生物技术

开发平台：
C/C++

sequtil.hpp：源码内容
							/*
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 * PRODUCTION $Log: sequtil.hpp,v $
 * PRODUCTION Revision 1000.1  2003/11/18 15:47:14  gouriano
 * PRODUCTION PRODUCTION: UPGRADED [ORIGINAL] Dev-tree R1.2
 * PRODUCTION
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 */
#ifndef UTIL_SEQUTIL___SEQUTIL__HPP
#define UTIL_SEQUTIL___SEQUTIL__HPP
/*  $Id: sequtil.hpp,v 1000.1 2003/11/18 15:47:14 gouriano Exp $
 * ===========================================================================
 *
 *                            PUBLIC DOMAIN NOTICE
 *               National Center for Biotechnology Information
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 *
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 *
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 *
 * Author:  Mati Shomrat
 *
 * File Description:
 *   
 */   
#include <corelib/ncbistd.hpp>
BEGIN_NCBI_SCOPE
class CSeqUtil
{
public:
    enum ECoding {
        e_not_set = 0,
        // NA coding
        e_Iupacna,
        e_Ncbi2na,
        e_Ncbi2na_expand,  // 2 bits per char
        e_Ncbi4na,
        e_Ncbi4na_expand,  // 4 bits per char (same as 8na)
        e_Ncbi8na,
        
        // AA coding
        e_Iupacaa,
        e_Ncbi8aa,
        e_Ncbieaa,
        e_Ncbistdaa
    };
    static const size_t kNumCodings;
    enum ECodingType {
        e_CodingType_Na,
        e_CodingType_Aa
    };
    // types
    typedef ECoding      TCoding;
    typedef ECodingType  TCodingType;
    static ECodingType GetCodingType(TCoding coding);
};
END_NCBI_SCOPE
#endif  /* UTIL_SEQUTIL___SEQUTIL__HPP */
 /*
* ===========================================================================
*
* $Log: sequtil.hpp,v $
* Revision 1000.1  2003/11/18 15:47:14  gouriano
* PRODUCTION: UPGRADED [ORIGINAL] Dev-tree R1.2
*
* Revision 1.2  2003/11/06 16:10:09  shomrat
* added e_not_set as a coding option
*
* Revision 1.1  2003/10/08 13:28:41  shomrat
* Initial version.
*
*
* ===========================================================================
*/

						