开通博客赚积分
发布资源赚积分
分类

源码开发语言/平台
当前位置：首页 > 源码/资料 > 数值算法/人工智能 > 生物技术 > 查看源码
objostrasn.hpp
资源名称：ncbi_cxx_win--Jul_08_2004.zip　[点击查看]
上传用户：yhdzpy8989
上传日期：2007-06-13
资源大小：13604k
文件大小：13k
源码类别：

生物技术

开发平台：

C/C++

objostrasn.hpp：源码内容
  1. /*
  2.  * ===========================================================================
  3.  * PRODUCTION $Log: objostrasn.hpp,v $
  4.  * PRODUCTION Revision 1000.1  2003/12/02 20:33:24  gouriano
  5.  * PRODUCTION PRODUCTION: UPGRADED [ORIGINAL] Dev-tree R1.47
  6.  * PRODUCTION
  7.  * ===========================================================================
  8.  */
  10. #ifndef OBJOSTRASN__HPP
  11. #define OBJOSTRASN__HPP
  13. /*  $Id: objostrasn.hpp,v 1000.1 2003/12/02 20:33:24 gouriano Exp $
  14. * ===========================================================================
  15. *
  16. *                            PUBLIC DOMAIN NOTICE
  17. *               National Center for Biotechnology Information
  18. *
  19. *  This software/database is a "United States Government Work" under the
  20. *  terms of the United States Copyright Act.  It was written as part of
  21. *  the author's official duties as a United States Government employee and
  22. *  thus cannot be copyrighted.  This software/database is freely available
  23. *  to the public for use. The National Library of Medicine and the U.S.
  24. *  Government have not placed any restriction on its use or reproduction.
  25. *
  26. *  Although all reasonable efforts have been taken to ensure the accuracy
  27. *  and reliability of the software and data, the NLM and the U.S.
  28. *  Government do not and cannot warrant the performance or results that
  29. *  may be obtained by using this software or data. The NLM and the U.S.
  30. *  Government disclaim all warranties, express or implied, including
  31. *  warranties of performance, merchantability or fitness for any particular
  32. *  purpose.
  33. *
  34. *  Please cite the author in any work or product based on this material.
  35. *
  36. * ===========================================================================
  37. *
  38. * Author: Eugene Vasilchenko
  39. *
  40. * File Description:
  41. *   !!! PUT YOUR DESCRIPTION HERE !!!
  42. */
  44. #include <corelib/ncbistd.hpp>
  45. #include <serial/objostr.hpp>
  48. /** @addtogroup ObjStreamSupport
  49.  *
  50.  * @{
  51.  */
  54. BEGIN_NCBI_SCOPE
  56. class NCBI_XSERIAL_EXPORT CObjectOStreamAsn : public CObjectOStream
  57. {
  58. public:
  59.     CObjectOStreamAsn(CNcbiOstream& out,
  60.                       EFixNonPrint how = eFNP_Default);
  61.     CObjectOStreamAsn(CNcbiOstream& out,
  62.                       bool deleteOut,
  63.                       EFixNonPrint how = eFNP_Default);
  64.     virtual ~CObjectOStreamAsn(void);
  66.     virtual string GetPosition(void) const;
  68.     virtual void WriteFileHeader(TTypeInfo type);
  69.     virtual void WriteEnum(const CEnumeratedTypeValues& values,
  70.                            TEnumValueType value);
  71.     virtual void CopyEnum(const CEnumeratedTypeValues& values,
  72.                           CObjectIStream& in);
  73.     void WriteEnum(TEnumValueType value, const string& valueName);
  74.     EFixNonPrint FixNonPrint(EFixNonPrint how)
  75.         {
  76.             EFixNonPrint tmp = m_FixMethod;
  77.             m_FixMethod = how;
  78.             return tmp;
  79.         }
  81. protected:
  82.     virtual void WriteBool(bool data);
  83.     virtual void WriteChar(char data);
  84.     virtual void WriteInt4(Int4 data);
  85.     virtual void WriteUint4(Uint4 data);
  86.     virtual void WriteInt8(Int8 data);
  87.     virtual void WriteUint8(Uint8 data);
  88.     virtual void WriteFloat(float data);
  89.     virtual void WriteDouble(double data);
  90.     void WriteDouble2(double data, size_t digits);
  91.     virtual void WriteCString(const char* str);
  92.     virtual void WriteString(const string& str,
  93.                              EStringType type = eStringTypeVisible);
  94.     virtual void WriteStringStore(const string& str);
