Seq_align_set.cpp
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上传日期:2007-06-13
资源大小:13604k
文件大小:3k
源码类别:

生物技术

开发平台:

C/C++

  1. /*
  2.  * ===========================================================================
  3.  * PRODUCTION $Log: Seq_align_set.cpp,v $
  4.  * PRODUCTION Revision 1000.0  2004/06/01 19:36:27  gouriano
  5.  * PRODUCTION PRODUCTION: IMPORTED [GCC34_MSVC7] Dev-tree R1.2
  6.  * PRODUCTION
  7.  * ===========================================================================
  8.  */
  9. /* $Id: Seq_align_set.cpp,v 1000.0 2004/06/01 19:36:27 gouriano Exp $
  10.  * ===========================================================================
  11.  *
  12.  *                            PUBLIC DOMAIN NOTICE
  13.  *               National Center for Biotechnology Information
  14.  *
  15.  *  This software/database is a "United States Government Work" under the
  16.  *  terms of the United States Copyright Act.  It was written as part of
  17.  *  the author's official duties as a United States Government employee and
  18.  *  thus cannot be copyrighted.  This software/database is freely available
  19.  *  to the public for use. The National Library of Medicine and the U.S.
  20.  *  Government have not placed any restriction on its use or reproduction.
  21.  *
  22.  *  Although all reasonable efforts have been taken to ensure the accuracy
  23.  *  and reliability of the software and data, the NLM and the U.S.
  24.  *  Government do not and cannot warrant the performance or results that
  25.  *  may be obtained by using this software or data. The NLM and the U.S.
  26.  *  Government disclaim all warranties, express or implied, including
  27.  *  warranties of performance, merchantability or fitness for any particular
  28.  *  purpose.
  29.  *
  30.  *  Please cite the author in any work or product based on this material.
  31.  *
  32.  * ===========================================================================
  33.  *
  34.  * Author:  .......
  35.  *
  36.  * File Description:
  37.  *   .......
  38.  *
  39.  * Remark:
  40.  *   This code was originally generated by application DATATOOL
  41.  *   using specifications from the data definition file
  42.  *   'seqalign.asn'.
  43.  */
  44. // standard includes
  45. // generated includes
  46. #include <ncbi_pch.hpp>
  47. #include <objects/seqalign/Seq_align_set.hpp>
  48. // generated classes
  49. BEGIN_NCBI_SCOPE
  50. BEGIN_objects_SCOPE // namespace ncbi::objects::
  51. // destructor
  52. CSeq_align_set::~CSeq_align_set(void)
  53. {
  54. }
  55. //-----------------------------------------------------------------------------
  56. // PRE : numbers of the rows to swap
  57. // POST: alignment rearranged with row1 where row2 used to be & vice versa
  58. void CSeq_align_set::SwapRows(TDim row1, TDim row2)
  59. {
  60.     if (!CanGet()) {
  61.         return;
  62.     }
  63.     NON_CONST_ITERATE (Tdata, saI, Set()) {
  64.         (*saI)->SwapRows(row1, row2);
  65.     }
  66. }
  67. END_objects_SCOPE // namespace ncbi::objects::
  68. END_NCBI_SCOPE
  69. /*
  70. * ===========================================================================
  71. *
  72. * $Log: Seq_align_set.cpp,v $
  73. * Revision 1000.0  2004/06/01 19:36:27  gouriano
  74. * PRODUCTION: IMPORTED [GCC34_MSVC7] Dev-tree R1.2
  75. *
  76. * Revision 1.2  2004/05/19 17:25:43  gorelenk
  77. * Added include of PCH - ncbi_pch.hpp
  78. *
  79. * Revision 1.1  2004/05/05 19:16:25  johnson
  80. * Added SwapRows method for 'disc' seq-align / seq-align-set
  81. *
  82. *
  83. * ===========================================================================
  84. */
  85. /* Original file checksum: lines: 64, chars: 1897, CRC32: 9a5a711e */