生物技术

开发平台：
C/C++

mm_aligner_threads.cpp：源码内容
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 * PRODUCTION $Log: mm_aligner_threads.cpp,v $
 * PRODUCTION Revision 1000.1  2004/06/01 18:04:49  gouriano
 * PRODUCTION PRODUCTION: UPGRADED [GCC34_MSVC7] Dev-tree R1.4
 * PRODUCTION
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 */
/* $Id: mm_aligner_threads.cpp,v 1000.1 2004/06/01 18:04:49 gouriano Exp $
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 *
 *                            PUBLIC DOMAIN NOTICE                          
 *               National Center for Biotechnology Information
 *                                                                          
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 * Authors:  Yuri Kapustin
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 * File Description:  CMMAligner thread classes implementation
 *                   
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#include <ncbi_pch.hpp>
#include "mm_aligner_threads.hpp"
BEGIN_NCBI_SCOPE
unsigned int g_nwmm_thread_count = 1;
DEFINE_STATIC_FAST_MUTEX(thread_count_mutex);
bool MM_RequestNewThread(const unsigned int max_threads)
{
    CFastMutexGuard guard(thread_count_mutex);
    if(g_nwmm_thread_count < max_threads) {
        ++g_nwmm_thread_count;
        return true;
    }
    else
        return false;
}
CThreadRunOnTop::CThreadRunOnTop (
    const CMMAligner* aligner, const SCoordRect* rect,
    vector<CNWAligner::TScore>* e,
    vector<CNWAligner::TScore>* f,
    vector<CNWAligner::TScore>* g,
    vector<unsigned char>* trace, bool free_corner_fgap ):
    m_aligner(aligner), m_rect(rect), m_E(e), m_F(f),
    m_G(g), m_trace(trace), m_free_corner_fgap(free_corner_fgap)
{
}
void* CThreadRunOnTop::Main()
{
    m_aligner->x_RunTop( *m_rect, *m_E, *m_F, *m_G,
                         *m_trace, m_free_corner_fgap );
 
    return 0;
}
void CThreadRunOnTop::OnExit()
{
    CFastMutexGuard guard(thread_count_mutex);
    --g_nwmm_thread_count;
}
//////////////////
CThreadDoSM::CThreadDoSM( CMMAligner* aligner, const SCoordRect* rect,
                list<CNWAligner::ETranscriptSymbol>::iterator translist_pos,
                bool free_lt_fgap, bool free_rb_fgap ):
    m_aligner(aligner), m_rect(rect),
    m_translist_pos(translist_pos),
    m_free_lt_fgap (free_lt_fgap),
    m_free_rb_fgap (free_rb_fgap)
{
}
void* CThreadDoSM::Main()
{
    m_aligner->x_DoSubmatrix( *m_rect, m_translist_pos,
                              m_free_lt_fgap, m_free_rb_fgap );
 
    return 0;
}
void CThreadDoSM::OnExit()
{
    CFastMutexGuard guard(thread_count_mutex);
    --g_nwmm_thread_count;
}
END_NCBI_SCOPE
/*
 * ===========================================================================
 * $Log: mm_aligner_threads.cpp,v $
 * Revision 1000.1  2004/06/01 18:04:49  gouriano
 * PRODUCTION: UPGRADED [GCC34_MSVC7] Dev-tree R1.4
 *
 * Revision 1.4  2004/05/21 21:41:02  gorelenk
 * Added PCH ncbi_pch.hpp
 *
 * Revision 1.3  2003/10/14 18:41:31  kapustin
 * Dismiss static keyword as a local-to-compilation-unit flag. Use longer name since unnamed namespace are not everywhere supported
 *
 * Revision 1.2  2003/09/02 22:37:52  kapustin
 * Fix id header tag
 *
 * Revision 1.1  2003/01/22 13:31:33  kapustin
 * Initial revision
 *
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