  95.     virtual void CopyString(CObjectIStream& in);
  96.     virtual void CopyStringStore(CObjectIStream& in);
  98.     virtual void WriteNullPointer(void);
  99.     virtual void WriteObjectReference(TObjectIndex index);
  100.     virtual void WriteOtherBegin(TTypeInfo typeInfo);
  101.     virtual void WriteOther(TConstObjectPtr object, TTypeInfo typeInfo);
  102.     void WriteId(const string& str);
  104.     void WriteNull(void);
  105.     virtual void WriteAnyContentObject(const CAnyContentObject& obj);
  106.     virtual void CopyAnyContentObject(CObjectIStream& in);
  108. #ifdef VIRTUAL_MID_LEVEL_IO
  109.     virtual void WriteContainer(const CContainerTypeInfo* containerType,
  110.                                 TConstObjectPtr containerPtr);
  112.     virtual void WriteClass(const CClassTypeInfo* objectType,
  113.                             TConstObjectPtr objectPtr);
  114.     virtual void WriteClassMember(const CMemberId& memberId,
  115.                                   TTypeInfo memberType,
  116.                                   TConstObjectPtr memberPtr);
  117.     virtual bool WriteClassMember(const CMemberId& memberId,
  118.                                   const CDelayBuffer& buffer);
  120.     virtual void WriteChoice(const CChoiceTypeInfo* choiceType,
  121.                              TConstObjectPtr choicePtr);
  123.     // COPY
  124.     virtual void CopyContainer(const CContainerTypeInfo* containerType,
  125.                                CObjectStreamCopier& copier);
  126.     virtual void CopyClassRandom(const CClassTypeInfo* objectType,
  127.                                  CObjectStreamCopier& copier);
  128.     virtual void CopyClassSequential(const CClassTypeInfo* objectType,
  129.                                      CObjectStreamCopier& copier);
  130.     virtual void CopyChoice(const CChoiceTypeInfo* choiceType,
  131.                             CObjectStreamCopier& copier);
  132. #endif
  133.     // low level I/O
  134.     virtual void BeginContainer(const CContainerTypeInfo* containerType);
  135.     virtual void EndContainer(void);
  136.     virtual void BeginContainerElement(TTypeInfo elementType);
  138.     virtual void BeginClass(const CClassTypeInfo* classInfo);
  139.     virtual void EndClass(void);
  140.     virtual void BeginClassMember(const CMemberId& id);
  142.     virtual void BeginChoiceVariant(const CChoiceTypeInfo* choiceType,
  143.                                     const CMemberId& id);
  145.     virtual void BeginBytes(const ByteBlock& block);
  146.     virtual void WriteBytes(const ByteBlock& block,
  147.                             const char* bytes, size_t length);
  148.     virtual void EndBytes(const ByteBlock& block);
  150.     virtual void BeginChars(const CharBlock& block);
  151.     virtual void WriteChars(const CharBlock& block,
  152.                             const char* chars, size_t length);
  153.     virtual void EndChars(const CharBlock& block);
  155.     // Write current separator to the stream
  156.     virtual void WriteSeparator(void);
  158. private:
  159.     void WriteString(const char* str, size_t length);
  160.     void WriteMemberId(const CMemberId& id);
  162.     void StartBlock(void);
  163.     void NextElement(void);
  164.     void EndBlock(void);
  166.     bool m_BlockStart;
  167.     EFixNonPrint m_FixMethod; // method of fixing non-printable chars
  168. };
  171. /* @} */
  174. //#include <serial/objostrasn.inl>
  176. END_NCBI_SCOPE
  178. #endif  /* OBJOSTRASN__HPP */
  182. /* ---------------------------------------------------------------------------
  183. * $Log: objostrasn.hpp,v $
  184. * Revision 1000.1  2003/12/02 20:33:24  gouriano
  185. * PRODUCTION: UPGRADED [ORIGINAL] Dev-tree R1.47
  186. *
  187. * Revision 1.47  2003/11/26 19:59:39  vasilche
  188. * GetPosition() and GetDataFormat() methods now are implemented
  189. * in parent classes CObjectIStream and CObjectOStream to avoid
  190. * pure virtual method call in destructors.
