asn_sizer.cpp
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上传日期:2007-06-13
资源大小:13604k
文件大小:4k
源码类别:

生物技术

开发平台:

C/C++

  1. /*
  2.  * ===========================================================================
  3.  * PRODUCTION $Log: asn_sizer.cpp,v $
  4.  * PRODUCTION Revision 1000.2  2004/06/01 19:24:42  gouriano
  5.  * PRODUCTION PRODUCTION: UPGRADED [GCC34_MSVC7] Dev-tree R1.5
  6.  * PRODUCTION
  7.  * ===========================================================================
  8.  */
  9. /*  $Id: asn_sizer.cpp,v 1000.2 2004/06/01 19:24:42 gouriano Exp $
  10. * ===========================================================================
  11. *
  12. *                            PUBLIC DOMAIN NOTICE
  13. *               National Center for Biotechnology Information
  14. *
  15. *  This software/database is a "United States Government Work" under the
  16. *  terms of the United States Copyright Act.  It was written as part of
  17. *  the author's official duties as a United States Government employee and
  18. *  thus cannot be copyrighted.  This software/database is freely available
  19. *  to the public for use. The National Library of Medicine and the U.S.
  20. *  Government have not placed any restriction on its use or reproduction.
  21. *
  22. *  Although all reasonable efforts have been taken to ensure the accuracy
  23. *  and reliability of the software and data, the NLM and the U.S.
  24. *  Government do not and cannot warrant the performance or results that
  25. *  may be obtained by using this software or data. The NLM and the U.S.
  26. *  Government disclaim all warranties, express or implied, including
  27. *  warranties of performance, merchantability or fitness for any particular
  28. *  purpose.
  29. *
  30. *  Please cite the author in any work or product based on this material.
  31. *
  32. * ===========================================================================
  33. *
  34. * Author:  Eugene Vasilchenko
  35. *
  36. * File Description:
  37. *   Application for splitting blobs withing ID1 cache
  38. *
  39. * ===========================================================================
  40. */
  41. #include <ncbi_pch.hpp>
  42. #include <objmgr/split/asn_sizer.hpp>
  43. #include <serial/objostr.hpp>
  44. #include <objmgr/split/id2_compress.hpp>
  45. BEGIN_NCBI_SCOPE
  46. BEGIN_SCOPE(objects)
  47. CAsnSizer::CAsnSizer(void)
  48. {
  49. }
  50. CAsnSizer::~CAsnSizer(void)
  51. {
  52. }
  53. CObjectOStream& CAsnSizer::OpenDataStream(void)
  54. {
  55.     m_AsnData.clear();
  56.     m_CompressedData.clear();
  57.     m_OStream.reset();
  58.     m_MStream.reset(new CNcbiOstrstream);
  59.     m_OStream.reset(CObjectOStream::Open(eSerial_AsnBinary, *m_MStream));
  60.     return *m_OStream;
  61. }
  62. void CAsnSizer::CloseDataStream(void)
  63. {
  64.     m_OStream.reset();
  65.     size_t size = m_MStream->pcount();
  66.     const char* data = m_MStream->str();
  67.     m_MStream->freeze(false);
  68.     m_AsnData.assign(data, data+size);
  69.     m_MStream.reset();
  70. }
  71. size_t CAsnSizer::GetCompressedSize(const SSplitterParams& params)
  72. {
  73.     CId2Compressor::Compress(params, m_CompressedData,
  74.                              GetAsnData(), GetAsnSize());
  75.     return GetCompressedSize();
  76. }
  77. END_SCOPE(objects)
  78. END_NCBI_SCOPE
  79. /*
  80. * ---------------------------------------------------------------------------
  81. * $Log: asn_sizer.cpp,v $
  82. * Revision 1000.2  2004/06/01 19:24:42  gouriano
  83. * PRODUCTION: UPGRADED [GCC34_MSVC7] Dev-tree R1.5
  84. *
  85. * Revision 1.5  2004/05/21 21:42:13  gorelenk
  86. * Added PCH ncbi_pch.hpp
  87. *
  88. * Revision 1.4  2004/01/07 17:36:21  vasilche
  89. * Moved id2_split headers to include/objmgr/split.
  90. * Fixed include path to genbank.
  91. *
  92. * Revision 1.3  2003/12/30 16:06:13  vasilche
  93. * Compression methods moved to separate header: id2_compress.hpp.
  94. *
  95. * Revision 1.2  2003/11/26 23:04:56  vasilche
  96. * Removed extra semicolons after BEGIN_SCOPE and END_SCOPE.
  97. *
  98. * Revision 1.1  2003/11/12 16:18:24  vasilche
  99. * First implementation of ID2 blob splitter withing cache.
  100. *
  101. * ===========================================================================
  102. */