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bmdef.h
资源名称：ncbi_cxx_win--Jul_08_2004.zip　[点击查看]
上传用户：yhdzpy8989
上传日期：2007-06-13
资源大小：13604k
文件大小：2k
源码类别：

生物技术

开发平台：

C/C++

bmdef.h：源码内容
  1. /*
  2.  * ===========================================================================
  3.  * PRODUCTION $Log: bmdef.h,v $
  4.  * PRODUCTION Revision 1000.0  2004/04/21 16:00:37  gouriano
  5.  * PRODUCTION PRODUCTION: IMPORTED [CATCHUP_003] Dev-tree R1.1
  6.  * PRODUCTION
  7.  * ===========================================================================
  8.  */
  10. // BM library internal header
  11. //
  12. // Set all required preprocessor defines
  15. #ifndef BM_ASSERT
  17. # ifndef BM_NOASSERT
  18. #  include <assert.h>
  19. #  define BM_ASSERT assert
  20. # else
  21. #  define BM_ASSERT(x)
  22. # endif
  24. #endif
  27. #define FULL_BLOCK_ADDR all_set<true>::_block._p
  28. #define IS_VALID_ADDR(addr) (addr && (addr != FULL_BLOCK_ADDR))
  29. #define IS_FULL_BLOCK(addr) (addr == FULL_BLOCK_ADDR)
  30. #define IS_EMPTY_BLOCK(addr) (addr == 0)
  32. // Macro definitions to manipulate bits in pointers
  33. // This trick is based on the fact that pointers allocated by malloc are
  34. // aligned and bit 0 is never set. It means we are safe to use it.
  35. // BM library keeps GAP flag in pointer.
  37. // Note: this hack is not universally portable so if it does not work
  38. // in some particular case disable it by defining BM_DISBALE_BIT_IN_PTR
  40. #ifdef BM_DISBALE_BIT_IN_PTR
  42. # define BMGAP_PTR(ptr)    ((bm::gap_word_t*)ptr)
  43. # define BMSET_PTRGAP(ptr) (void(0))
  44. # define BM_IS_GAP(obj, ptr, idx) ( obj.is_block_gap(idx) ) 
  46. #else
  48. # if ULONG_MAX == 0xffffffff   // 32-bit
  50. #  define BMPTR_SETBIT0(ptr)   ( ((bm::id_t)ptr) | 1 )
  51. #  define BMPTR_CLEARBIT0(ptr) ( ((bm::id_t)ptr) & ~(bm::id_t)1 )
  52. #  define BMPTR_TESTBIT0(ptr)  ( ((bm::id_t)ptr) & 1 )
  54. # else // 64-bit
  56. #  define BMPTR_SETBIT0(ptr)   ( ((bm::id64_t)ptr) | 1 )
  57. #  define BMPTR_CLEARBIT0(ptr) ( ((bm::id64_t)ptr) & ~(bm::id64_t)1 )
  58. #  define BMPTR_TESTBIT0(ptr)  ( ((bm::id64_t)ptr) & 1 )
  60. # endif
  62. # define BMGAP_PTR(ptr) ((bm::gap_word_t*)BMPTR_CLEARBIT0(ptr))
  63. # define BMSET_PTRGAP(ptr) ptr = (bm::word_t*)BMPTR_SETBIT0(ptr)
  64. # define BM_IS_GAP(obj, ptr, idx) ( BMPTR_TESTBIT0(ptr)!=0 )
  66. #endif
  70. #ifdef BM_HASRESTRICT
  71. # ifndef BMRESTRICT
  72. #  define BMRESTRICT restrict
  73. # endif
  74. #else
  75. # define BMRESTRICT 
  76. #endif
  81. #ifndef BMSSE2OPT
  83. # ifndef BM_SET_MMX_GUARD
  84. #  define BM_SET_MMX_GUARD
  85. # endif
  87. #else
  89. # ifndef BM_SET_MMX_GUARD
  90. #  define BM_SET_MMX_GUARD  sse2_empty_guard  bm_mmx_guard_;
  91. # endif
  93. #endif