  191. *
  192. * Revision 1.46  2003/08/13 15:47:02  gouriano
  193. * implemented serialization of AnyContent objects
  194. *
  195. * Revision 1.45  2003/05/22 20:08:42  gouriano
  196. * added UTF8 strings
  197. *
  198. * Revision 1.44  2003/04/15 16:18:29  siyan
  199. * Added doxygen support
  200. *
  201. * Revision 1.43  2003/03/26 16:13:33  vasilche
  202. * Removed TAB symbols. Some formatting.
  203. *
  204. * Revision 1.42  2002/12/23 18:38:51  dicuccio
  205. * Added WIn32 export specifier: NCBI_XSERIAL_EXPORT.
  206. * Moved all CVS logs to the end.
  207. *
  208. * Revision 1.41  2002/10/25 14:49:29  vasilche
  209. * NCBI C Toolkit compatibility code extracted to libxcser library.
  210. * Serial streams flags names were renamed to fXxx.
  211. *
  212. * Names of flags
  213. *
  214. * Revision 1.40  2002/03/07 22:02:00  grichenk
  215. * Added "Separator" modifier for CObjectOStream
  216. *
  217. * Revision 1.39  2001/10/17 20:41:20  grichenk
  218. * Added CObjectOStream::CharBlock class
  219. *
  220. * Revision 1.38  2001/06/11 14:34:55  grichenk
  221. * Added support for numeric tags in ASN.1 specifications and data streams.
  222. *
  223. * Revision 1.37  2001/06/07 17:12:46  grichenk
  224. * Redesigned checking and substitution of non-printable characters
  225. * in VisibleString
  226. *
  227. * Revision 1.36  2001/05/17 14:59:47  lavr
  228. * Typos corrected
  229. *
  230. * Revision 1.35  2000/12/15 21:28:48  vasilche
  231. * Moved some typedefs/enums from corelib/ncbistd.hpp.
  232. * Added flags to CObjectIStream/CObjectOStream: eFlagAllowNonAsciiChars.
  233. * TByte typedef replaced by Uint1.
  234. *
  235. * Revision 1.34  2000/12/15 15:38:01  vasilche
  236. * Added support of Int8 and long double.
  237. * Enum values now have type Int4 instead of long.
  238. *
  239. * Revision 1.33  2000/10/20 15:51:27  vasilche
  240. * Fixed data error processing.
  241. * Added interface for constructing container objects directly into output stream.
  242. * object.hpp, object.inl and object.cpp were split to
  243. * objectinfo.*, objecttype.*, objectiter.* and objectio.*.
  244. *
  245. * Revision 1.32  2000/10/04 19:18:54  vasilche
  246. * Fixed processing floating point data.
  247. *
  248. * Revision 1.31  2000/09/29 16:18:14  vasilche
  249. * Fixed binary format encoding/decoding on 64 bit compulers.
  250. * Implemented CWeakMap<> for automatic cleaning map entries.
  251. * Added cleaning local hooks via CWeakMap<>.
  252. * Renamed ReadTypeName -> ReadFileHeader, ENoTypeName -> ENoFileHeader.
  253. * Added some user interface methods to CObjectIStream, CObjectOStream and
  254. * CObjectStreamCopier.
  255. *
  256. * Revision 1.30  2000/09/18 20:00:07  vasilche
  257. * Separated CVariantInfo and CMemberInfo.
  258. * Implemented copy hooks.
  259. * All hooks now are stored in CTypeInfo/CMemberInfo/CVariantInfo.
  260. * Most type specific functions now are implemented via function pointers instead of virtual functions.
  261. *
  262. * Revision 1.29  2000/09/01 13:16:01  vasilche
  263. * Implemented class/container/choice iterators.
  264. * Implemented CObjectStreamCopier for copying data without loading into memory.
  265. *
  266. * Revision 1.28  2000/08/15 19:44:41  vasilche
  267. * Added Read/Write hooks:
  268. * CReadObjectHook/CWriteObjectHook for objects of specified type.
  269. * CReadClassMemberHook/CWriteClassMemberHook for specified members.
  270. * CReadChoiceVariantHook/CWriteChoiceVariant for specified choice variants.
  271. * CReadContainerElementHook/CWriteContainerElementsHook for containers.
  272. *
  273. * Revision 1.27  2000/07/03 18:42:36  vasilche
  274. * Added interface to typeinfo via CObjectInfo and CConstObjectInfo.
  275. * Reduced header dependency.
  276. *
  277. * Revision 1.26  2000/06/16 16:31:07  vasilche
  278. * Changed implementation of choices and classes info to allow use of the same classes in generated and user written classes.
