生物技术

开发平台：

C/C++

blast_input.hpp：源码内容

							/*
 * ===========================================================================
 * PRODUCTION $Log: blast_input.hpp,v $
 * PRODUCTION Revision 1000.2  2004/06/01 18:06:40  gouriano
 * PRODUCTION PRODUCTION: UPGRADED [GCC34_MSVC7] Dev-tree R1.10
 * PRODUCTION
 * ===========================================================================
 */
/*  $Id: blast_input.hpp,v 1000.2 2004/06/01 18:06:40 gouriano Exp $
 * ===========================================================================
 *
 *                            PUBLIC DOMAIN NOTICE
 *               National Center for Biotechnology Information
 *
 *  This software/database is a "United States Government Work" under the
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 *
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 *  may be obtained by using this software or data. The NLM and the U.S.
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 *  purpose.
 *
 *  Please cite the author in any work or product based on this material.
 *
 * ===========================================================================
 *
 * Author:  Christiam Camacho
 *
 */
/** @file blast_input.hpp
 * Reading FASTA sequences from input file
 */
#ifndef ALGO_BLAST_API___BLAST_INPUT__HPP
#define ALGO_BLAST_API___BLAST_INPUT__HPP
#include <corelib/ncbistd.hpp>
#include <algo/blast/api/blast_aux.hpp>
BEGIN_NCBI_SCOPE
BEGIN_SCOPE(objects)
    class CObjectManager;
END_SCOPE(objects)
BEGIN_SCOPE(blast)
TSeqLocVector
BLASTGetSeqLocFromStream(CNcbiIstream& in, objects::CObjectManager& objmgr, 
                         objects::ENa_strand strand,
                         TSeqPos from, TSeqPos to, int* counter,
                         bool get_lcase_mask = FALSE);
END_SCOPE(blast)
END_NCBI_SCOPE
#endif  /* ALGO_BLAST_API___BLAST_INPUT__HPP */

						