName(Which());
  139.     // Append label based on label_type
  140.     switch (label_type) {
  141.     case eBoth:
  142.         (*label) += name + ": ";
  143.     case eContent:
  144.         s_GetContentLabel(*this, label);
  145.         return;
  146.     case eType:
  147.         (*label) += name;
  148.         return;
  149.     }
  150. }
  151. END_objects_SCOPE // namespace ncbi::objects::
  152. END_NCBI_SCOPE
  153. /*
  154. * ===========================================================================
  155. *
  156. * $Log: Seqdesc.cpp,v $
  157. * Revision 1000.1  2004/06/01 19:33:22  gouriano
  158. * PRODUCTION: UPGRADED [GCC34_MSVC7] Dev-tree R6.4
  159. *
  160. * Revision 6.4  2004/05/19 17:25:14  gorelenk
  161. * Added include of PCH - ncbi_pch.hpp
  162. *
  163. * Revision 6.3  2003/03/11 15:53:25  kuznets
  164. * iterate -> ITERATE
  165. *
  166. * Revision 6.2  2002/10/03 19:09:42  clausen
  167. * Removed extra whitespace
  168. *
  169. * Revision 6.1  2002/10/03 16:50:56  clausen
  170. * Added GetLabel()
  171. *
  172. *
  173. * ===========================================================================
  174. */
  175. /* Original file checksum: lines: 64, chars: 1873, CRC32: d5933a71 */