  279. *
  280. * Revision 1.25  2000/06/07 19:45:43  vasilche
  281. * Some code cleaning.
  282. * Macros renaming in more clear way.
  283. * BEGIN_NAMED_*_INFO, ADD_*_MEMBER, ADD_NAMED_*_MEMBER.
  284. *
  285. * Revision 1.24  2000/06/01 19:06:57  vasilche
  286. * Added parsing of XML data.
  287. *
  288. * Revision 1.23  2000/05/24 20:08:14  vasilche
  289. * Implemented XML dump.
  290. *
  291. * Revision 1.22  2000/04/28 16:58:03  vasilche
  292. * Added classes CByteSource and CByteSourceReader for generic reading.
  293. * Added delayed reading of choice variants.
  294. *
  295. * Revision 1.21  2000/04/13 14:50:18  vasilche
  296. * Added CObjectIStream::Open() and CObjectOStream::Open() for easier use.
  297. *
  298. * Revision 1.20  2000/04/06 16:10:51  vasilche
  299. * Fixed bug with iterators in choices.
  300. * Removed unneeded calls to ReadExternalObject/WriteExternalObject.
  301. * Added output buffering to text ASN.1 data.
  302. *
  303. * Revision 1.19  2000/01/10 20:12:37  vasilche
  304. * Fixed duplicate argument names.
  305. * Fixed conflict between template and variable name.
  306. *
  307. * Revision 1.18  2000/01/10 19:46:32  vasilche
  308. * Fixed encoding/decoding of REAL type.
  309. * Fixed encoding/decoding of StringStore.
  310. * Fixed encoding/decoding of NULL type.
  311. * Fixed error reporting.
  312. * Reduced object map (only classes).
  313. *
  314. * Revision 1.17  1999/09/24 18:19:14  vasilche
  315. * Removed dependency on NCBI toolkit.
  316. *
  317. * Revision 1.16  1999/09/23 18:56:53  vasilche
  318. * Fixed bugs with overloaded methods in objistr*.hpp & objostr*.hpp
  319. *
  320. * Revision 1.15  1999/09/22 20:11:50  vasilche
  321. * Modified for compilation on IRIX native c++ compiler.
  322. *
  323. * Revision 1.14  1999/08/13 15:53:44  vasilche
  324. * C++ analog of asntool: datatool
  325. *
  326. * Revision 1.13  1999/07/22 17:33:44  vasilche
  327. * Unified reading/writing of objects in all three formats.
  328. *
  329. * Revision 1.12  1999/07/21 14:19:59  vasilche
  330. * Added serialization of bool.
  331. *
  332. * Revision 1.11  1999/07/19 15:50:18  vasilche
  333. * Added interface to old ASN.1 routines.
  334. * Added naming of key/value in STL map.
  335. *
  336. * Revision 1.10  1999/07/14 18:58:04  vasilche
  337. * Fixed ASN.1 types/field naming.
  338. *
  339. * Revision 1.9  1999/07/09 16:32:54  vasilche
  340. * Added OCTET STRING write/read.
  341. *
  342. * Revision 1.8  1999/07/07 21:15:03  vasilche
  343. * Cleaned processing of string types (string, char*, const char*).
  344. *
  345. * Revision 1.7  1999/07/02 21:31:47  vasilche
  346. * Implemented reading from ASN.1 binary format.
  347. *
  348. * Revision 1.6  1999/07/01 17:55:20  vasilche
  349. * Implemented ASN.1 binary write.
  350. *
  351. * Revision 1.5  1999/06/30 16:04:32  vasilche
  352. * Added support for old ASN.1 structures.
  353. *
  354. * Revision 1.4  1999/06/24 14:44:41  vasilche
  355. * Added binary ASN.1 output.
  356. *
  357. * Revision 1.3  1999/06/17 20:42:02  vasilche
  358. * Fixed storing/loading of pointers.
  359. *
  360. * Revision 1.2  1999/06/16 20:35:24  vasilche
  361. * Cleaned processing of blocks of data.
  362. * Added input from ASN.1 text format.
  363. *
  364. * Revision 1.1  1999/06/15 16:20:04  vasilche
  365. * Added ASN.1 object output stream.
  366. *
  367. * Revision 1.2  1999/06/10 21:06:40  vasilche
  368. * Working binary output and almost working binary input.
  369. *
  370. * Revision 1.1  1999/06/07 19:30:18  vasilche
  371. * More bug fixes
  372. *
  373. * ===========================================================================
  374. */