newick.h
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上传日期:2007-06-13
资源大小:13604k
文件大小:2k
源码类别:

生物技术

开发平台:

C/C++

  1. /*
  2.  * ===========================================================================
  3.  * PRODUCTION $Log: newick.h,v $
  4.  * PRODUCTION Revision 1000.0  2004/04/12 17:57:58  gouriano
  5.  * PRODUCTION PRODUCTION: IMPORTED [CATCHUP_003] Dev-tree R1.1
  6.  * PRODUCTION
  7.  * ===========================================================================
  8.  */
  9. #ifndef NEWICK_H
  10. #define NEWICK_H
  11. /*  $Id: newick.h,v 1000.0 2004/04/12 17:57:58 gouriano Exp $
  12. * ===========================================================================
  13. *
  14. *                            PUBLIC DOMAIN NOTICE
  15. *               National Center for Biotechnology Information
  16. *
  17. *  This software/database is a "United States Government Work" under the
  18. *  terms of the United States Copyright Act.  It was written as part of
  19. *  the author's official duties as a United States Government employee and
  20. *  thus cannot be copyrighted.  This software/database is freely available
  21. *  to the public for use. The National Library of Medicine and the U.S.
  22. *  Government have not placed any restriction on its use or reproduction.
  23. *
  24. *  Although all reasonable efforts have been taken to ensure the accuracy
  25. *  and reliability of the software and data, the NLM and the U.S.
  26. *  Government do not and cannot warrant the performance or results that
  27. *  may be obtained by using this software or data. The NLM and the U.S.
  28. *  Government disclaim all warranties, express or implied, including
  29. *  warranties of performance, merchantability or fitness for any particular
  30. *  purpose.
  31. *
  32. *  Please cite the author in any work or product based on this material.
  33. *
  34. * ===========================================================================
  35. *
  36. * Author:  Richard Desper
  37. *
  38. * File Description:  newick.h
  39. *
  40. *    A part of the Miminum Evolution algorithm
  41. *
  42. */
  43. #include <corelib/ncbistl.hpp>
  44. BEGIN_NCBI_SCOPE
  45. BEGIN_SCOPE(fastme)
  46. #ifndef ReadOpenParenthesis
  47. #define ReadOpenParenthesis 0
  48. #endif
  49. #ifndef INPUT_SIZE
  50. #define INPUT_SIZE 100
  51. #endif
  52. #ifndef MAX_INPUT_SIZE
  53. #define MAX_INPUT_SIZE 10000000
  54. #endif
  55. #define MAX_DIGITS 20
  56. static int nodeCount;
  57. extern int edgeCount;  /* defined in fastme.h */
  58. END_SCOPE(fastme)
  59. END_NCBI_SCOPE
  60. #endif  /*  NEWICK_H  */
  61. /*
  62.  * ===========================================================================
  63.  * $Log: newick.h,v $
  64.  * Revision 1000.0  2004/04/12 17:57:58  gouriano
  65.  * PRODUCTION: IMPORTED [CATCHUP_003] Dev-tree R1.1
  66.  *
  67.  * Revision 1.1  2004/02/10 15:16:03  jcherry
  68.  * Initial version
  69.  *
  70.  * ===========================================================================
  71.  */