生物技术

开发平台：
C/C++

Org_ref.cpp：源码内容
							/*
 * ===========================================================================
 * PRODUCTION $Log: Org_ref.cpp,v $
 * PRODUCTION Revision 1000.1  2004/06/01 19:34:00  gouriano
 * PRODUCTION PRODUCTION: UPGRADED [GCC34_MSVC7] Dev-tree R6.4
 * PRODUCTION
 * ===========================================================================
 */
/* $Id: Org_ref.cpp,v 1000.1 2004/06/01 19:34:00 gouriano Exp $
 * ===========================================================================
 *
 *                            PUBLIC DOMAIN NOTICE
 *               National Center for Biotechnology Information
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 *  This software/database is a "United States Government Work" under the
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 *
 *  Please cite the author in any work or product based on this material.
 *
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 *
 * Author:  .......
 *
 * File Description:
 *   .......
 *
 * Remark:
 *   This code was originally generated by application DATATOOL
 *   using specifications from the ASN data definition file
 *   'seqfeat.asn'.
 *
 * ---------------------------------------------------------------------------
 * $Log: Org_ref.cpp,v $
 * Revision 1000.1  2004/06/01 19:34:00  gouriano
 * PRODUCTION: UPGRADED [GCC34_MSVC7] Dev-tree R6.4
 *
 * Revision 6.4  2004/05/19 17:26:04  gorelenk
 * Added include of PCH - ncbi_pch.hpp
 *
 * Revision 6.3  2002/01/28 22:20:14  grichenk
 * Fixed & assignments
 *
 * Revision 6.2  2002/01/28 19:49:49  domrach
 * Get/Set tax id methods added
 *
 * Revision 6.1  2002/01/10 19:58:39  clausen
 * Added GetLabel
 *
 *
 * ===========================================================================
 */
// standard includes
// generated includes
#include <ncbi_pch.hpp>
#include <objects/seqfeat/Org_ref.hpp>
#include <objects/general/Object_id.hpp>
#include <objects/general/Dbtag.hpp>
// generated classes
BEGIN_NCBI_SCOPE
BEGIN_objects_SCOPE // namespace ncbi::objects::
// destructor
COrg_ref::~COrg_ref(void)
{
}
// Appends a label to "label" based on content
void COrg_ref::GetLabel(string* label) const
{
    if (IsSetTaxname()) {
        *label += GetTaxname();
    } else if (IsSetCommon()) {
        *label += GetCommon();
    } else if (IsSetDb()) {
        GetDb().front()->GetLabel(label);
    }
}
    
static const string s_taxonName( "taxon" );
int
COrg_ref::GetTaxId() const
{
    const TDb& lDbTags = GetDb();
 
    for(TDb::const_iterator i = lDbTags.begin();
	i != lDbTags.end();
	++i) {
	if( i->GetPointer()
	    && i->GetObject().GetDb().compare(s_taxonName) == 0 ) {
	    const CObject_id& id = i->GetObject().GetTag();
	    if( id.IsId() )
		return id.GetId();
	}
    }
    return 0;
}
int
COrg_ref::SetTaxId( int tax_id )
{
    int old_id(0);
    TDb& lDbTags = SetDb();
    // Try to update existing tax id first
    for(TDb::iterator i = lDbTags.begin();
	i != lDbTags.end();
	++i) {
	if( i->GetPointer()
	    && i->GetObject().GetDb().compare(s_taxonName) == 0 ) {
	    CObject_id& id = i->GetObject().SetTag();
	    if( id.IsId() )
		old_id = id.GetId();
	    id.SetId() = tax_id;
	    return old_id;
	}
    }
    // Add new tag
    CRef< CDbtag > ref( new CDbtag() );
    ref->SetDb( s_taxonName );
    ref->SetTag().SetId( tax_id );
    SetDb().push_back( ref );
    return old_id;
}
END_objects_SCOPE // namespace ncbi::objects::
END_NCBI_SCOPE
/* Original file checksum: lines: 61, chars: 1882, CRC32: c3300cc2 */

						