reader_zlib.hpp
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上传日期:2007-06-13
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文件大小:4k
源码类别:

生物技术

开发平台:

C/C++

  1. /*
  2.  * ===========================================================================
  3.  * PRODUCTION $Log: reader_zlib.hpp,v $
  4.  * PRODUCTION Revision 1000.1  2004/04/20 18:39:56  gouriano
  5.  * PRODUCTION PRODUCTION: UPGRADED [CATCHUP_003] Dev-tree R1.2
  6.  * PRODUCTION
  7.  * ===========================================================================
  8.  */
  9. #ifndef READER_ZLIB__HPP_INCLUDED
  10. #define READER_ZLIB__HPP_INCLUDED
  11. /*  $Id: reader_zlib.hpp,v 1000.1 2004/04/20 18:39:56 gouriano Exp $
  12.  * ===========================================================================
  13.  *                            PUBLIC DOMAIN NOTICE
  14.  *               National Center for Biotechnology Information
  15.  *
  16.  *  This software/database is a "United States Government Work" under the
  17.  *  terms of the United States Copyright Act.  It was written as part of
  18.  *  the author's official duties as a United States Government employee and
  19.  *  thus cannot be copyrighted.  This software/database is freely available
  20.  *  to the public for use. The National Library of Medicine and the U.S.
  21.  *  Government have not placed any restriction on its use or reproduction.
  22.  *
  23.  *  Although all reasonable efforts have been taken to ensure the accuracy
  24.  *  and reliability of the software and data, the NLM and the U.S.
  25.  *  Government do not and cannot warrant the performance or results that
  26.  *  may be obtained by using this software or data. The NLM and the U.S.
  27.  *  Government disclaim all warranties, express or implied, including
  28.  *  warranties of performance, merchantability or fitness for any particular
  29.  *  purpose.
  30.  *
  31.  *  Please cite the author in any work or product based on this material.
  32.  * ===========================================================================
  33.  *
  34.  *  Author:  Eugene Vasilchenko
  35.  *
  36.  *  File Description: byte reader with gzip decompression
  37.  *
  38.  */
  39. #include <corelib/ncbiobj.hpp>
  40. #include <util/bytesrc.hpp>
  41. #include <memory>
  42. /** @addtogroup Compression
  43.  *
  44.  * @{
  45.  */
  46. BEGIN_NCBI_SCOPE
  47. BEGIN_SCOPE(objects)
  48. class CResultZBtSrcX;
  49. class CResultZBtSrcRdr;
  50. class NCBI_XUTIL_EXPORT CNlmZipBtRdr : public CByteSourceReader
  51. {
  52. public:
  53.     CNlmZipBtRdr(CByteSourceReader* src);
  54.     ~CNlmZipBtRdr();
  55.     enum EType {
  56.         eType_unknown,
  57.         eType_plain,
  58.         eType_zlib
  59.     };
  60.     virtual size_t Read(char* buffer, size_t bufferLength);
  61.     size_t GetCompressedSize(void) const;
  62.     double GetDecompressionTime(void) const;
  63.     double GetTotalReadTime(void) const
  64.         {
  65.             return m_TotalReadTime;
  66.         }
  67. private:
  68.     CNlmZipBtRdr(const CNlmZipBtRdr&);
  69.     const CNlmZipBtRdr& operator=(const CNlmZipBtRdr&);
  70.     CRef<CByteSourceReader>  m_Src;
  71.     EType                    m_Type;
  72.     auto_ptr<CResultZBtSrcX> m_Decompressor;
  73.     double                   m_TotalReadTime;
  74. };
  75. END_SCOPE(objects)
  76. END_NCBI_SCOPE
  77. /* @} */
  78. /*
  79.  * ===========================================================================
  80.  * $Log: reader_zlib.hpp,v $
  81.  * Revision 1000.1  2004/04/20 18:39:56  gouriano
  82.  * PRODUCTION: UPGRADED [CATCHUP_003] Dev-tree R1.2
  83.  *
  84.  * Revision 1.2  2004/04/07 16:12:00  ivanov
  85.  * Cosmeic changes. Fixed header and footer.
  86.  *
  87.  * Revision 1.1  2003/12/23 17:01:32  kuznets
  88.  *  Moved from objmgr to util/compress
  89.  *
  90.  * Revision 1.5  2003/10/21 14:27:35  vasilche
  91.  * Added caching of gi -> sat,satkey,version resolution.
  92.  * SNP blobs are stored in cache in preprocessed format (platform dependent).
  93.  * Limit number of connections to GenBank servers.
  94.  * Added collection of ID1 loader statistics.
  95.  *
  96.  * Revision 1.4  2003/10/15 13:43:57  vasilche
  97.  * Removed obsolete class CResultZBtSrc.
  98.  * Some code formatting.
  99.  *
  100.  * Revision 1.3  2003/10/14 22:35:09  ucko
  101.  * Add missing declaration of CResultZBtSrcRdr::GetCompressedSize.
  102.  *
  103.  * Revision 1.2  2003/07/24 20:41:43  vasilche
  104.  * Added private constructor to make MSVC-DLL happy.
  105.  *
  106.  * Revision 1.1  2003/07/24 19:28:08  vasilche
  107.  * Implemented SNP split for ID1 loader.
  108.  *
  109.  * ===========================================================================
  110.  */ 
  111. #endif // READER_ZLIB__HPP_INCLUDED